| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第10-25页 |
| 1.1 根际微生物研究进展 | 第10-14页 |
| 1.1.1 植物和土壤对根际微生物的影响 | 第10-12页 |
| 1.1.2 根际微生物对土壤的改善作用 | 第12-13页 |
| 1.1.3 根际微生物对植物生长的促进作用 | 第13-14页 |
| 1.2 接种根瘤菌的研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 大豆接种根瘤菌的种植效果 | 第15-17页 |
| 1.2.2 接种根瘤菌对根际微生物的影响 | 第17-18页 |
| 1.3 土壤微生物多样性研究方法 | 第18-22页 |
| 1.3.1 方法概述 | 第18-21页 |
| 1.3.2 方法的选择 | 第21-22页 |
| 1.4 变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术 | 第22-24页 |
| 1.4.1 技术原理 | 第22-23页 |
| 1.4.2 优缺点 | 第23页 |
| 1.4.3 应用进展 | 第23-24页 |
| 1.5 本研究目的与意义 | 第24-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-38页 |
| 2.1 菌株及其培养 | 第25-26页 |
| 2.1.1 实验菌株与质粒 | 第25页 |
| 2.1.2 培养基 | 第25-26页 |
| 2.1.3 抗生素 | 第26页 |
| 2.1.4 菌株的培养与保存方式 | 第26页 |
| 2.2 大豆栽培 | 第26-27页 |
| 2.2.1 试验地点 | 第26-27页 |
| 2.2.2 植物材料及预处理 | 第27页 |
| 2.2.3 大豆种植及管理 | 第27页 |
| 2.3 植物生理指标数据采集 | 第27-28页 |
| 2.4 根际土壤样品采集 | 第28页 |
| 2.5 根际土壤微生物总DNA的提取 | 第28页 |
| 2.6 目的DNA的PCR扩增与纯化 | 第28-31页 |
| 2.6.1 PCR的各对引物 | 第29页 |
| 2.6.2 TD-PCR | 第29-30页 |
| 2.6.3 Reconditioning PCR | 第30-31页 |
| 2.6.4 PCR产物纯化 | 第31页 |
| 2.7 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第31-34页 |
| 2.7.1 DGGE仪器 | 第31页 |
| 2.7.2 DGGE凝胶制备所用试剂及用量 | 第31-32页 |
| 2.7.3 DGGE凝胶制备的操作过程 | 第32-33页 |
| 2.7.4 电泳 | 第33页 |
| 2.7.5 染色与成像 | 第33-34页 |
| 2.8 DGGE优势条带的克隆与分析 | 第34-36页 |
| 2.8.1 优势条带割胶回收 | 第34页 |
| 2.8.2 优势条带的无GC夹板PCR | 第34页 |
| 2.8.3 感受态大肠杆菌的制备 | 第34-35页 |
| 2.8.4 连接与转化 | 第35页 |
| 2.8.5 阳性克隆子真假性验证与测序 | 第35-36页 |
| 2.9 数据分析 | 第36-38页 |
| 2.9.1 大豆植株生理指标数据处理 | 第36页 |
| 2.9.2 DGGE图谱优势条带测序结果分析 | 第36页 |
| 2.9.3 DGGE图谱细菌群落物种多样性分析 | 第36页 |
| 2.9.4 DGGE图谱细菌群落结构相似性分析 | 第36-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-61页 |
| 3.1 大豆植株生理指标数据分析 | 第38-39页 |
| 3.1.1 盛花期的株高与成熟期的植株干重 | 第38-39页 |
| 3.1.2 大豆植株根瘤数与产量 | 第39页 |
| 3.2 根际土壤总DNA的提取 | 第39-40页 |
| 3.3 16S rDNA高变区的降落PCR扩增产物 | 第40-41页 |
| 3.4 关于DGGE电泳条件的确定 | 第41-43页 |
| 3.5 DGGE图谱 | 第43-44页 |
| 3.6 DGGE优势条带测序结果与分析 | 第44-51页 |
| 3.7 样品细菌多样性DGGE图谱分析 | 第51-54页 |
| 3.8 样品细菌群落结构相似性DGGE图谱分析 | 第54-61页 |
| 3.8.1 Cs指数与Quantity One的相似性矩阵 | 第54-56页 |
| 3.8.2 聚类分析 | 第56-58页 |
| 3.8.3 主成分分析 | 第58-61页 |
| 4 讨论与展望 | 第61-66页 |
| 4.1 讨论 | 第61-64页 |
| 4.2 展望 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-75页 |
| 附录 | 第75-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第81页 |