| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第1章 绪论(~(13)C MFA 在氧化应激中的运用介绍) | 第13-39页 |
| ·引言 | 第13页 |
| ·活性氧 | 第13-19页 |
| ·超氧阴离子 | 第16-17页 |
| ·过氧化氢 | 第17页 |
| ·羟基自由基 | 第17-19页 |
| ·氧化应激和氧化应激系统 | 第19-27页 |
| ·抗氧化应激和抗氧化剂 | 第20-26页 |
| ·防御氧化应激的调节子 | 第26-27页 |
| ·MFA (Metabolic Flux Analysis)方法的运用 | 第27-39页 |
| ·MFA 概论 | 第27-29页 |
| ·基于碳标记实验的代谢通量分析进程 | 第29-31页 |
| ·代谢流分析及其在代谢工程中的应用 | 第31-33页 |
| ·代谢组学——一门系统生物学的新型学科 | 第33-35页 |
| ·以E.coli.JM101 为模型，运用 MFA 研究其氧化应激的机制 | 第35-39页 |
| 第2章 材料和方法 | 第39-61页 |
| ·菌株、培养基和生长条件 | 第39-41页 |
| ·菌株和氧化应激诱导剂的选择 | 第39页 |
| ·培养基和生长条件 | 第39-41页 |
| ·分析方法 | 第41-61页 |
| ·光密度（OD600）的测定 | 第41-42页 |
| ·细胞干重（CDW）的测定 | 第42页 |
| ·细胞总蛋白含量的测量 | 第42页 |
| ·细胞中总 RNA 含量的测量 | 第42-43页 |
| ·胞外代谢产物的分析 | 第43-45页 |
| ·酶活性的检测 | 第45-46页 |
| ·发酵罐的恒化培养 | 第46-49页 |
| ·细胞总RNA 的提取 | 第49-50页 |
| ·RT-PCR 实验 | 第50页 |
| ·E.coli.JM101 菌株电击转化感受态细胞的制备 | 第50-51页 |
| ·大肠杆菌JM101 菌株zwf 基因敲除 | 第51-52页 |
| ·paraquat 的敏感性实验 | 第52-53页 |
| ·NMR 样品的制备 | 第53页 |
| ·NMR 数据记录 | 第53-55页 |
| ·GC-MS 的样品制备 | 第55页 |
| ·GC-MS 参数的设置 | 第55-56页 |
| ·代谢网络模型的建立和代谢通量的估算 | 第56-61页 |
| 第3章 结果与讨论 | 第61-81页 |
| ·实验结果 | 第61-69页 |
| ·大肠杆菌对paraquat 的耐受过程 | 第61-62页 |
| ·氧化应激诱导剂-paraquat 浓度的选择 | 第62页 |
| ·OD 和p02 的关系 | 第62-63页 |
| ·在paraquat(PQ)诱导的氧化应激条件下E.coli.JM101的生长参数和代谢物生成量的变化 | 第63页 |
| ·代谢流量的分布 | 第63-66页 |
| ·细胞内的 NADPH:NADH 的变化 | 第66页 |
| ·相关酶活的变化 | 第66-67页 |
| ·相关酶基因表达的变化 | 第67-68页 |
| ·E.coli JM101 的zwf -突变体对paraquat 的敏感性试验 | 第68-69页 |
| ·讨论部分 | 第69-81页 |
| ·氧化应激诱导剂的选择和百草枯浓度的确定 | 第69页 |
| ·在PQ 诱导的氧化应激状况下细胞内NADPH 增加和NADH 减少的可能机制 | 第69-75页 |
| ·α-酮戊二酸在PQ 氧化应激条件下的积累效应 | 第75-77页 |
| ·代谢网络中包括ED pathway 前后流量的对比 | 第77-79页 |
| ·我们的讨论和结论的有效性 | 第79页 |
| ·我们研究中的创新点 | 第79-80页 |
| ·我们的研究工作在系统水平上的意义 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-91页 |
| 附录 | 第91-99页 |
| 致谢 | 第99-101页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第101-102页 |
