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香蕉枯萎病菌分泌蛋白质的差异表达分析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
缩略词及中英文对照第8-14页
1 前言第14-24页
    1.1 香蕉枯萎病在农业生产中的重要性第14-15页
        1.1.1 香蕉的生产地位及经济价值第14页
        1.1.2 香蕉枯萎病及其病原菌第14-15页
        1.1.3 香蕉枯萎病菌的侵染过程和香蕉枯萎病的发病症状第15页
    1.2 香蕉枯萎病菌致病机理的相关研究进展第15-18页
        1.2.1 细胞壁降解酶在Foc致病过程中的作用第15-16页
        1.2.2 毒素在Foc致病过程中的作用第16-17页
        1.2.3 Foc致病相关基因的研究进展第17-18页
    1.3 分泌蛋白在Foc致病性中的作用第18-19页
        1.3.1 分泌蛋白及其主要特征第18页
        1.3.2 分泌蛋白质在植物病原真菌与寄主互作中的作用第18-19页
    1.4 植物病原真菌分泌蛋白质组研究进展第19-23页
        1.4.1 分泌蛋白质组的概念及其核心技术第19-20页
        1.4.2 基于 2-DE的分泌蛋白质组分离技术第20-21页
            1.4.2.1 双向凝胶电泳第20页
            1.4.2.2 双向差异凝胶电泳第20-21页
        1.4.3 基于质谱的蛋白质定量技术第21-22页
            1.4.3.1 蛋白质非标记定量技术第21页
            1.4.3.2 蛋白质标记定量技术第21-22页
        1.4.4 分泌蛋白质组在植物病原真菌中的研究进展第22-23页
    1.5 研究的目的和意义第23-24页
2 材料与方法第24-34页
    2.1 实验材料第24页
    2.2 实验仪器与试剂第24-26页
        2.2.0 仪器设备第24页
        2.2.1 实验试剂第24页
        2.2.2 培养基和实验试剂第24页
        2.2.3 分泌蛋白提取所需试剂第24-25页
        2.2.4 蛋白定量所用的溶液的配制第25页
        2.2.5 SDS-PAGE凝胶配制:第25页
        2.2.6 考马斯亮蓝G-250 染色所需溶液的配制第25-26页
    2.3 实验方法第26-30页
        2.3.1 病原菌的培养第26页
        2.3.2 香蕉组织诱导物的制备第26页
        2.3.3 分泌蛋白诱导培养基的制备第26页
        2.3.4 Foc生长曲线的测定第26页
        2.3.5 分泌蛋白不同提取方法的比较第26-27页
            2.3.5.1 DOC-TCA沉淀法第26-27页
            2.3.5.2 丙酮沉淀法第27页
            2.3.5.3 硫酸铵沉淀法第27页
        2.3.6 香蕉枯萎病菌分泌蛋白质的大规模提取第27-28页
        2.3.7 蛋白质含量测定第28-29页
        2.3.8 SDS-PAGE检测第29页
        2.3.9 胶体考染第29页
        2.3.10 基于Label-free的Foc分泌蛋白的质谱分析方法第29-30页
            2.3.10.1 超滤辅助样品制备法(Filter aided proteome preparation,FASP)酶解第29-30页
    2.4第30-34页
        2.4.1 高效液相色谱第30页
        2.4.2 质谱鉴定第30页
        2.4.3 数据分析第30-31页
        2.4.4 Gene Ontology(GO)功能注释第31-32页
        2.4.5 KEGG通路注释第32页
        2.4.6 GO注释与KEGG注释的富集分析第32页
        2.4.7 Foc分泌蛋白的预测分析第32-34页
            2.4.7.1 经典分泌蛋白的预测第32-33页
            2.4.7.2 非经典分泌蛋白的预测第33-34页
3 结果与分析第34-63页
    3.1 Foc在分泌蛋白诱导培养基中的生长曲线测定第34页
    3.2 不同方法提取Foc分泌蛋白的比较第34-35页
    3.3 基于Lable-free的Foc分泌蛋白质谱分析第35-63页
        3.3.1 Foc分泌蛋白的SDS-PAGE分析第35-36页
        3.3.2 基于Lable-free的Foc分泌蛋白质谱分析第36-37页
        3.3.3 基于生物信息学的Foc差异表达分泌蛋白的验证分析第37页
        3.3.4 基于质谱的Foc1分泌蛋白质差异表达分析第37-43页
            3.3.4.1 诱导条件下Foc1的分泌蛋白质差异表达分析第37-40页
            3.3.4.2 Foc1差异表达分泌蛋白的功能分类第40-41页
            3.3.4.3 Foc1差异表达分泌蛋白的GO功能显著性富集分析第41-42页
            3.3.4.4 Foc1差异表达分泌蛋白的KEGG通路富集分析第42-43页
        3.3.5 基于质谱的Foc4分泌蛋白质差异表达分析第43-47页
            3.3.5.1 诱导条件下Foc4的分泌蛋白质差异表达分析第43-46页
            3.3.5.2 Foc4差异表达分泌蛋白的功能分类第46-47页
        3.3.6 Foc4差异表达分泌蛋白的GO功能显著性富集分析第47-48页
        3.3.7 Foc4差异表达分泌蛋白的KEGG通路富集分析第48-49页
        3.3.8 Foc不同小种间分泌蛋白质的差异表达分析第49-63页
            3.3.8.1 非诱导条件下Foc1与Foc4分泌蛋白质差异表达分析第49-52页
            3.3.8.2 非诱导条件下Foc1与Foc4差异表达分泌蛋白功能分类第52-53页
            3.3.8.3 非诱导条件下Foc1与Foc4差异表达分泌蛋白GO功能显著性富集分析第53-54页
            3.3.8.4 非诱导条件下Foc1与Foc4差异表达分泌蛋白KEGG通路富集分析第54-55页
            3.3.8.5 诱导条件下Foc不同小种间的分泌蛋白质差异表达分析第55-60页
            3.3.8.6 诱导条件下Foc1与Foc4差异表达分泌蛋白的功能分类第60-61页
            3.3.8.7 诱导条件下Foc1与Foc4差异表达分泌蛋白GO功能显著性富集分析第61-62页
            3.3.8.8 诱导条件下Foc1与Foc4差异表达分泌蛋白KEGG通路富集分析第62-63页
4 结论与讨论第63-76页
    4.1 全文结论第63-64页
    4.2 讨论第64-74页
        4.2.1 诱导条件下Foc分泌蛋白质组研究方法的建立第64-65页
        4.2.2 结合生物信息学的Foc差异表达分泌蛋白的分析第65-67页
        4.2.3 诱导条件下Foc差异表达分泌蛋白的功能分析第67-74页
            4.2.3.1 蛋白质合成和分解代谢相关蛋白质第69-70页
            4.2.3.2 氨基酸代谢相关蛋白质第70页
            4.2.3.3 氧化胁迫相关蛋白质第70-71页
            4.2.3.4 分子伴侣第71页
            4.2.3.5 细胞壁降解酶类相关蛋白第71-72页
            4.2.3.6 水解相关酶类第72-73页
            4.2.3.7 氨基酸代谢第73-74页
            4.2.3.8 信号转导第74页
            4.2.3.9 能量合成代谢第74页
    4.3 存在的问题及展望第74-76页
致谢第76-77页
参考文献第77-81页

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