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牛分枝杆菌感染THP-1细胞蛋白质组学分析及PMN在宿主应答其感染过程中的功能探索

摘要第8-11页
Abstract第11-13页
缩略词表(Abbreviation)第14-17页
第1章 文献综述第17-40页
    1.1 结核病概述第17-24页
        1.1.1 病原学第18-20页
        1.1.2 流行病学第20-21页
        1.1.3 诊断及病原鉴定第21-23页
        1.1.4 预防及治疗第23-24页
    1.2 结核分枝杆菌的感染与免疫第24-33页
        1.2.1 肺生理结构与结核病第25-26页
        1.2.2 结核分枝杆菌的生命周期第26-27页
        1.2.3 免疫调节与炎症反应第27-30页
        1.2.4 散播性卡介苗第30页
        1.2.5 结核分枝杆菌小鼠模型第30-33页
    1.3 TREM1研究进展第33-38页
        1.3.1 TREM1调节炎症反应的机制第34-36页
        1.3.2 sTREM1在传染性急性炎症疾病中的诊断前景第36-37页
        1.3.3 TREM1在非传染性炎症疾病及癌症中的治疗前景第37-38页
    1.4 立题依据第38-40页
第2章 强弱毒株感染人巨噬细胞差异蛋白质组学分析第40-75页
    2.1 前言第40-42页
    2.2 实验材料第42-47页
        2.2.1 菌株及细胞第42页
        2.2.2 主要试剂及试剂盒第42-43页
        2.2.3 培养基及主要溶液的配制第43-44页
        2.2.4 主要实验器材第44-45页
        2.2.5 引物第45-47页
    2.3 实验方法第47-60页
        2.3.1 菌株的活化及扩大培养第47页
        2.3.2 细胞的复苏、传代及诱导分化第47-48页
        2.3.3 结核分枝杆菌感染细胞第48页
        2.3.4 细胞蛋白样品的制备及定量第48-49页
        2.3.5 蛋白质的消化第49页
        2.3.6 肽段的标记第49-50页
        2.3.7 HPLC(强阳离子交换色谱)分析第50-51页
        2.3.8 肽段的纯化(C18反相色谱除盐)第51-52页
        2.3.9 质谱检测第52-53页
        2.3.10 蛋白质定性与定量分析流程第53-54页
        2.3.11 生物信息学分析第54-57页
        2.3.12 细胞总RNA的提取及实时相对定量PCR第57-58页
        2.3.13 SDS-PAGE检测第58-59页
        2.3.14 统计学分析第59-60页
    2.4 结果与分析第60-71页
        2.4.1 蛋白基本鉴定信息第60-62页
        2.4.2 差异蛋白的筛选第62-63页
        2.4.3 差异蛋白的GO分类第63-64页
        2.4.4 差异蛋白IPA分析第64-68页
        2.4.5 差异蛋白STRING分析第68-69页
        2.4.6 Real-timePCR检测结果第69-71页
    2.5 讨论第71-74页
        2.5.1 BCG感染THP-1差异蛋白质组对比分析第71页
        2.5.2 强毒株感染细胞样品差异蛋白组对比分析第71-72页
        2.5.3 牛源强毒株M.bovis感染细胞样品特有的差异蛋白质第72-73页
        2.5.4 细胞因子差异分析第73-74页
    2.6 小结与展望第74-75页
第3章 PMN在宿主应答BCG感染过程中的功能探索第75-121页
    3.1 前言第75-77页
    3.2 实验材料第77-80页
        3.2.1 菌株第77页
        3.2.2 试验小鼠第77页
        3.2.3 主要试剂及试剂盒第77-79页
        3.2.4 主要溶液的配制第79页
        3.2.5 主要实验器材第79-80页
    3.3 实验方法第80-92页
        3.3.1 道德声明第80页
        3.3.2 菌株的活化及扩大培养第80页
        3.3.3 小鼠感染模型第80-82页
        3.3.4 组织细胞的分离第82-85页
        3.3.5 流式细胞分析第85-89页
        3.3.6 小鼠组织切片的检测第89-91页
        3.3.7 统计学分析第91-92页
    3.4 结果与分析第92-116页
        3.4.1 C57BL/6小鼠经呼吸道感染BCG第92-103页
        3.4.2 TREM1?/?小鼠经呼吸道感染BCG初步探究第103-105页
        3.4.3 TREM1?/?小鼠经尾静脉注射感染BCG第105-109页
        3.4.4 TREM1?/?小鼠经尾静脉注射感染H37Rv初步研究第109-114页
        3.4.5 Ly6g标记的PMN免疫组化结果第114-116页
    3.5 讨论第116-120页
        3.5.1 经呼吸道感染C57BL/6小鼠通过PMN杀伤BCG第116-117页
        3.5.2 不同的感染途径TREM1?/?小鼠反应不同第117-118页
        3.5.3 地塞米松处理能够延长TREM1?/?感染小鼠的存活时间第118-120页
    3.6 小结与展望第120-121页
第4章 H37RvΔphoPΔRv1759cΔLprG基因缺失菌株的构建第121-149页
    4.1 前言第121-123页
    4.2 实验材料第123-126页
        4.2.1 菌株、质粒载体及细胞第123页
        4.2.2 试验小鼠第123页
        4.2.3 主要试剂及试剂盒第123-124页
        4.2.4 主要溶液的配制第124-125页
        4.2.5 主要实验器材第125页
        4.2.6 引物第125-126页
    4.3 实验方法第126-137页
        4.3.1 菌株的活化及扩大培养第126页
        4.3.2 基因组DNA的提取第126-127页
        4.3.3 分枝杆菌基因敲除方法第127-132页
        4.3.4 基因缺失株的鉴定第132-133页
        4.3.5 基因缺失株的sacB-hyg标签消除第133-134页
        4.3.6 细胞的复苏、传代及诱导分化第134-135页
        4.3.7 生长特性的研究第135页
        4.3.8 THP-1细胞入侵实验和胞内存活实验第135页
        4.3.9 小鼠感染试验第135-136页
        4.3.10 统计学分析第136-137页
    4.4 结果与分析第137-146页
        4.4.1 基因缺失菌株的鉴定第137-138页
        4.4.2 基因缺失株的sacB-hyg标签消除第138-139页
        4.4.3 菌落形态的比较第139-141页
        4.4.4 THP-1细胞入侵实验和胞内存活实验第141-142页
        4.4.5 小鼠感染试验第142-146页
    4.5 讨论第146-148页
        4.5.1 结核分枝杆菌基因缺失方法的探讨第146页
        4.5.2 结核分枝杆菌细胞壁与菌落形态第146-147页
        4.5.3 结核分枝杆菌感染与IL-1β第147-148页
    4.6 小结与展望第148-149页
结论第149-150页
参考文献第150-180页
附录第180-183页
个人简历第183-184页
致谢第184-186页

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