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基于多尺度多特征的固有不规则蛋白质结构预测方法研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第1章 绪论第12-30页
    1.1 课题研究的目的和意义第12-14页
    1.2 IDPs结构预测研究的现状第14-26页
        1.2.1 基于PONDRs的IDPs结构预测方法第15-18页
        1.2.2 基于特征分析的IDPs结构预测方法第18-22页
        1.2.3 基于智能算法的IDPs结构预测方法第22-24页
        1.2.4 基于集成建模的IDPs结构预测方法第24-26页
    1.3 论文的主要研究内容和组织结构第26-30页
第2章 IDPs结构预测建模中滑窗尺度的选择方法第30-48页
    2.1 引言第30页
    2.2 IDPs生物学特点第30-32页
    2.3 IDPs序列信息的多尺度特性第32-34页
        2.3.1 IDPs序列长度的差异性第33-34页
        2.3.2 IDPs序列组成成分的差异性第34页
    2.4 基于滑窗技术的IDPs结构预测建模方法分析第34-37页
        2.4.1 IDPs结构预测中滑窗选择方法存在的问题第34-36页
        2.4.2 基于多尺度的IDPs结构预测建模方法的优势第36-37页
    2.5 基于差异度度量法的窗口尺度选择第37-43页
        2.5.1 差异度度量指标第37-40页
        2.5.2 IDPs结构预测中基模型的构建第40-42页
        2.5.3 基于差异度度量法的窗口尺度选择模型的构建第42-43页
    2.6 基于差异度度量法的滑窗尺度选择结果及分析第43-47页
        2.6.1 实验数据及评价指标第43-44页
        2.6.2 IDPs结构预测中滑窗选择的结果及分析第44-46页
        2.6.3 滑窗尺度对IDPs结构预测性能影响的结果及分析第46-47页
    2.7 本章小结第47-48页
第3章 IDPs结构预测中氨基酸结构倾向度的计算方法第48-66页
    3.1 引言第48页
    3.2 基于结构倾向性的特征向量的分析第48-50页
    3.3 氨基酸结构倾向性的检验第50-56页
        3.3.1 基于Fisher的氨基酸结构倾向性的检验第50-53页
        3.3.2 基于错误发现率的检验控制第53-56页
    3.4 氨基酸结构倾向度的计算第56-59页
        3.4.1 氨基酸结构倾向度的计算方法第56-58页
        3.4.2 氨基酸结构倾向度表的构建方法第58-59页
    3.5 结构倾向程度的计算结果及分析第59-63页
        3.5.1 氨基酸结构倾向性的检验结果及分析第59-61页
        3.5.2 氨基酸结构倾向度的度量结果及分析第61-63页
    3.6 氨基酸结构倾向度对IDPs结构预测性能影响的评价第63-65页
        3.6.1 氨基酸结构倾向度影响评价模型的评价方法第63-64页
        3.6.2 氨基酸结构倾向度影响的结果及分析第64-65页
    3.7 本章小结第65-66页
第4章 IDPs结构预测中特征组的构建第66-83页
    4.1 引言第66页
    4.2 IDPs结构预测建模中的常用特征第66-71页
        4.2.1 序列组成成分第66-68页
        4.2.2 疏水性第68-70页
        4.2.3 带电性第70页
        4.2.4 序列的复杂度第70-71页
        4.2.5 其他参数第71页
    4.3 现有IDPs特征选择方法分析第71-73页
        4.3.1 现有IDPs特征选择方法的优势第71-72页
        4.3.2 现有IDPs特征选择方法存在的问题第72-73页
    4.4 特征组的构造第73-76页
        4.4.1 信息的度量方法第73-75页
        4.4.2 基于信息熵的IDPs特征选择模型的构建第75-76页
    4.5 IDPs结构预测中特征组的构造结果及分析第76-77页
    4.6 特征组对IDPs结构预测性能的影响第77-82页
        4.6.1 特征组对IDPs结构预测性能影响的评价方法第77-79页
        4.6.2 特征组对IDPs结构预测性能影响的评价指标第79-80页
        4.6.3 特征组对IDPs结构预测性能影响的结果及分析第80-82页
    4.7 本章小结第82-83页
第5章 基于多尺度多特征融合的IDPs结构预测建模方法第83-101页
    5.1 引言第83页
    5.2 现有的IDPs结构预测建模方法第83-85页
        5.2.1 基于单一方式的IDPs结构预测建模方法第83-84页
        5.2.2 基于融合方式的IDPs结构预测建模方法第84-85页
    5.3 基于多模型融合的预测模型建模方法第85-91页
        5.3.1 基模型产生方法第86-88页
        5.3.2 基模型组合方式第88-89页
        5.3.3 基模型融合策略第89-91页
    5.4 基于多尺度多特征融合的IDPs预测模型的构建第91-96页
        5.4.1 数据预处理第91-93页
        5.4.2 基于多尺度多特征的基模型生成第93-95页
        5.4.3 IDPs融合预测模型的构建第95-96页
    5.5 IDPs融合预测模型的预测结果及分析第96-100页
    5.6 本章小结第100-101页
结论第101-103页
参考文献第103-111页
攻读博士学位期间发表的论文和取得的科研成果第111-112页
致谢第112页

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