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传染性法氏囊病病毒VP4蛋白磷酸化修饰的研究

论文创新点第12-13页
摘要第13-15页
Abstract第15-16页
技术路线第17-18页
第一部分 文献综述第18-47页
    第一章 传染性法氏囊病病毒的研究动态第18-38页
        1 IBDV的病毒学分类地位第18页
        2 IBDV的基因组结构和编码蛋白第18-28页
            2.1 非编码区结构和功能研究第19-20页
            2.2 RNA依赖的RNA聚合酶VP1蛋白第20-22页
            2.3 pVP2、VP2以及4条多肽第22-23页
            2.4 衣壳蛋白VP3第23-25页
            2.5 蛋白酶蛋白VP4第25-26页
            2.6 非结构蛋白VP5第26-28页
        3 病毒蛋白、dsRNA之间的相互关系与病毒粒子的组装第28-30页
        4 IBDV的致病性和毒力差异第30-32页
        5 IBDV和宿主相互作用关系研究第32-35页
        6 IBDV编码蛋白抗原表位研究进展第35-38页
    第二章 病毒蛋白磷酸化的研究进展第38-47页
        1 病毒蛋白磷酸化与病毒的复制第39-42页
        2 病毒蛋白磷酸化与病毒蛋白的位移第42-43页
        3 病毒蛋白磷酸化与病毒的组装第43-44页
        4 病毒蛋白磷酸化与细胞信号通路第44-45页
        5 病毒蛋白磷酸化的其它功能第45-47页
第二部分 研究内容第47-140页
    第一章 传染性法氏囊病病毒VP4蛋白抗原表位分析第47-72页
        摘要第47-48页
        1 材料第48-49页
            1.1 病毒与细胞第48页
            1.2 试剂与抗体第48-49页
        2 实验方法第49-57页
            2.1 小鼠免疫第49页
            2.2 饲养细胞的准备第49页
            2.3 骨髓瘤细胞制备第49-50页
            2.4 免疫脾细胞制备第50页
            2.5 细胞融合第50页
            2.6 杂交瘤细胞的筛选及克隆化第50-51页
            2.7 单抗腹水的制备第51页
            2.8 单抗腹水ELISA效价的测定第51页
            2.9 IFA鉴定单克隆抗体的反应性以及IFA效价的测定第51-52页
            2.10 单克隆抗体的Ig亚型测定第52页
            2.11 单克隆抗体的Western-blot鉴定第52-53页
                2.11.1 样品准备第52页
                2.11.2 蛋白浓度的测定第52页
                2.11.3 SDS-PAGE及Western-blot第52-53页
            2.12 VP4蛋白抗原表位的精细定位第53-57页
                2.12.1 包含抗原表位以及磷酸化修饰的多肽设计与合成第53-55页
                2.12.2 多肽的溶解与保存第55-56页
                2.12.3 多肽与载体蛋白的偶联第56页
                2.12.4 偶联多肽的透析第56-57页
                2.12.5 Peptide-ELISA第57页
                2.12.6 Peptide-Dot-ELISA第57页
        3 结果与分析第57-68页
            3.1 单抗细胞建株第57-58页
            3.2 单克隆抗体特异性和反应性鉴定第58-61页
            3.3 单抗腹水的ELISA效价、IFA效价及亚型鉴定第61页
            3.4 IBDV VP4蛋白单克隆抗体的抗原表位鉴定第61-65页
            3.5 磷酸化单抗和非磷酸化单抗反应差异性比较第65-67页
            3.6 制备的磷酸化单抗与商业化通用型磷酸化单抗的比较第67页
            3.7 表位的同源性分析第67-68页
        4 讨论第68-72页
    第二章 传染性法氏囊病病毒VP4蛋白磷酸化修饰的细胞内分布与功能分析第72-113页
        摘要第72-73页
        1 材料第73-74页
            1.1 病毒、细胞、载体和抗体第73-74页
            1.2 试剂、材料和仪器第74页
        2 方法第74-86页
            2.1 磷酸化和非磷酸化VP4蛋白在细胞中分布第74-78页
                2.1.1 间接免疫荧光双标检测IBDV感染DF-1细胞中VP4分布第74-75页
                2.1.2 直接免疫荧光双标法检测IBDV感染DF-1细胞VP4分布第75-78页
                2.1.3 IFA检测重组杆状病毒rBV-aVP4、pVP4感染High 5细胞中VP4分布第78页
            2.2 免疫共沉淀第78-79页
            2.3 去磷酸化对VP4蛋白分布的影响第79-82页
                2.3.1 点突变载体构建第79-81页
                2.3.2 带有点突变的超纯质粒抽提第81页
                2.3.3 脂质体介导的转染以及蛋白表达检测第81-82页
            2.4 VP4去磷酸化后多聚蛋白VP243在细胞内的表达第82页
                2.4.1 多聚蛋白VP243重组真核表达载体的构建第82页
                2.4.2 超纯质粒抽提第82页
                2.4.3 质粒转染293T细胞以及样品制备第82页
                2.4.4 SDS-PAGE和Western blot分析第82页
            2.5 VP4蛋白去磷酸化后多聚蛋白VP243体外的转录翻译第82-83页
                2.5.1 超纯质粒抽提第82-83页
                2.5.2 体外转录翻译第83页
                2.5.3 SDS-PAGE和Western blot分析第83页
            2.6 SDS-PAGE以及Western-blot检测杆状病毒表达VP4蛋白第83页
            2.7 细胞蛋白组分的分步抽提以及Western blot分析第83-85页
                2.7.1 细胞蛋白的分步抽提第83-84页
                2.7.2 抽提蛋白的丙酮沉淀第84页
                2.7.3 蛋白浓度的测定第84-85页
                2.7.4 SDS-PAGE以及Western-blot第85页
            2.8 荧光定量PCR检测病毒编码蛋白对细胞骨架相关蛋白的影响第85-86页
                2.8.1 引物设计第85页
                2.8.2 超纯质粒抽提第85-86页
                2.8.3 脂质体介导的转染第86页
                2.8.4 细胞总RNA的抽提第86页
                2.8.5 反转录第86页
                2.8.6 Real-time PCR与数据分析第86页
        3 结果与分析第86-106页
            3.1 磷酸化和非磷酸化VP4蛋白在病毒感染细胞中的分布第86-91页
                3.1.1 IBDV感染DF-1细胞中VP4蛋白的分布第86-90页
                3.1.2 杆状病毒表达的VP4蛋白在High5细胞中的分布情况第90-91页
            3.2 点突变真核表达载体构建第91-92页
            3.3 去磷酸化点突变VP4在转染细胞中的表达动态第92-99页
            3.4 VP4多位点去磷酸化后多聚蛋白VP243的表达第99-100页
            3.5 VP4多位点去磷酸化突变的VP243的体外转录翻译第100-102页
            3.6 VP4蛋白的亚细胞分布第102-105页
                3.6.1 磷酸化VP4蛋白在IBDV感染的DF-1细胞中的亚细胞分布第102-103页
                3.6.2 磷酸化VP4蛋白在重组杆状病毒感染的Sf9细胞中的亚细胞分布第103-105页
            3.7 IBDV编码蛋白对细胞骨架相关蛋白的转录本的影响第105-106页
        4 讨论第106-113页
            4.1 IBDV VP4蛋白是一种磷酸化蛋白第107页
            4.2 四个磷酸化位点对VP4蛋白定位和分布的影响第107-108页
            4.3 Tyr99和Thr162位点对VP4蛋白剪切功能的影响第108-110页
            4.4 VP4蛋白主要存在于细胞骨架组分中第110-111页
            4.5 VP4蛋白对细胞骨架相关蛋白转录本的影响第111-113页
    第三章 VP4与IBDV其它编码蛋白的互作研究第113-140页
        摘要第113-115页
        1 材料第115-116页
            1.1 试剂第115页
            1.2 单克隆抗体和多克隆抗体第115页
            1.3 细胞、病毒和载体第115-116页
        2 方法第116-117页
            2.1 转染用超纯质粒抽提第116页
            2.2 脂质体介导的细胞转染第116页
            2.3 间接免疫荧光(IFA)第116页
            2.4 免疫荧光双标第116页
            2.5 免疫共沉淀第116-117页
        3 结果与分析第117-137页
            3.1 VP4蛋白与其它IBDV编码蛋白在细胞中的定位关系第117-131页
                3.1.1 VP4与VP1的共定位第117-121页
                3.1.2 VP4与VP2的共定位第121-123页
                3.1.3 VP4与VP3的共定位第123-126页
                3.1.4 VP4与VP5的共定位第126-127页
                3.1.5 VP2与VP3的共定位第127-129页
                3.1.6 VP2、VP3以及VP4的共定位第129-131页
            3.2 免疫共沉淀分析VP4蛋白与VP1、VP3蛋白的关系第131-137页
                3.2.1 病毒感染情况下非磷酸化VP4蛋白与VP1、VP3蛋白的关系第131-133页
                3.2.2 病毒感染情况下pS26-VP4蛋白与VP1、VP3蛋白的关系第133页
                3.2.3 质粒转染情况下VP4蛋白与VP3蛋白的相互关系第133-137页
        4 讨论第137-140页
全文总结第140-141页
参考文献第141-160页
第三部分 附录第160-169页
    附录A 缩略词第160-163页
    附录B 常用缓冲液及培养基配方第163-168页
    附录C 攻博期间发表或录用的学术论文第168-169页
致谢第169-170页

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