| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 目录 | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-14页 |
| ·概述 | 第7-8页 |
| ·遗漏基因预测的研究进展 | 第8-11页 |
| ·同源比对方法 | 第8-9页 |
| ·从头预测方法 | 第9-10页 |
| ·比较基因组学方法 | 第10-11页 |
| ·立题背景 | 第11-12页 |
| ·知识库容量对同源比对方法应用的限制 | 第11页 |
| ·蛋白质序列模式及蛋白质序列模式数据库 | 第11-12页 |
| ·蛋白质序列模式扫描工具 InterProScan | 第12页 |
| ·主要研究内容 | 第12-14页 |
| 第二章 材料与方法 | 第14-21页 |
| ·实验材料 | 第14-15页 |
| ·基因组 | 第14-15页 |
| ·软件及数据库 | 第15页 |
| ·实验方法 | 第15-21页 |
| ·最大 ORF 的获取 | 第17页 |
| ·已知蛋白质同源基因的搜索 | 第17-18页 |
| ·与已知蛋白质同源基因重叠的 ORF 的剔除 | 第18页 |
| ·最大 ORF 的蛋白质序列模式扫描及未注释 ORF 的搜索 | 第18页 |
| ·随机序列样本的蛋白质序列模式扫描 | 第18-19页 |
| ·移框分析 | 第19页 |
| ·比较基因组学分析 | 第19-20页 |
| ·基因结构分析 | 第20-21页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第21-34页 |
| ·疑似基因的获取 | 第21-24页 |
| ·基因组中所有最大 ORF 的获取 | 第21-22页 |
| ·Swiss-Prot 同源比对搜索可覆盖基因范围的确定 | 第22页 |
| ·蛋白质序列模式系统扫描可覆盖基因范围的确定 | 第22-23页 |
| ·疑似基因的获取 | 第23-24页 |
| ·阶段小结 | 第24页 |
| ·随机序列样本的蛋白质序列模式分析及 InterProScan 输出的基因覆盖率分析 | 第24-25页 |
| ·蛋白质序列模式扫描对同源比对搜索覆盖的基因范围的拓展分析 | 第25页 |
| ·疑似基因的分析 | 第25-34页 |
| ·疑似基因的移框分析 | 第26-28页 |
| ·疑似基因的比较基因组学分析 | 第28-33页 |
| ·疑似基因的基因结构分析 | 第33-34页 |
| 主要结论与展望 | 第34-36页 |
| 主要结论 | 第34页 |
| 展望 | 第34-36页 |
| 致谢 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-41页 |
| 附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第41页 |
