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基于线粒体基因组的膜翅目茧蜂科(Hymenoptera:Braconidae)比较基因组学与系统发育研究

致谢第10-12页
摘要第12-15页
Abstract第15-17页
缩写与术语表第18-19页
第一章 文献综述第19-39页
    1.1 线粒体基因组学第19-21页
        1.1.1 线粒体起源第19-20页
        1.1.2 线粒体基因组学第20-21页
    1.2 线粒体基因组基本特征第21-24页
        1.2.1 线粒体基因组形态特征第21页
        1.2.2 线粒体基因组进化第21-22页
        1.2.3 线粒体基因组的分子标记第22-24页
    1.3 线粒体基因组在昆虫系统发育研究中的应用第24-28页
        1.3.1 昆虫线粒体基因组测序进展第24页
        1.3.2 昆虫线粒体基因组结构第24-26页
        1.3.3 昆虫线粒体基因组重排及机理第26-28页
    1.4 基于线粒体基因组的昆虫系统发育研究第28-34页
        1.4.1 系统发育研究方法第28-31页
        1.4.2 基于线粒体基因组的昆虫系统发育研究第31-34页
    1.5 茧蜂科系统发育研究第34-39页
        1.5.1 茧蜂科分类地位第34-35页
        1.5.2 茧蜂科分类背景第35-39页
第二章 基本材料与方法第39-46页
    2.1 技术路线第39页
    2.2 标本的收集第39-40页
    2.3 主要仪器与试剂第40-42页
        2.3.1 主要试剂第40-41页
        2.3.2 主要仪器第41-42页
    2.4 试验和分析方法第42-46页
        2.4.1 线粒体基因组测序第42-44页
        2.4.2 线粒体基因组注释第44页
        2.4.3 比较基因组学分析第44页
        2.4.4 系统发育分析第44-45页
        2.4.5 分化时间推断第45-46页
第三章 茧蜂科线粒体基因组基本特征第46-138页
    3.1 齿腹茧蜂Acanthormius sp.线粒体基因组基本特征第49-53页
    3.2 灰毛非卡茧蜂Afrocampsis griseosetosus线粒体基因组特征第53-57页
    3.3 头高腹茧蜂Capitonius sp.线粒体基因组特征第57-61页
    3.4 纵卷叶螟黑折脉茧蜂Cardiochiles fuscipennis线粒体基因组特征第61-65页
    3.5 扁体茧蜂Elasmosoma sp.线粒体基因组特征第65-69页
    3.6 额突茧蜂Eumacrocentrus sp.线粒体基因组特征第69-73页
    3.7 短管马尾茧蜂Euurobracon breviterebrae线粒体基因组特征第73-77页
    3.8 厚腿茧蜂Histeromerus sp.线粒体基因组特征第77-81页
    3.9 滑茧蜂Homolobus sp.线粒体基因组特征第81-85页
    3.10 探茧蜂Ichneutes sp.线粒体基因组特征第85-89页
    3.11 稀脉茧蜂Paroligoneurus sp.线粒体基因组特征第89-93页
    3.12 前眼茧蜂Proterops sp.线粒体基因组特征第93-97页
    3.13 奇脉茧蜂Mirax sp.线粒体基因组特征第97-101页
    3.14 角腰茧蜂Pambolus sp.线粒体基因组特征第101-105页
    3.15 光鞘反颚茧蜂Phaenocarpa sp.线粒体基因组特征第105-109页
    3.16 缺凹茧蜂Pselaphanus sp.线粒体基因组特征第109-113页
    3.17 拟塬腹茧蜂Pseudognaptodon sp.线粒体基因组特征第113-117页
    3.18 三缝茧蜂Triraphis sp.线粒体基因组特征第117-121页
    3.19 二色屏腹茧蜂Sigalphus bicolor线粒体基因组特征第121-125页
    3.20 丽下腔茧蜂Therophlius festivus线粒体基因组特征第125-129页
    3.21 刀腹茧蜂Xiphozele sp.线粒体基因组特征第129-133页
    3.22 颈双缘姬蜂Diadromus collaris线粒体基因组特征第133-138页
第四章 茧蜂科昆虫线粒体基因组比较分析第138-151页
    4.1 茧蜂科昆虫线粒体基因组的重排第138-141页
    4.2 茧蜂科昆虫碱基组成分析第141-144页
    4.3 起始密码子与终止密码子的使用第144-146页
    4.4 茧蜂科昆虫线粒体基因组基因间隔区与重叠区第146-148页
    4.5 茧蜂科线粒体基因组进化速率第148-151页
第五章 基于线粒体基因组的茧蜂科系统发育及时间分化分析第151-166页
    5.1 茧蜂科系统发育分析第151-162页
        5.1.1 基于DNA序列构建系统发育树第151-152页
        5.1.2 基于氨基酸序列的系统发育分析第152-153页
        5.1.3 蚜茧蜂亚科分类地位第153-162页
    5.2 茧蜂科昆虫进化时间及寄生习性进化分析第162-166页
第六章 总结与讨论第166-170页
    6.1 结果与讨论第166-168页
        6.1.1 茧蜂科昆虫线粒体基因组测序、注释及特征研究第166-167页
        6.1.2 茧蜂科线粒体基因组的比较基因组学第167-168页
        6.1.3 基于线粒体基因组的茧蜂科进化分析第168页
    6.2 创新之处第168-169页
    6.3 不足之处第169页
    6.4 今后的研究方向第169-170页
参考文献第170-183页
附录Ⅰ 作者简历及发表的论文第183页

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