基于高通量测序半夏变异珠芽转录组研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 缩略语 | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 半夏的研究状况 | 第11-14页 |
| 1.1.1 半夏简介 | 第11-12页 |
| 1.1.2 半夏的化学成分 | 第12页 |
| 1.1.3 半夏药用价值 | 第12-13页 |
| 1.1.4 半夏珠芽 | 第13-14页 |
| 1.2 转录组的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.2.1 转录组简介 | 第14页 |
| 1.2.2 高通量测序技术 | 第14-16页 |
| 1.3 研究背景、目的及意义 | 第16-17页 |
| 1.3.1 研究背景 | 第16页 |
| 1.3.2 研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-20页 |
| 2.1 实验材料 | 第17页 |
| 2.2 实验试剂及仪器 | 第17页 |
| 2.3 试验方法 | 第17页 |
| 2.4 CDNA文库的建立及测序 | 第17-18页 |
| 2.5 转录组数据组装 | 第18页 |
| 2.6 转录组数据分析 | 第18-20页 |
| 第三章 结果与分析 | 第20-51页 |
| 3.1 FASTQC测序数据质量控制 | 第20-26页 |
| 3.2 基因功能注释 | 第26-27页 |
| 3.3 GO注释分类 | 第27-31页 |
| 3.4 KEGG分类 | 第31-36页 |
| 3.5 COG分类 | 第36-42页 |
| 3.6 CDS预测 | 第42页 |
| 3.7 基因表达水平的分析: | 第42-45页 |
| 3.8 SNP分析 | 第45-46页 |
| 3.9 SSR分析 | 第46-51页 |
| 第四章 差异表达基因的筛选 | 第51-68页 |
| 4.1 差异表达基因的筛选 | 第51-54页 |
| 4.2 差异基因GO富集性分析 | 第54-57页 |
| 4.3 差异基因KEGG富集性分析 | 第57-67页 |
| 4.4 KEGG富集性差异基因整合表达模式 | 第67-68页 |
| 第五章 结论与讨论 | 第68-72页 |
| 5.1 结论 | 第68-69页 |
| 5.2 讨论 | 第69-71页 |
| 5.3 创新性 | 第71页 |
| 5.4 展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
