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牛肉用性状相关基因多态性检测及其关联分析

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-13页
第一章 文献综述第14-30页
    1 引言第14-15页
    2 主要肉牛品种肉用性能概述第15-18页
        2.1 安格斯牛第15-16页
        2.2 海福特牛第16页
        2.3 利木赞牛第16页
        2.4 西门塔尔牛第16-17页
        2.5 夏洛莱牛第17页
        2.6 晋南牛第17页
        2.7 鲁西牛第17-18页
        2.8 秦川牛第18页
    3 肉牛分子育种第18-20页
        3.1 我国肉牛遗传改良现状与问题第18-19页
        3.2 肉牛标记辅助选择育种的必然趋势第19-20页
    4 候选基因研究概述第20-27页
        4.1 A-FABP基因研究概述第20-23页
            4.1.1 A-FABP基因的结构与定位第20-21页
            4.1.2 A-FABP基因的生物学功能第21-22页
            4.1.3 A-FABP基因对肉用性状的影响第22-23页
        4.2 POMC基因概述第23-25页
            4.2.1 POMC基因的结构与定位第23页
            4.2.2 POMC基因的生物学功能第23-24页
            4.2.3 POMC基因对肉用性状的影响第24-25页
        4.3 UCP3基因概述第25-27页
            4.3.1 UCP3基因结构与定位第25-26页
            4.3.2 UCP3基因的生物学功能第26-27页
            4.3.3 UCP3基因对肉用性状的影响第27页
    5 与分子标记辅助选择相关的技术第27-29页
        5.1 PCR-RFLP技术的原理第28页
        5.2 PCR-SSCP技术的原理第28-29页
    6 本试验的目的及意义第29-30页
第二章 材料与方法第30-39页
    1 试验材料第30-31页
        1.1 试验物第30-31页
            1.1.1 血样第30页
            1.1.2 试验牛屠宰性状数据第30-31页
        1.2 主要仪器设备第31页
        1.3 工具酶第31页
        1.4 主要试剂及溶液的配制方法第31页
        1.5 软件工具第31页
        1.6 主要分子生物学数据库第31页
    2 试验方法第31-39页
        2.1 血液基因组DNA的提取和检测第31页
        2.2 目的片段的扩增第31-35页
            2.2.1 引物设计第31-35页
            2.2.2 PCR反应体系和条件第35页
            2.2.3 目的片段检测第35页
        2.3 单核苷酸多态性检测第35-37页
            2.3.1 制备聚丙烯酰胺凝胶(PAG)第35-36页
            2.3.2 电泳第36页
            2.3.3 银染法洗胶第36-37页
            2.3.4 测序第37页
        2.4 多态性检测第37页
            2.4.1 PCR-RFLP检测第37页
            2.4.2 PCR-SSCP检测第37页
        2.5 数据处理及分析第37-39页
            2.5.1 基因多态性和遗传信息分析第37-38页
            2.5.2 基因型效应与牛肉用性状的关联分析第38-39页
第三章 结果与分析第39-72页
    1 牛全血DNA的提取效果第39页
    2 A-FABP基因多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第39-50页
        2.1 A-FABP基因的多态性检测第39-41页
        2.2 AF-1片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第41-44页
            2.2.1 AF-1片段的PCR-SSCP检测第41页
            2.2.2 AF-1片段的等位基因频率和基因型频率第41-42页
            2.2.3 AF-1片段的群体遗传特征第42-43页
            2.2.4 A-FABP基因A2989G多态性与肉用性状的关联分析第43-44页
        2.3 AF-2片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第44-47页
            2.3.1 AF-2片段的PCR-RFLP检测第44-45页
            2.3.2 AF-2片段的等位基因频率和基因型频率第45-46页
            2.3.3 AF-2片段的群体遗传特征第46页
            2.3.4 A-FABP基因A3533T多态性与肉用性状的关联分析第46-47页
        2.4 AF-3片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第47-50页
            2.4.1 AF-3片段的PCR-SSCP检测第47-48页
            2.4.2 AF-3片段的等位基因频率和基因型频率第48-49页
            2.4.3 AF-3片段的群体遗传特征第49页
            2.4.4 A-FABP基因T4014C多态性与肉用性状的关联分析第49-50页
    3 POMC基因多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第50-61页
        3.1 POMC基因的多态性检测第50-52页
        3.2 PO-1片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第52-55页
            3.2.1 PO-1片段的PCR-RFLP检测第52-53页
            3.2.2 PO-1片段的等位基因频率和基因型频率第53-54页
            3.2.3 PO-1片段的群体遗传特征第54页
            3.2.4 POMC基因T5141C多态性与肉用性状的关联分析第54-55页
        3.3 PO-2片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第55-58页
            3.3.1 PO-2片段的PCR-RFLP检测第55-56页
            3.3.2 PO-2片段的等位基因频率和基因型频率第56-57页
            3.3.3 PO-2片段的群体遗传特征第57页
            3.3.4 POMC基因G5785C多态性与肉用性状的关联分析第57-58页
        3.4 PO-3片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第58-61页
            3.4.1 PO-3片段的PCR-RFLP检测第58-59页
            3.2.2 PO-3片段的等位基因频率和基因型频率第59-60页
            3.2.3 PO-3片段的群体遗传特征第60页
            3.2.4 POMC基因C6621G多态性与肉用性状的关联分析第60-61页
    4 UCP3基因多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第61-72页
        4.1 UCP3基因的多态性检测第61-63页
        4.2 UC-1片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第63-65页
            4.2.1 UC-1片段的PCR-RFLP检测第63页
            4.2.2 UC-1片段的等位基因频率和基因型频率第63-64页
            4.2.3 UC-1片段的群体遗传特征第64-65页
            4.2.4 UCP3基因G4912A多态性与肉用性状的关联分析第65页
        4.3 UC-2片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第65-68页
            4.3.1 UC-2片段的PCR-SSCP检测第65-66页
            4.3.2 UC-2片段的等位基因频率和基因型频率第66-67页
            4.3.3 UC-2片段的群体遗传特征第67-68页
            4.3.4 UCP3基因C4524T多态性与肉用性状的关联分析第68页
        4.4 UC-3片段多态性检测及与牛肉用性状的关联分析第68-72页
            4.4.1 UC-3片段的PCR-SSCP检测第68-69页
            4.4.2 UC-3片段的等位基因频率和基因型频率第69-70页
            4.4.3 UC-3片段的群体遗传特征第70页
            4.4.4 UCP3基因A5191G多态性与肉用性状的关联分析第70-72页
第四章 讨论第72-79页
    1 A-FABP基因第72-74页
        1.1 关于A-FABP基因的多态性第72-73页
        1.2 关于A-FABP基因多态性对肉用性状的影响第73-74页
    2 POMC基因第74-76页
        2.1 关于POMC基因的多态性第74-75页
        2.2 关于POMC基因多态性对肉用性状的影响第75-76页
    3 UCP3基因第76-79页
        3.1 关于UCP3基因的多态性第76-77页
        3.2 关于UCP3基因多态性对肉用性状的影响第77-79页
第五章 结论第79-82页
    1 主要研究结果第79-80页
    2 创新点第80-81页
    3 值得进一步研究的问题第81-82页
参考文献第82-90页
附录第90-97页
    附录一 实验用主要仪器设备第90-91页
    附录二 主要试剂及溶液配制第91-93页
    附录三 血液基因组DNA的提取和检测步骤第93-95页
    附录四 基因频率和多态信息计算第95-97页
缩略词第97-98页
致谢第98页

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