摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第1章 绪论 | 第12-30页 |
1.1 课题研究的目的和意义 | 第12-14页 |
1.2 IDPs结构预测研究的现状 | 第14-26页 |
1.2.1 基于PONDRs的IDPs结构预测方法 | 第15-18页 |
1.2.2 基于特征分析的IDPs结构预测方法 | 第18-22页 |
1.2.3 基于智能算法的IDPs结构预测方法 | 第22-24页 |
1.2.4 基于集成建模的IDPs结构预测方法 | 第24-26页 |
1.3 论文的主要研究内容和组织结构 | 第26-30页 |
第2章 IDPs结构预测建模中滑窗尺度的选择方法 | 第30-48页 |
2.1 引言 | 第30页 |
2.2 IDPs生物学特点 | 第30-32页 |
2.3 IDPs序列信息的多尺度特性 | 第32-34页 |
2.3.1 IDPs序列长度的差异性 | 第33-34页 |
2.3.2 IDPs序列组成成分的差异性 | 第34页 |
2.4 基于滑窗技术的IDPs结构预测建模方法分析 | 第34-37页 |
2.4.1 IDPs结构预测中滑窗选择方法存在的问题 | 第34-36页 |
2.4.2 基于多尺度的IDPs结构预测建模方法的优势 | 第36-37页 |
2.5 基于差异度度量法的窗口尺度选择 | 第37-43页 |
2.5.1 差异度度量指标 | 第37-40页 |
2.5.2 IDPs结构预测中基模型的构建 | 第40-42页 |
2.5.3 基于差异度度量法的窗口尺度选择模型的构建 | 第42-43页 |
2.6 基于差异度度量法的滑窗尺度选择结果及分析 | 第43-47页 |
2.6.1 实验数据及评价指标 | 第43-44页 |
2.6.2 IDPs结构预测中滑窗选择的结果及分析 | 第44-46页 |
2.6.3 滑窗尺度对IDPs结构预测性能影响的结果及分析 | 第46-47页 |
2.7 本章小结 | 第47-48页 |
第3章 IDPs结构预测中氨基酸结构倾向度的计算方法 | 第48-66页 |
3.1 引言 | 第48页 |
3.2 基于结构倾向性的特征向量的分析 | 第48-50页 |
3.3 氨基酸结构倾向性的检验 | 第50-56页 |
3.3.1 基于Fisher的氨基酸结构倾向性的检验 | 第50-53页 |
3.3.2 基于错误发现率的检验控制 | 第53-56页 |
3.4 氨基酸结构倾向度的计算 | 第56-59页 |
3.4.1 氨基酸结构倾向度的计算方法 | 第56-58页 |
3.4.2 氨基酸结构倾向度表的构建方法 | 第58-59页 |
3.5 结构倾向程度的计算结果及分析 | 第59-63页 |
3.5.1 氨基酸结构倾向性的检验结果及分析 | 第59-61页 |
3.5.2 氨基酸结构倾向度的度量结果及分析 | 第61-63页 |
3.6 氨基酸结构倾向度对IDPs结构预测性能影响的评价 | 第63-65页 |
3.6.1 氨基酸结构倾向度影响评价模型的评价方法 | 第63-64页 |
3.6.2 氨基酸结构倾向度影响的结果及分析 | 第64-65页 |
3.7 本章小结 | 第65-66页 |
第4章 IDPs结构预测中特征组的构建 | 第66-83页 |
4.1 引言 | 第66页 |
4.2 IDPs结构预测建模中的常用特征 | 第66-71页 |
4.2.1 序列组成成分 | 第66-68页 |
4.2.2 疏水性 | 第68-70页 |
4.2.3 带电性 | 第70页 |
4.2.4 序列的复杂度 | 第70-71页 |
4.2.5 其他参数 | 第71页 |
4.3 现有IDPs特征选择方法分析 | 第71-73页 |
4.3.1 现有IDPs特征选择方法的优势 | 第71-72页 |
4.3.2 现有IDPs特征选择方法存在的问题 | 第72-73页 |
4.4 特征组的构造 | 第73-76页 |
4.4.1 信息的度量方法 | 第73-75页 |
4.4.2 基于信息熵的IDPs特征选择模型的构建 | 第75-76页 |
4.5 IDPs结构预测中特征组的构造结果及分析 | 第76-77页 |
4.6 特征组对IDPs结构预测性能的影响 | 第77-82页 |
4.6.1 特征组对IDPs结构预测性能影响的评价方法 | 第77-79页 |
4.6.2 特征组对IDPs结构预测性能影响的评价指标 | 第79-80页 |
4.6.3 特征组对IDPs结构预测性能影响的结果及分析 | 第80-82页 |
4.7 本章小结 | 第82-83页 |
第5章 基于多尺度多特征融合的IDPs结构预测建模方法 | 第83-101页 |
5.1 引言 | 第83页 |
5.2 现有的IDPs结构预测建模方法 | 第83-85页 |
5.2.1 基于单一方式的IDPs结构预测建模方法 | 第83-84页 |
5.2.2 基于融合方式的IDPs结构预测建模方法 | 第84-85页 |
5.3 基于多模型融合的预测模型建模方法 | 第85-91页 |
5.3.1 基模型产生方法 | 第86-88页 |
5.3.2 基模型组合方式 | 第88-89页 |
5.3.3 基模型融合策略 | 第89-91页 |
5.4 基于多尺度多特征融合的IDPs预测模型的构建 | 第91-96页 |
5.4.1 数据预处理 | 第91-93页 |
5.4.2 基于多尺度多特征的基模型生成 | 第93-95页 |
5.4.3 IDPs融合预测模型的构建 | 第95-96页 |
5.5 IDPs融合预测模型的预测结果及分析 | 第96-100页 |
5.6 本章小结 | 第100-101页 |
结论 | 第101-103页 |
参考文献 | 第103-111页 |
攻读博士学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第111-112页 |
致谢 | 第112页 |