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粪类圆线虫RIOK-2蛋白激酶编码基因的结构与功能研究

中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
缩略语表第12-13页
1 文献综述第13-24页
    1.1 粪类圆线虫第13-16页
        1.1.1 粪类圆线虫概述第13页
        1.1.2 粪类圆线虫的生活史第13-14页
        1.1.3 粪类圆线虫的流行病学第14-15页
        1.1.4 粪类圆线虫的发病机理及临床表现第15页
        1.1.5 粪类圆线虫的诊断与治疗第15-16页
    1.2 秀丽隐杆线虫第16-19页
        1.2.1 秀丽隐杆线虫概述第16-17页
        1.2.2 秀丽隐杆线虫的生殖细胞发育第17-18页
        1.2.3 秀丽隐杆线虫的阴门发育过程第18-19页
    1.3 RIOK-2蛋白激酶的研究进展第19-20页
    1.4 线虫中重要的基因功能研究方法第20-24页
        1.4.1 转基因技术在线虫中的应用第20-22页
        1.4.2 RNAi技术在线虫中的应用第22-24页
2 研究的目的与意义第24-25页
3 材料与方法第25-51页
    3.1 试验材料第25-28页
        3.1.1 实验动物及实验用菌株第25页
        3.1.2 菌种与质粒第25页
        3.1.3 主要试剂第25-26页
        3.1.4 主要仪器第26页
        3.1.5 主要试剂的配制第26-28页
            3.1.5.1 抗生素与培养基的配制第26-27页
            3.1.5.2 碱裂解法质粒提取缓冲液的配制第27页
            3.1.5.3 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)缓冲液第27-28页
            3.1.5.4 Western blot缓冲液第28页
            3.1.5.5 线虫收集用缓冲液第28页
            3.1.5.6 DAPI溶液的配制第28页
    3.2 试验方法第28-51页
        3.2.1 粪类圆线虫各阶段虫体的收集及保种第28-29页
        3.2.2 引物的设计与合成第29-30页
        3.2.3 粪类圆线虫DNA的提取第30页
        3.2.4 粪类圆线虫RNA的提取第30-31页
        3.2.5 粪类圆线虫Ss-riok-2基因全长cDNA序列的获得第31-35页
            3.2.5.1 粪类圆线虫Ss-riok-2基因全长cDNA序列的扩增第31-32页
            3.2.5.2 PCR产物的凝胶检测第32页
            3.2.5.3 PCR产物的凝胶纯化回收第32-33页
            3.2.5.4 目的DNA连接pMD19-T载体第33页
            3.2.5.5 大肠杆菌感受态细胞的制备第33-34页
            3.2.5.6 连接产物的转化第34页
            3.2.5.7 菌液PCR鉴定第34-35页
        3.2.6 粪类圆线虫Ss-riok-2基因全长gDNA序列的获得第35页
        3.2.7 生物信息学分析第35-36页
        3.2.8 粪类圆线虫Ss-RIOK-2重组蛋白原核表达质粒的构建第36-38页
        3.2.9 粪类圆线虫Ss-RIOK-2重组蛋白的原核表达第38页
        3.2.10 粪类圆线虫Ss-RIOK-2重组蛋白的SDS-PAGE检测第38页
        3.2.11 粪类圆线虫Ss-RIOK-2重组蛋白的大量表达与纯化第38-40页
        3.2.12 粪类圆线虫Ss-RIOK-2重组蛋白的Western-Blot分析第40页
        3.2.13 粪类圆线虫Ss-RIOK-2重组蛋白的自我磷酸化分析第40-41页
        3.2.14 秀丽隐杆线虫和粪类圆线虫转基因质粒的构建第41-44页
            3.2.14.1 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因启动子序列的获得第41-42页
            3.2.14.2 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因cDNA序列的获得第42页
            3.2.14.3 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因过表达转基因质粒的构建第42-43页
            3.2.14.4 粪类圆线虫Ss-riok-2基因启动子序列的获得第43-44页
        3.2.15 秀丽隐杆线虫和粪类圆线虫的转基因实验第44-46页
            3.2.15.1 转基因实验方法第44-45页
            3.2.15.2 转基因后代的观察第45-46页
        3.2.16 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的RNAi实验第46-48页
            3.2.16.1 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因RNAi质粒的构建第46-47页
            3.2.16.2 秀丽隐杆线虫的同步化处理第47-48页
            3.2.16.3 饲喂法进行秀丽隐杆线虫RNAi实验第48页
        3.2.17 秀丽隐杆线虫性腺分离及DAPI染色第48-49页
        3.2.18 Reverse transcription (RT)-PCR第49页
        3.2.19 荧光定量PCR第49-50页
        3.2.20 统计学分析第50-51页
4 结果与分析第51-74页
    4.1 粪类圆线虫各个时期虫体的形态学观察第51-52页
    4.2 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的cDNA序列获得第52-53页
    4.3 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的gDNA序列获得第53页
    4.4 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的生物信息学分析第53-56页
        4.4.1 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的基因结构分析第53-54页
        4.4.2 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的氨基酸比对分析第54-55页
        4.4.3 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白的氨基酸进化树分析第55-56页
    4.5 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白的蛋白结构分析第56-59页
    4.6 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白的原核表达与纯化第59-60页
        4.6.1 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白的原核表达质粒构建第59页
        4.6.2 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白的原核表达第59-60页
    4.7 粪类圆线虫Ss-RIOK-2自我磷酸化作用第60-61页
    4.8 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的转录组分析第61-62页
    4.9 粪类圆线虫和秀丽隐杆线虫的转基因实验第62-66页
        4.9.1 粪类圆线虫的Ss-riok-2基因启动子序列的获得第62-63页
        4.9.2 秀丽隐杆线虫的Ce-riok-2基因启动子序列的获得第63页
        4.9.3 粪类圆线虫Ss-riok-2基因和秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的启动子序列比对分析第63-65页
        4.9.4 粪类圆线虫和秀丽隐杆线虫转基因质粒的构建第65-66页
    4.10 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的表达谱第66-67页
    4.11 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的表达谱第67-68页
    4.12 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的过表达第68-69页
    4.13 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因在性腺组织中转录第69-70页
    4.14 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的RNAi实验第70-74页
        4.14.1 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的RNAi实验的质粒构建第70-71页
        4.14.2 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的沉默导致幼虫生长发育缓慢第71页
        4.14.3 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的沉默导致成虫不育、阴门突出第71-72页
        4.14.4 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的沉默导致性腺细胞数量减少和细胞大小紊乱第72-73页
        4.14.5 秀丽隐杆线虫Ce-riok-2基因的沉默导致秀丽隐杆线虫Ce-vit-2基因转录水平上调第73-74页
5.讨论第74-81页
    5.1 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白激酶的序列特征分析第74-75页
    5.2 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白激酶编码基因Ss-riok-2的基因组结构分析第75-76页
    5.3 粪类圆线虫Ss-riok-2基因的转录组分析第76-77页
    5.4 粪类圆线虫Ss-RIOK-2蛋白的表达分析第77页
    5.5 秀丽隐杆线虫Ce-RIOK-2蛋白的表达分析第77-78页
    5.6 Ce-RIOK-2蛋白在秀丽隐杆线虫生殖系统中的作用第78-81页
总结第81-82页
参考文献第82-96页
附录1第96-99页
附录2第99-101页
致谢第101-102页

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