| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第15-39页 |
| 1.1 电化学葡萄糖生物传感器 | 第15-18页 |
| 1.1.1 糖尿病与血糖检测 | 第15-16页 |
| 1.1.2 电化学葡萄糖传感器的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2 纳米材料在葡萄糖传感器中的应用 | 第18-30页 |
| 1.2.1 基于氧化锌纳米材料的葡萄糖传感器的研究进展 | 第18-21页 |
| 1.2.2 基于金纳米材料的葡萄糖传感器的研究进展 | 第21-24页 |
| 1.2.3 基于碳纳米管材料的葡萄糖传感器的研究进展 | 第24-30页 |
| 1.3 分子动力学模拟在生物传感器中的应用 | 第30-36页 |
| 1.4 本文主要研究内容 | 第36-39页 |
| 第二章 分子动力学模拟计算研究方法 | 第39-67页 |
| 2.1 分子动力学简介 | 第39-44页 |
| 2.1.1 分子构象变化的研究 | 第40页 |
| 2.1.2 过膜运输的研究 | 第40-42页 |
| 2.1.3 蛋白折叠的研究 | 第42-43页 |
| 2.1.4 配体结合的研究 | 第43-44页 |
| 2.2 基本原理和运动方程 | 第44-47页 |
| 2.2.1 基本原理 | 第44-45页 |
| 2.2.2 运动方程的数值解法 | 第45-47页 |
| 2.3 分子力场 | 第47-52页 |
| 2.3.1 键的伸缩项(U_b) | 第48-49页 |
| 2.3.2 键角弯曲项(U_θ) | 第49页 |
| 2.3.3 二面角扭曲项(U_Φ) | 第49页 |
| 2.3.4 离平面震动项(U_χ) | 第49-50页 |
| 2.3.5 非键结势能(U_(nb)) | 第50-51页 |
| 2.3.6 几种常见的力场 | 第51-52页 |
| 2.4 周期性边界条件 | 第52-54页 |
| 2.5 能量最小化 | 第54-56页 |
| 2.5.1 势能图与势能面 | 第55页 |
| 2.5.2 利用函数的导数求极小值 | 第55-56页 |
| 2.6 操控式分子动力学模拟(SMD) | 第56-58页 |
| 2.6.1 平均力势 | 第56-57页 |
| 2.6.2 操控式分子动力学原理 | 第57-58页 |
| 2.7 NAMD分子动力学仿真软件 | 第58-67页 |
| 2.7.1 NAMD软件设计 | 第59-64页 |
| 2.7.2 NAMD在生物分子计算中的应用 | 第64-67页 |
| 第三章 电化学酶生物传感器纳米孔洞结构对酶活性影响的分子动力学模拟 | 第67-94页 |
| 3.1 引言 | 第67-69页 |
| 3.2 实验方法 | 第69-72页 |
| 3.2.1 仿真体系的建立 | 第69-72页 |
| 3.2.2 仿真过程的设置 | 第72页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第72-90页 |
| 3.3.1 初始取向为1-original的GOD在ZnO基底上的分子动力学模拟 | 第73-78页 |
| 3.3.2 初始取向为2-x[90°]的GOD在ZnO基底上的分子动力学模拟 | 第78-82页 |
| 3.3.3 初始取向为1-original的GOD在Au基底上的分子动力学模拟 | 第82-84页 |
| 3.3.4 初始取向为2-x[90°]的GOD在Au基底上的分子动力学模拟 | 第84-90页 |
| 3.4 本章小结 | 第90-94页 |
| 第四章 FAD修饰不同电性碳纳米管的分子动力学模拟 | 第94-117页 |
| 4.1 引言 | 第94-96页 |
| 4.2 实验方法 | 第96-99页 |
| 4.2.1 碳纳米管与FAD仿真体系的建立 | 第96-98页 |
| 4.2.2 碳纳米管与FAD仿真体系的过程 | 第98-99页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第99-114页 |
| 4.3.1 FAD修饰不同电性SWNT体系的RMSD与质心归一化距离 | 第100-102页 |
| 4.3.2 FAD修饰电中性SWNT的分子动力学模拟 | 第102-105页 |
| 4.3.3 FAD修饰带正电SWNT的分子动力学模拟 | 第105-107页 |
| 4.3.4 FAD修饰带负电SWNT的分子动力学模拟 | 第107-110页 |
| 4.3.5 FAD修饰不同电性SWNT的操控式分子动力学模拟 | 第110-114页 |
| 4.4 本章小结 | 第114-117页 |
| 第五章 总结与展望 | 第117-122页 |
| 5.1 总结 | 第117-118页 |
| 5.2 创新点 | 第118-119页 |
| 5.3 展望 | 第119-122页 |
| 参考文献 | 第122-145页 |
| 攻读博士学位期间主要的研究成果 | 第145-146页 |
