| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9页 |
| 第一章 引言 | 第10-25页 |
| 1.1 微生物生态学的研究内容和方法 | 第10-16页 |
| 1.1.1 传统微生物生态学 | 第10-13页 |
| 1.1.2 现代微生物生态学 | 第13-16页 |
| 1.2 环境中微生物的细胞大小和生长速率 | 第16-24页 |
| 1.2.1 微生物的细胞大小 | 第16-19页 |
| 1.2.2 微生物的生长速率 | 第19-21页 |
| 1.2.3 微生物的细胞大小与生长速率的关系 | 第21-24页 |
| 1.3 本论文的研究方案和意义 | 第24-25页 |
| 第二章 材料和方法 | 第25-43页 |
| 2.1 样品采集和处理 | 第25-28页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第25-26页 |
| 2.1.2 样品处理 | 第26-28页 |
| 2.2 实验材料 | 第28-30页 |
| 2.2.1 主要仪器设备 | 第28页 |
| 2.2.2 主要耗材 | 第28-29页 |
| 2.2.3 主要试剂 | 第29-30页 |
| 2.3 DNA提取 | 第30-31页 |
| 2.4 RNA提取、检测和DNA的同步洗脱 | 第31-33页 |
| 2.4.1 RNA提取和DNA洗脱 | 第31页 |
| 2.4.2 RNA定量 | 第31-32页 |
| 2.4.3 RNA质量检测 | 第32页 |
| 2.4.4 RNA反转录为cDNA | 第32-33页 |
| 2.5 常规PCR与荧光定量PCR | 第33-35页 |
| 2.5.1 常规PCR | 第33-34页 |
| 2.5.2 荧光定量PCR反应体系和程序 | 第34页 |
| 2.5.3 荧光定量PCR标准曲线 | 第34-35页 |
| 2.5.4 待测样品的荧光定量PCR | 第35页 |
| 2.6 高通量数据分析 | 第35-43页 |
| 2.6.1 16S rRNA基因V4区数据分析 | 第35-38页 |
| 2.6.2 宏基因组数据分析 | 第38-43页 |
| 第三章 结果与分析 | 第43-72页 |
| 3.1 基于16S rRNA基因的粒径分级样品分析 | 第43-65页 |
| 3.1.1 四种环境样品各个粒径分级的16S rRNA基因拷贝数 | 第43页 |
| 3.1.2 分类学水平上不同粒径分级菌群的多样性差异 | 第43-48页 |
| 3.1.3 各个粒径分级的微生物群落间的beta多样性差异 | 第48页 |
| 3.1.4 各个粒径分级的微生物群落之间的NMDS分析 | 第48-52页 |
| 3.1.5 不同粒径分级样品中OTUs聚类分析 | 第52-63页 |
| 3.1.6 两次同一污水厂活性污泥样品的菌群粒径分布一致性分析 | 第63-65页 |
| 3.2 基于宏基因组的粒径分级样品分析 | 第65-72页 |
| 3.2.1 宏基因组数据基本信息 | 第65页 |
| 3.2.2 基因组基本信息 | 第65页 |
| 3.2.3 基因组的cluster-groups分析 | 第65-72页 |
| 第四章 讨论 | 第72-77页 |
| 4.1 粒径分级和微生物细胞大小聚类分析 | 第72页 |
| 4.2 微生物细胞大小与分类 | 第72-74页 |
| 4.2.1 不同细胞大小的微生物类群分布 | 第72页 |
| 4.2.2 近缘物种的微生物细胞大小 | 第72-74页 |
| 4.3 微生物细胞大小与丰度 | 第74-75页 |
| 4.4 活性污泥中不同大小微生物细胞的代谢活性和生长速率 | 第75-77页 |
| 第五章 结论、创新点和不足 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-88页 |
| 附录 | 第88-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
