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甘蓝型油菜自交不亲和反应候选基因的功能研究及挖掘

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略语表第12-13页
1 文献综述第13-34页
    1.1 自交不亲和性概述第13-14页
    1.2 芸薹属植物自交不亲和反应分子机制第14-21页
        1.2.1 自交不亲和反应识别基因的鉴定第14-16页
        1.2.2 S单倍型间的显隐性关系第16-17页
        1.2.3 芸薹属植物自交不亲和分子机制第17-19页
        1.2.4 甘蓝型油菜自交亲和性机理的研究第19-21页
    1.3 拟南芥属植物自交亲和的分子机制第21-23页
    1.4 十字花科植物柱头-花粉识别过程研究第23-26页
    1.5 组学技术在自交不亲和分子机理研究中的应用第26-28页
    1.6 自交不亲和性在甘蓝型油菜育种中的研究和应用第28-32页
        1.6.1 自交不亲和性在甘蓝型油菜杂种优势利用中的应用第28-29页
        1.6.2 顺式抑制现象及其在育种中的潜在应用价值第29-32页
    1.7 研究目的与意义第32-34页
2 材料与方法第34-52页
    2.1 实验材料第34页
        2.1.1 植物材料第34页
        2.1.2 载体和菌株第34页
    2.2 实验方法第34-50页
        2.2.1 DNA提取第34-35页
        2.2.2 DNA片段克隆及PCR产物回收第35页
        2.2.3 感受态细胞制备及转化第35-37页
        2.2.4 载体构建第37-39页
        2.2.5 农杆菌介导的遗传转化第39-40页
        2.2.6 植物总RNA的提取第40-42页
        2.2.7 RT-PCR与qRT-PCR第42-43页
        2.2.8 自交不亲和表型鉴定第43-44页
        2.2.9 GUS染色分析第44-45页
        2.2.10 酵母双杂交分析第45-46页
        2.2.11 亚细胞定位第46-50页
    2.3 转录组测序第50页
        2.3.1 cDNA文库构建和Solexa/Illumina测序第50页
        2.3.2 RNA-seq数据处理第50页
        2.3.3 DEGs(差异表达基因)的分析与注释第50页
    2.4 序列及进化树分析第50-52页
3 结果第52-87页
    3.1 CIMS1是自交不亲和反应的正调控因子第52-61页
        3.1.1 自交不亲和反应候选基因的确定第52页
        3.1.2 十字花科植物中CIMS的共线性分析第52-54页
        3.1.3 CIMS1/CIMS2基因的时空表达第54-55页
        3.1.4 RNAi骨架载体的构建第55-56页
        3.1.5 下调BnCIMS1的表达可部分打破Westar的自交不亲和性第56-59页
        3.1.6 BnCIMS1的亚细胞定位第59页
        3.1.7 Y2H分析BnCIMS1与BnSRK-1或BnARC1的互作第59-61页
    3.2 AtCIMS1在拟南芥自交不亲和反应中功能保守性研究第61-67页
        3.2.1 AtCIMS1和AtCIMS2基因的时空表达第61页
        3.2.2 转基因自交不亲和拟南芥的创建第61-65页
        3.2.3 CIMS1在拟南芥自交不亲和反应中具保守功能第65-67页
    3.3 生物素羧化酶基因(BC)参与调控叶片发育第67-73页
        3.3.1 下调BnBC的表达导致甘蓝型油菜叶片发育异常第67-70页
        3.3.2 SLR1启动子表达部位特异性分析第70页
        3.3.3 下调AtBC的表达影响拟南芥叶片发育及花粉粘附第70-73页
    3.4 其它候选基因的功能研究第73-76页
    3.5 转录组分析亲和/不亲和反应基因表达的时相变化第76-87页
        3.5.1 转录组比较分析亲和/不亲和反应第76-78页
        3.5.2 差异表达基因的注释第78-83页
        3.5.3 所有样品中富集表达的基因第83-86页
        3.5.4 转录组数据的验证第86-87页
4 讨论第87-99页
    4.1 CIMS1是自交不亲和反应的正调控因子第87-89页
    4.2 拟南芥自交不亲和性的重建第89-90页
    4.3 SLR1启动子的特异性第90-91页
    4.4 生物素羧化酶与脂肪酸合成第91-92页
    4.5 转录组分析花粉-柱头互作特征第92-94页
    4.6 花粉-柱头互作与病原菌-植物互作的相似性第94-96页
    4.7 柱头中的SAM循环第96页
    4.8 总结与展望第96-99页
参考文献第99-121页
附录Ⅰ第121-122页
附录Ⅱ第122-123页
附录Ⅲ 作者简介及论文发表情况第123-124页
致谢第124-126页

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