| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| ABBREVIATIONS | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| 1.1 猪繁殖与呼吸综合征及其免疫遗传学研究进展 | 第11-17页 |
| 1.1.1 猪繁殖与呼吸综合征对现代养猪业的危害 | 第11页 |
| 1.1.2 猪繁殖与呼吸综合征的发病机理 | 第11-14页 |
| 1.1.3 猪繁殖与呼吸综合征病毒感染的抗体依赖性增强(ADE)作用 | 第14-15页 |
| 1.1.4 猪繁殖与呼吸综合征抗性的遗传研究进展 | 第15-16页 |
| 1.1.5 猪繁殖与呼吸综合征免疫遗传学的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2 表观遗传学研究进展 | 第17-25页 |
| 1.2.1 表观遗传学及其作用 | 第17-18页 |
| 1.2.2 DNA甲基化 | 第18-21页 |
| 1.2.3 DNA甲基化的研究方法 | 第21-24页 |
| 1.2.4 疫苗免疫应答的DNA甲基化调控研究进展 | 第24-25页 |
| 1.3 外周血单核细胞(PBMCs) | 第25页 |
| 1.4 猪PRRS宿主转录组学研究进展 | 第25-27页 |
| 1.4.1 RNA-seq技术 | 第25-26页 |
| 1.4.2 RNA-seq在猪转录组学研究中的应用 | 第26页 |
| 1.4.3 猪繁殖与呼吸综合征宿主转录组学的研究进展 | 第26-27页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 妊娠母猪PRRS活毒疫苗免疫后PBMCS转录组研究 | 第29-50页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-37页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第30-31页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第31-37页 |
| 2.2 结果与分析 | 第37-47页 |
| 2.2.1 妊娠母猪PRRSV抗体水平的变异 | 第37-38页 |
| 2.2.2 长白妊娠母猪PRRSV抗体高、中、低水平个体间差异情况 | 第38-39页 |
| 2.2.3 PBMCs总RNA的质检结果 | 第39-40页 |
| 2.2.4 妊娠母猪PRRSV抗体高、中、低水平个体间PBMCs转录组分析 | 第40-47页 |
| 2.2.5 RT-qPCR验证转录组测序结果 | 第47页 |
| 2.3 讨论 | 第47-48页 |
| 2.4 小结 | 第48-50页 |
| 第三章 仔猪PRRSV不同抗体水平的PBMCS转录组测序与全基因组DNA甲基化调控研究 | 第50-70页 |
| 3.1 材料与方法 | 第51-56页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第51-52页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第52-56页 |
| 3.2 结果与分析 | 第56-68页 |
| 3.2.1 仔猪PRRSV抗体水平的变化 | 第56页 |
| 3.2.2 仔猪PRRSV高、低抗体水平间差异情况 | 第56-57页 |
| 3.2.3 总RNA的质检结果 | 第57-58页 |
| 3.2.4 仔猪PBMCs转录组分析 | 第58-62页 |
| 3.2.5 RT-qPCR验证转录组测序结果 | 第62页 |
| 3.2.6 DNA提取结果 | 第62-63页 |
| 3.2.7 PBMCs的DNA甲基化测序数据统计 | 第63页 |
| 3.2.8 全基因组DNA甲基化水平分析 | 第63-67页 |
| 3.2.9 差异甲基化区域相关差异基因的分析 | 第67页 |
| 3.2.10 差异甲基化差异表达分析 | 第67-68页 |
| 3.3 讨论 | 第68-69页 |
| 3.3.1 仔猪PRRSV抗体变化规律 | 第68页 |
| 3.3.2 仔猪不同抗体应答水平相关免疫基因差异表达 | 第68页 |
| 3.3.3 仔猪不同抗体应答水平相关差异甲基化调控基因 | 第68-69页 |
| 3.4 小结 | 第69-70页 |
| 第四章 两代猪PRRSV免疫后PBMCS转录组对比分析 | 第70-74页 |
| 4.1 两代猪PRRSV免疫后PBMCs转录组测序结果同质性分析 | 第70-72页 |
| 4.2 两代猪PRRSV免疫后相同免疫相关基因的活体验证 | 第72页 |
| 4.3 讨论 | 第72-73页 |
| 4.4 小结 | 第73-74页 |
| 第五章 总结 | 第74-75页 |
| 5.1 主要结论 | 第74页 |
| 5.2 创新点 | 第74页 |
| 5.3 下一步研究工作 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
| 附录 | 第85-98页 |
| 作者简介 | 第98-99页 |
