| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 1 文献综述 | 第12-38页 |
| 前言 | 第12页 |
| 1.1 环境中的铅 | 第12-13页 |
| 1.2 铅的污染问题 | 第13-16页 |
| 1.2.1 铅污染来源与现状 | 第13-15页 |
| 1.2.2 土壤铅污染的治理 | 第15-16页 |
| 1.3 植物根系与土壤重金属的相互作用及植物体内重金属的积累 | 第16-18页 |
| 1.3.1 植物对土壤重金属的活化 | 第16页 |
| 1.3.2 植物体内重金属的积累 | 第16-18页 |
| 1.4 铅的生物学功能 | 第18-21页 |
| 1.4.1 铅对人的毒害作用 | 第18-19页 |
| 1.4.2 铅对植物的毒害作用 | 第19-21页 |
| 1.5 重金属铅对植物生理生化的影响 | 第21-23页 |
| 1.6 植物的铅耐性机制 | 第23-24页 |
| 1.7 数字基因表达谱 | 第24-31页 |
| 1.7.1 数字基因表达谱的原理 | 第25-27页 |
| 1.7.2 数字基因表达谱操作流程 | 第27页 |
| 1.7.3 数字基因表达谱分析方法 | 第27-30页 |
| 1.7.4 数字基因表达谱的应用 | 第30-31页 |
| 1.8 DNA甲基化谱差异研究 | 第31-38页 |
| 1.8.1 DNA甲基化概述 | 第31-32页 |
| 1.8.2 DNA甲基化机制 | 第32-33页 |
| 1.8.3 植物DNA甲基化研究的方法 | 第33页 |
| 1.8.4 MeDIP-seq技术简介 | 第33-34页 |
| 1.8.5 植物DNA甲基化引起的表观遗传作用 | 第34-38页 |
| 2 本研究的目的与意义 | 第38-40页 |
| 3 材料与方法 | 第40-56页 |
| 3.1 试验技术路线 | 第40页 |
| 3.2 试验材料 | 第40-42页 |
| 3.2.1 供试材料 | 第40-41页 |
| 3.2.2 酶与生化试剂 | 第41页 |
| 3.2.3 使用的数据库和软件 | 第41-42页 |
| 3.2.4 主要仪器设备 | 第42页 |
| 3.3 试验方法 | 第42-56页 |
| 3.3.1 酶活测定 | 第42-44页 |
| 3.3.2 细胞和根系形态指标测定 | 第44-45页 |
| 3.3.3 全基因组测序 | 第45-49页 |
| 3.3.4 转录水平深度测序 | 第49-54页 |
| 3.3.5 荧光定量qRT-PCR方法 | 第54-56页 |
| 4 结果与分析 | 第56-102页 |
| 4.1 铅胁迫对玉米苗期不同基因型玉米生理生化的影响 | 第56-63页 |
| 4.1.1 不同材料铅胁迫下处理和对照的根生长特性 | 第56-58页 |
| 4.1.2 铅胁迫下不同材料的根系形态学变化 | 第58-60页 |
| 4.1.3 铅胁迫下不同材料之间根系活力比较 | 第60-61页 |
| 4.1.4 不同的膜脂质过氧化水平分析 | 第61页 |
| 4.1.5 根系中不同的氧保护酶的相对活性 | 第61-63页 |
| 4.2 铅胁迫下玉米根系比较全基因组甲基化分析 | 第63-74页 |
| 4.2.1 MeDIP-seq结果分析 | 第63-64页 |
| 4.2.2 玉米根系DNA甲基化概况 | 第64-65页 |
| 4.2.3 CGIs区域中的DNA甲基化分布情况 | 第65-68页 |
| 4.2.4 四个样品中甲基化差异基因分析 | 第68-73页 |
| 4.2.5 启动子区域的DNA甲基化和基因表达水平分析 | 第73-74页 |
| 4.3 重金属低浓度铅胁迫下玉米根系转录组的动态变化研究 | 第74-85页 |
| 4.3.1 铅胁迫下玉米根系的转录组概况 | 第76-81页 |
| 4.3.2 高丰度转录本的功能注释 | 第81-85页 |
| 4.4 重金属铅胁迫下玉米根系基因组表达谱分析 | 第85-102页 |
| 4.4.1 标记识别和饱和度分析 | 第85-86页 |
| 4.4.2 unique tags注释 | 第86页 |
| 4.4.3 差异表达基因的比较分析 | 第86-88页 |
| 4.4.4 差异表达基因的pathway富集分析 | 第88-91页 |
| 4.4.5 差异表达基因qRT-PCR验证 | 第91-101页 |
| 4.4.6 差异表达基因的功能分析 | 第101-102页 |
| 5 讨论与结论 | 第102-117页 |
| 5.1 铅胁迫下玉米抗氧化机制探讨 | 第102-103页 |
| 5.2 铅胁迫下玉米根系比较全基因组甲基化分析 | 第103-105页 |
| 5.2.1 铅胁迫下DNA甲基化谱分析 | 第103-104页 |
| 5.2.2 潜在的甲基化基因功能对铅污染的应答 | 第104-105页 |
| 5.3 重金属铅胁迫下玉米根系转录组分析 | 第105-108页 |
| 5.4 重金属铅胁迫下玉米根系基因组表达谱分析 | 第108-110页 |
| 5.5 重金属铅胁迫下DNA甲基化和基因表达调控相关性分析 | 第110-112页 |
| 5.6 玉米抗铅胁迫分子机制探讨 | 第112-114页 |
| 5.7 本研究在重金属逆境育种中的潜在应用与挑战 | 第114-117页 |
| 6 小结 | 第117-118页 |
| 下一步研究计划 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-140页 |
| 致谢 | 第140-142页 |
| 博士在读期间发表与本研究相关的论文 | 第142-143页 |
| 附录 | 第143-168页 |
