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茄子HSFs和HSPs基因鉴定及其在高温下的表达模式分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 前言第13-33页
    1.1 植物对高温胁迫的响应第13-17页
        1.1.1 植物对高温响应的形态和生理学基础第13-15页
        1.1.2 植物对高温响应的分子生物学基础第15-17页
    1.2 植物热激转录因子研究进展第17-22页
        1.2.1 植物热激转录因子的基本结构第18页
        1.2.2 植物热激转录因子的分类和多样性第18-19页
        1.2.3 植物热激转录因子的功能第19-22页
        1.2.4 热激转录因子活性的调节第22页
    1.3 植物热激蛋白研究进展第22-30页
        1.3.1 热激蛋白的发现第23页
        1.3.2 热激蛋白的种类和定位第23-27页
        1.3.3 热激蛋白的特点第27-28页
        1.3.4 热激蛋白的主要功能第28-30页
        1.3.5 热激蛋白的表达调控第30页
    1.4 茄子耐热研究进展第30-31页
    1.5 转录组学在植物抗热方面的研究进展第31-32页
    1.6 本研究的目的和意义第32-33页
2 材料与方法第33-45页
    2.1 试验主要试剂和仪器第33-34页
        2.1.1 试验主要试剂第33-34页
        2.1.2 试验主要仪器第34页
    2.2 试验方法第34-45页
        2.2.1 茄子Hsf和Hsp基因家族鉴定及生物信息学分析第34-35页
        2.2.2 茄子耐热品系 05-4 和热敏品系 05-1 在高温胁迫下的转录组分析第35-41页
        2.2.3 茄子最佳内参基因的筛选第41-44页
        2.2.4 茄子部分Hsf和Hsp在高温胁迫下的表达模式分析第44-45页
3 结果与分析第45-65页
    3.1 茄子Hsf和Hsp基因家族鉴定与生物信息学分析第45-50页
        3.1.1 茄子Hsf和Hsp基因家族的鉴定第45页
        3.1.2 茄子Hsf和Hsp家族基因的基本理化性质第45-46页
        3.1.3 茄子Hsf和Hsp基因家族的进化分析第46-48页
        3.1.4 鉴别直系同源基因和旁系同源基因第48页
        3.1.5 茄子Hsf和Hsp基因家族的基因结构分析第48-49页
        3.1.6 茄子Hsf和Hsp基因家族的保守基序分析第49-50页
    3.2 茄子Hsf和Hsp苗期叶片热胁迫转录表达谱分析第50-58页
        3.2.1 RNA样品制备第50页
        3.2.2 RNA-Seq数据比对统计第50-51页
        3.2.3 RNA-Seq样品RNA的测序质量评估第51页
        3.2.4 样本差异表达基因统计第51-52页
        3.2.5 差异表达基因的GO功能分类第52页
        3.2.6 差异表达基因的Pathway显著性富集分析第52-54页
        3.2.7 内质网蛋白加工通路第54-55页
        3.2.8 茄子Hsf和Hsp基因家族的表达谱分析第55-58页
        3.2.9 转录组表达谱Q-PCR验证第58页
    3.3 茄子实时荧光定量PCR内参基因的选择第58-62页
        3.3.1 茄子内参基因的普通PCR分析第58-59页
        3.3.2 茄子内参基因的荧光定量PCR分析第59-60页
        3.3.3 内参基因的表达稳定性评价第60-62页
    3.4 茄子部分Hsf和Hsp家族成员表达特性分析第62-65页
        3.4.1 茄子部分Hsf和Hsp家族成员在持续高温胁迫下的表达第62-63页
        3.4.2 茄子部分Hsf和Hsp家族成员在高温胁迫下不同组织中的表达第63-65页
4 讨论第65-75页
    4.1 茄子中的Hsf和Hsp基因、系统进化和结构性质第65-67页
    4.2 茄子响应高温胁迫的转录组表达谱分析第67-68页
    4.3 Hsf和Hsp参与茄子对高温的响应第68-69页
    4.4 茄子Q-PCR内参基因的筛选第69-70页
    4.5 茄子Hsf和Hsp家族基因在高温胁迫下的表达模式第70-75页
        4.5.1 茄子Hsf家族基因在高温下的表达模式分析第70-71页
        4.5.2 茄子s Hsp家族基因在高温下的表达模式分析第71页
        4.5.3 茄子Hsp40家族基因在高温下的表达模式分析第71-72页
        4.5.4 茄子Hsp60家族基因在高温下的表达模式分析第72页
        4.5.5 茄子Hsp70家族基因在高温下的表达模式分析第72-73页
        4.5.6 茄子Hsp90家族基因在高温下的表达模式分析第73-74页
        4.5.7 茄子Hsp100家族基因在高温下的表达模式分析第74-75页
5 结论第75-76页
致谢第76-77页
参考文献第77-96页
附录A 攻读硕士期间发表文章情况第96-97页
附录B 茄子Hsf和Hsp家族基因的基本理化性质第97-103页
附录C 茄子Hsf、sHsp、Hsp40、Hsp60、Hsp70、Hsp90、Hsp100系统进化树第103-107页
附录D 茄子Hsf、sHsp、Hsp40、Hsp60、Hsp70、Hsp90、Hsp100蛋白基序和基因结构分析第107-109页

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