| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-24页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第8-13页 |
| ·共进化现象 | 第13-16页 |
| ·灭绝事件及其生物学意义 | 第16-19页 |
| ·适者生存的特殊实例 | 第19-24页 |
| 第二章 蛋白质网络的共进化 | 第24-40页 |
| ·酵母蛋白质相互作用网络的构建 | 第24-26页 |
| ·蛋白质共进化关系的确定 | 第26-27页 |
| ·共进化关系是一种短程效应 | 第27-30页 |
| ·共进化和蛋白质网络的模块结构 | 第30-34页 |
| ·蛋白质复合物是紧密共进化单位 | 第34-37页 |
| ·结果与讨论 | 第37-40页 |
| 第三章 灭绝对进化的影响 | 第40-60页 |
| ·进化模型的建立 | 第40-46页 |
| ·灭绝事件导致进化的加速 | 第46-49页 |
| ·如何跳出局部最优 | 第49-53页 |
| ·灭绝事件对遗传多样性的影响 | 第53-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-60页 |
| 参考文献 | 第60-72页 |
| 发表和已撰写文章目录 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |