| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 绪论 | 第9-17页 |
| ·植物授粉过程中雌雄配子体的相互作用 | 第9页 |
| ·植物花粉管和柱头的多组学研究进展 | 第9-12页 |
| ·植物花粉的组学研究进展 | 第10-11页 |
| ·植物柱头的组学研究进展 | 第11页 |
| ·拟南芥花粉管与柱头互作的组学研究进展 | 第11-12页 |
| ·计算系统生物学 | 第12-13页 |
| ·生物复杂网络 | 第13-15页 |
| ·研究目的及意义 | 第15页 |
| ·研究方法及技术路线 | 第15-17页 |
| ·研究方法 | 第16页 |
| ·技术路线 | 第16-17页 |
| 2 材料、数据及采用的技术方法 | 第17-35页 |
| ·拟南芥花粉管与柱头互作的转录组学数据处理 | 第17-22页 |
| ·拟南芥花粉管与柱头互作的柱头转录组学数据 | 第17-18页 |
| ·拟南芥花粉管与柱头互作的花粉管转录组学数据 | 第18页 |
| ·花粉管与柱头互作全基因转录组表达源数据处理 | 第18-22页 |
| ·拟南芥花粉管和柱头互作过程中的差异基因 | 第22-23页 |
| ·数据库设计 | 第23-32页 |
| ·数据库概念设计 | 第23-27页 |
| ·数据库逻辑设计 | 第27-28页 |
| ·表结构说明 | 第28-30页 |
| ·导入Oracle数据库 | 第30-32页 |
| ·SAM差异基因分析 | 第32-35页 |
| 3 拟南芥全基因酶-酶代谢互作网络的构建 | 第35-39页 |
| 4 拟南芥花粉管与柱头全基因代谢互作网络的挖掘 | 第39-51页 |
| ·拟南芥花粉管和柱头在授粉过程中特异表达基因与酶编码基因 | 第39-40页 |
| ·特异表达基因与酶编码基因的匹配 | 第39-40页 |
| ·共表达模式 | 第40页 |
| ·拟南芥花粉管和柱头的差异基因所编码酶的子网络的构建 | 第40-41页 |
| ·基因本体分析 | 第41-44页 |
| ·聚类分析 | 第44-45页 |
| ·ClusterOne | 第44页 |
| ·拟南芥花粉管与柱头差异基因的聚类分析 | 第44-45页 |
| ·拟南芥花粉管中乙醇二级代谢和TCA代谢途径上酶基因的特异表达 | 第45-47页 |
| ·拟南芥柱头中糖酵解代谢途径上酶基因的特异表达 | 第47-49页 |
| ·拟南芥花粉管与柱头互作的乙醇代谢耦合模型 | 第49-51页 |
| 5 结束语 | 第51-52页 |
| 参考 文献 | 第52-56页 |
| 附录 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第61页 |
