| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 英文缩略语 | 第15-16页 |
| 第1章 引言 | 第16-30页 |
| 1.1 地衣概述 | 第16-18页 |
| 1.2 地衣微生物的研究现状 | 第18-23页 |
| 1.2.1 地衣微生物免培养研究 | 第18-21页 |
| 1.2.2 地衣微生物纯培养研究 | 第21-23页 |
| 1.3 地衣放线菌的研究现状 | 第23-26页 |
| 1.4 地衣放线菌代谢产物研究 | 第26-27页 |
| 1.5 地衣放线菌研究存在的问题 | 第27-28页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第28-30页 |
| 第2章 地衣免培养细菌多样性研究 | 第30-39页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-33页 |
| 2.1.1 地衣样品信息 | 第30-31页 |
| 2.1.2 地衣样品DNA的提取 | 第31页 |
| 2.1.3 16S rRNA基因V3和V4区的PCR扩增 | 第31-32页 |
| 2.1.4 Illumina MiSeq PE300上机测序 | 第32页 |
| 2.1.5 OUT聚类与系统发育分析 | 第32-33页 |
| 2.1.6 序列多样性评价 | 第33页 |
| 2.1.7 地衣细菌和地衣放线菌群落结构分析 | 第33页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第33-37页 |
| 2.2.1 地衣样品测序结果及取样深度分析 | 第33-34页 |
| 2.2.2 样本序列的多样性评价 | 第34-35页 |
| 2.2.3 地衣样品菌群多样性组成分析 | 第35-37页 |
| 2.3 本章小结 | 第37-39页 |
| 第3章 云南地衣放线菌纯培养多样性研究 | 第39-63页 |
| 3.1 地衣样品预处理方法的探索 | 第39-43页 |
| 3.1.1 材料与方法 | 第39-41页 |
| 3.1.1.1 样品采集 | 第39-40页 |
| 3.1.1.2 地衣放线菌的分离 | 第40-41页 |
| 3.1.1.3 菌落计数与纯化培养 | 第41页 |
| 3.1.2 结果与讨论 | 第41-43页 |
| 3.1.2.1 地衣放线菌的分离与计数 | 第41-43页 |
| 3.2 68份地衣放线菌选择性分离与多样性分析 | 第43-62页 |
| 3.2.1 材料与方法 | 第43-48页 |
| 3.2.1.1 地衣样品采集 | 第43页 |
| 3.2.1.2 地衣样品预处理 | 第43-45页 |
| 3.2.1.3 分离培养基 | 第45-46页 |
| 3.2.1.4 分离流程 | 第46页 |
| 3.2.1.5 放线菌菌株的初步鉴定和保藏 | 第46-47页 |
| 3.2.1.6 分离菌株基因组DNA的提取 | 第47页 |
| 3 .2.1.7 16S rRNA基因的PCR扩增与测序 | 第47-48页 |
| 3.2.1.8 基于16S rRNA基因的系统发育分析 | 第48页 |
| 3.2.2 结果与讨论 | 第48-62页 |
| 3.2.2.1 地衣放线菌的多样性分析 | 第48-56页 |
| 3.2.2.2 地衣放线菌系统发育分析 | 第56-62页 |
| 3.3 本章小结 | 第62-63页 |
| 第4章 地衣放线菌抑菌活性及生物合成潜力研究 | 第63-78页 |
| 4.1 材料与方法 | 第64-67页 |
| 4.1.1 实验菌株 | 第64页 |
| 4.1.2 抑菌活性所用的指示菌 | 第64页 |
| 4.1.3 菌株培养和发酵 | 第64页 |
| 4.1.4 地衣放线菌抑菌活性检测 | 第64-65页 |
| 4.1.5 抗生素合成功能基因的扩增 | 第65-67页 |
| 4.1.6 抗生素合成基因的克隆 | 第67页 |
| 4.1.7 最相近菌株产代谢物多样性检索 | 第67页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第67-77页 |
| 4.2.1 地衣放线菌的抗菌活性 | 第67-69页 |
| 4.2.2 地衣放线菌抗生素合成功能基因分布 | 第69-72页 |
| 4.2.3 最相近菌株代谢物多样性 | 第72-77页 |
| 4.3 本章小结 | 第77-78页 |
| 第5章 地衣放线菌Streptomyces hebeiensis次级代谢产物研究 | 第78-96页 |
| 5.1 材料与方法 | 第78-83页 |
| 5.1.1 实验菌株 | 第78-80页 |
| 5.1.2 主要实验仪器与试剂 | 第80页 |
| 5.1.3 菌株活化与小量发酵培养基 | 第80-81页 |
| 5.1.4 小量发酵与发酵液处理 | 第81页 |
| 5.1.5 扩大发酵培养基的筛选 | 第81页 |
| 5.1.6 扩大发酵 | 第81-82页 |
| 5.1.6.1 种子液制备 | 第81页 |
| 5.1.6.2 扩大发酵 | 第81-82页 |
| 5.1.6.3 发酵液萃取 | 第82页 |
| 5.1.7 菌株YIM 130410代谢产物分离 | 第82页 |
| 5.1.8 化合物的结构鉴定与解析 | 第82-83页 |
| 5.1.9 化合物的抗菌活性 | 第83页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第83-95页 |
| 5.2.1 发酵培养基的筛选 | 第83页 |
| 5.2.2 菌株YIM 130410代谢产物分离与鉴定 | 第83-84页 |
| 5.2.3 化合物波谱数据解析与理化性质 | 第84-94页 |
| 5.2.4 化合物的抗菌活性 | 第94-95页 |
| 5.3 本章小结 | 第95-96页 |
| 第6章 总结与展望 | 第96-99页 |
| 参考文献 | 第99-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 攻读博士学位期间取得的学术成果 | 第110-111页 |
| 个人简介 | 第111-112页 |
| 新化合物附图 | 第112-127页 |
