| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩写、术语表 | 第9-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-26页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 分子相互作用研究现状 | 第13-19页 |
| 1.3 基于分子相互作用网络的系统生物学研究 | 第19-21页 |
| 1.4 课题目的 | 第21-22页 |
| 1.5 研究策略 | 第22页 |
| 1.6 论文内容及结构安排 | 第22-26页 |
| 第二章 拟南芥预测分子相互作用组的建立 | 第26-41页 |
| 2.1 引言 | 第26页 |
| 2.2 训练数据集的选择 | 第26-29页 |
| 2.3 侧面证据 | 第29-34页 |
| 2.4 预测分子相互作用 | 第34-37页 |
| 2.5 评估预测分子相互作用 | 第37-39页 |
| 2.6 本章小结 | 第39-41页 |
| 第三章 基于拟南芥预测分子相互作用网络的系统生物学研究 | 第41-60页 |
| 3.1 引言 | 第41页 |
| 3.2 拟南芥的基因集合关联分析 | 第41-51页 |
| 3.3 拟南芥基因功能预测 | 第51-56页 |
| 3.4 识别表达变化不显著的关键调控基因 | 第56-58页 |
| 3.5 本章小结 | 第58-60页 |
| 第四章 人类分子相互作用组的建立 | 第60-71页 |
| 4.1 引言 | 第60页 |
| 4.2 训练数据集的选择 | 第60-63页 |
| 4.3 侧面证据 | 第63-66页 |
| 4.4 预测分子相互作用 | 第66-67页 |
| 4.5 评估预测和实验所得分子相互作用 | 第67-69页 |
| 4.6 整合预测和实验所得分子相互作用 | 第69页 |
| 4.7 本章小结 | 第69-71页 |
| 第五章 基于人类功能性相互作用网络的基因集合关联分析 | 第71-90页 |
| 5.1 引言 | 第71页 |
| 5.2 人类功能性相互作用 | 第71-77页 |
| 5.3 基因集合关联分析方法 | 第77-79页 |
| 5.4 人类GO生物途径网络 | 第79-84页 |
| 5.5 针对表型的基因集合关联分析 | 第84-88页 |
| 5.6 本章小结 | 第88-90页 |
| 第六章 结论及展望 | 第90-93页 |
| 6.1 结论 | 第90-92页 |
| 6.2 展望 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-99页 |
| 作者简历 | 第99页 |