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多粘类芽孢杆菌在茶叶上的定殖及其对叶际细菌群落的影响

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第1章 绪论第10-18页
    1.1 叶际微生物研究进展第10-12页
        1.1.1 叶际微生物的定殖第10-11页
        1.1.2 叶际微生物的群落结构多样性第11-12页
        1.1.3 叶际微生物的功能多样性第12页
    1.2 多粘类芽孢杆菌研究进展第12-14页
        1.2.1 多粘类芽孢杆菌的生理特性第12-13页
        1.2.2 多粘类芽孢杆菌的生态功能第13-14页
    1.3 微生物定殖及多样性研究方法第14-16页
        1.3.1 BIOLOG技术第14页
        1.3.2 脂质分析技术第14页
        1.3.3 荧光原位杂交(FISH)技术第14-15页
        1.3.4 基于PCR的研究技术第15页
        1.3.5 高通量测序技术第15-16页
    1.4 本课题的研究意义、内容和技术路线第16-18页
        1.4.1 研究意义和内容第16-17页
        1.4.2 研究技术路线第17-18页
第2章 P.polymyxa菌剂在茶树叶际定殖能力的研究第18-36页
    2.1 仪器与试剂第18-22页
        2.1.1 实验仪器第18-19页
        2.1.2 主要试剂第19-21页
        2.1.3 主要溶液的配制第21-22页
    2.2 材料与方法第22-25页
        2.2.1 P.polymyxa菌剂的制备第22页
        2.2.2 P.polymyxa菌剂的喷施第22-23页
        2.2.3 茶叶样品采集及DNA提取第23页
        2.2.4 质粒制备及提取第23-24页
        2.2.5 定量PCR体系的建立第24-25页
    2.3 结果第25-34页
        2.3.1 采样周期内温度及降雨量变化第25-26页
        2.3.2 质粒常规PCR检验第26-27页
        2.3.3 定量PCR标准曲线及溶解曲线第27-30页
        2.3.4 春季P.polymyxa定殖规律及对叶际微生物的影响第30-32页
        2.3.5 秋季P.polymyxa定殖规律及对叶际微生物的影响第32-34页
    2.4 讨论第34-35页
        2.4.1 P.polymyxa在茶树叶际的定殖规律第34-35页
        2.4.2 P.polymyxa对茶树叶际微生物数量的影响第35页
    2.5 本章小结第35-36页
第3章 P.polymyxa菌剂对茶树叶际病原菌的影响第36-46页
    3.1 仪器与试剂第37页
        3.1.1 实验仪器第37页
        3.1.2 主要试剂第37页
        3.1.3 主要溶液的配制第37页
    3.2 材料与方法第37-39页
        3.2.1 茶叶样品采集及DNA提取第37-38页
        3.2.2 病原菌常规PCR定性检测第38页
        3.2.3 病原菌定量PCR检测第38-39页
    3.3 结果与讨论第39-44页
        3.3.1 病原菌定性检测第39-40页
        3.3.2 定量PCR标准曲线及溶解曲线第40-42页
        3.3.3 病原菌定量检测第42-44页
    3.4 本章小结第44-46页
第4章 P.polymyxa菌剂对茶树叶际细菌群落的影响第46-60页
    4.1 仪器与试剂第47页
        4.1.1 实验仪器第47页
        4.1.2 主要试剂第47页
    4.2 材料与方法第47-50页
        4.2.1 茶叶样品准备第47页
        4.2.2 细菌16S rRNA基因V3~V4区PCR扩增并测序第47-49页
        4.2.3 数据处理与质控第49页
        4.2.4 去除嵌合体及靶区域外序列第49页
        4.2.5 OTUs聚类及赋予物种分类单元第49页
        4.2.6 Alpha多样性分析第49-50页
        4.2.7 Beta多样性分析第50页
    4.3 结果与讨论第50-58页
        4.3.1 细菌16S rRNA基因V3~V4区PCR扩增第50页
        4.3.2 稀释曲线第50-51页
        4.3.3 Shannon指数第51-52页
        4.3.4 Bray-Cutis矩阵分析第52-53页
        4.3.5 PCoA分析第53-54页
        4.3.6 细菌群落结构分析第54-58页
    4.4 本章小结第58-60页
结论第60-62页
参考文献第62-70页
攻读硕士学位期间所发表的论文第70-72页
致谢第72页

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