| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 缩写与符号 | 第17-19页 |
| 第一章 前言 | 第19-41页 |
| 1.1 内生菌及其生物防治 | 第19-28页 |
| 1.1.1 内生菌的作用 | 第21-24页 |
| 1.1.2 内生菌生防活性的调控 | 第24-28页 |
| 1.2 细菌GGDEF/EAL结构域蛋白 | 第28-36页 |
| 1.2.1 二鸟苷酸环化酶(DGC) | 第30页 |
| 1.2.2 磷酸二酯酶(PDE) | 第30-31页 |
| 1.2.3 含GGDEF/EAL结构域的c-di-GMP效应蛋白 | 第31-32页 |
| 1.2.4 CsrD家族蛋白 | 第32页 |
| 1.2.5 c-di-GMP的功能 | 第32-35页 |
| 1.2.6 c-di-GMP的信号通路与其他调控系统的相互作用 | 第35-36页 |
| 1.3 普城沙雷氏菌与生物防治 | 第36-38页 |
| 1.4 研究目的、主要内容和技术路线 | 第38-41页 |
| 1.4.1 研究目的与意义 | 第38-39页 |
| 1.4.2 主要研究内容 | 第39-40页 |
| 1.4.3 主要技术路线 | 第40-41页 |
| 第二章 S.plymuthica pigX突变体构建及表型鉴定 | 第41-72页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第41-45页 |
| 2.1.1 菌株、质粒、引物和培养基 | 第41-45页 |
| 2.1.2 主要实验仪器 | 第45页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第45页 |
| 2.2 方法 | 第45-52页 |
| 2.2.1 pigX基因的克隆和生物信息学分析 | 第45-46页 |
| 2.2.2 pigX自杀性载体的构建 | 第46-47页 |
| 2.2.3 pigX::Gm突变体的筛选 | 第47-48页 |
| 2.2.4 pigX::Gm突变体互补菌株的构建 | 第48页 |
| 2.2.5 蛋白酶活性和几丁质酶活性检测 | 第48-49页 |
| 2.2.6 运动性检测 | 第49页 |
| 2.2.7 生物膜形成(biofilm formation) | 第49页 |
| 2.2.8 AHLs信号分子检测 | 第49页 |
| 2.2.9 真菌对峙实验 | 第49-50页 |
| 2.2.10 PRN的提取和TLC检测 | 第50页 |
| 2.2.11 IAA检测 | 第50-51页 |
| 2.2.12 普里斯考尔试验(Voges Proskauer test,VP)检测乙偶姻 | 第51页 |
| 2.2.13 pigX::Gm/pUCP26-csrD的构建及表型检测 | 第51-52页 |
| 2.3 结果 | 第52-67页 |
| 2.3.1 pigX克隆和生物信息学分析 | 第52-56页 |
| 2.3.2 突变体pigX::Gm的构建和验证 | 第56-57页 |
| 2.3.3 突变体pigX::Gm互补菌株pigX::Gm/pUCP26-pigX的构建 | 第57页 |
| 2.3.4 PigX正调节蛋白酶和几丁质酶的活性 | 第57-59页 |
| 2.3.5 PigX正调控swimming和swarming运动 | 第59-60页 |
| 2.3.6 PigX负调控生物膜的形成 | 第60页 |
| 2.3.7 PigX对AHLs信号分子合成的影响 | 第60-62页 |
| 2.3.8 PigX正调控抑菌性和抗生素PRN生物合成 | 第62-63页 |
| 2.3.9 PigX负调控IAA的合成 | 第63-64页 |
| 2.3.10 PigX负调控乙偶姻的合成 | 第64-66页 |
| 2.3.11 E.coli CsrD能够部分恢复突变体pigX：：Gm的活性 | 第66-67页 |
| 2.4 讨论 | 第67-70页 |
| 2.5 小结 | 第70-72页 |
| 第三章 转录或翻译融合分析PigX的调控作用 | 第72-93页 |
| 3.1 材料与仪器 | 第72页 |
| 3.2 方法 | 第72-76页 |
| 3.2.1 构建△lacZ突变体 | 第72页 |
| 3.2.2 构建lux-、lacZ-的启动子报告基因 | 第72-74页 |
| 3.2.3 PigX对flhDC转录和翻译的影响 | 第74-75页 |
| 3.2.4 PigX对prnA转录和翻译的影响 | 第75页 |
| 3.2.5 PigX对splI和spsI转录的影响 | 第75页 |
| 3.2.6 PigX与Rsm调控系统相互作用 | 第75-76页 |
| 3.2.7. PigX与Hfq相互作用 | 第76页 |
| 3.2.8 RpoS对pigX转录与翻译的影响 | 第76页 |
| 3.2.9 PigX自我调控 | 第76页 |
| 3.3 结果与分析 | 第76-89页 |
| 3.3.1 PigX正调控flhDC的表达 | 第76-78页 |
| 3.3.2 PigX正调控prnABCD操纵子 | 第78-80页 |
| 3.3.3 PigX正调控splI和spsI的转录 | 第80-81页 |
| 3.3.4 PigX与Rsm调控系统相互作用 | 第81-84页 |
| 3.3.5 PigX与Hfq的相互正调控 | 第84-86页 |
| 3.3.6 RpoS负调控PigX | 第86-88页 |
| 3.3.7 PigX自我正调控 | 第88-89页 |
| 3.4 讨论 | 第89-92页 |
| 3.5 小结 | 第92-93页 |
| 第四章 蛋白质组学分析S.plymuthica G3 PigX的功能 | 第93-128页 |
| 4.1 材料 | 第93页 |
| 4.1.1 试剂与仪器 | 第93页 |
| 4.1.2 实验材料 | 第93页 |
| 4.1.3 二维电泳相关试剂及其配制方法 | 第93页 |
| 4.2 方法 | 第93-100页 |
| 4.2.1 细菌全蛋白的提取 | 第93-94页 |
| 4.2.2 蛋白质浓度测定 | 第94页 |
| 4.2.3 细菌全蛋白二维电泳 | 第94-96页 |
| 4.2.4 蛋白点的质谱分析 | 第96-97页 |
| 4.2.5 差异蛋白的生物信息学分析 | 第97页 |
| 4.2.6 鞭毛蛋白的验证 | 第97-98页 |
| 4.2.7 超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性测定 | 第98-99页 |
| 4.2.8 翻译融合验证LrhA蛋白 | 第99-100页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第100-127页 |
| 4.3.1 细菌总蛋白的差异蛋白表达谱分析 | 第100-101页 |
| 4.3.2 差异蛋白的质谱鉴定 | 第101-112页 |
| 4.3.3 差异蛋白质点的生物信息学分析 | 第112-114页 |
| 4.3.4 差异蛋白质分析与讨论 | 第114-127页 |
| 4.4 小结 | 第127-128页 |
| 第五章 总结与展望 | 第128-130页 |
| 总结 | 第128-129页 |
| 展望 | 第129页 |
| 创新点 | 第129-130页 |
| 参考文献 | 第130-148页 |
| 致谢 | 第148-149页 |
| 在读期间发表的文章及参与的课题 | 第149页 |
