| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-29页 |
| 1 文昌鱼的概况 | 第11-13页 |
| 2 文昌鱼的研究现状 | 第13-20页 |
| ·文昌鱼的发育和进化生物学研究 | 第14-17页 |
| ·文昌鱼的免疫生物学研究 | 第17-20页 |
| 3 GNBP基因的研究进展 | 第20-22页 |
| 4 LITAF基因的研究进展 | 第22-23页 |
| 5 免疫相关microRNA的研究进展 | 第23-26页 |
| 6 本论文研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 7 本论文的创新点 | 第27-28页 |
| 8 本论文的技术路线 | 第28-29页 |
| 第二章 佛罗里达文昌鱼EST数据库的建立 | 第29-37页 |
| 1 前言 | 第29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-31页 |
| ·EST的聚类拼接及后期处理 | 第29-30页 |
| ·同源搜索及功能注释 | 第30页 |
| ·EST中miRNA的预测 | 第30页 |
| ·cDNA预测及microRNA靶标预测 | 第30页 |
| ·文昌鱼EST数据库(AmphiEST)的建立 | 第30-31页 |
| 3 结果与讨论 | 第31-37页 |
| ·文昌鱼EST序列的组装 | 第31-32页 |
| ·基因功能注释 | 第32-34页 |
| ·ORF的预测 | 第34页 |
| ·不同发育阶段microRNA的表达分析 | 第34-35页 |
| ·不同发育阶段microRNA靶标的预测 | 第35-36页 |
| ·EST数据库的构建 | 第36-37页 |
| 第三章 文昌鱼GNBP基因的克隆、鉴定及功能研究 | 第37-73页 |
| 1 前言 | 第37-38页 |
| 2 材料与方法 | 第38-50页 |
| ·文昌鱼的来源与培养 | 第38页 |
| ·实验材料 | 第38页 |
| ·实验仪器 | 第38-39页 |
| ·实验方法 | 第39-50页 |
| 3 结果与分析 | 第50-68页 |
| ·文昌鱼总RNA的提取 | 第50-51页 |
| ·GNBP基因中间片段的克隆 | 第51页 |
| ·GNBP基因全长的扩增 | 第51-53页 |
| ·GNBP基因序列分析 | 第53-65页 |
| ·GNBP基因在不同组织中的表达 | 第65-67页 |
| ·LPS刺激对GNBP基因表达量变化的影响 | 第67-68页 |
| 4 讨论 | 第68-73页 |
| 第四章 文昌鱼LITAF基因的克隆、鉴定及功能研究 | 第73-99页 |
| 1 前言 | 第73页 |
| 2 材料与方法 | 第73-86页 |
| ·文昌鱼的来源与培养 | 第73页 |
| ·实验材料 | 第73-74页 |
| ·实验仪器 | 第74页 |
| ·实验方法 | 第74-86页 |
| 3 结果与分析 | 第86-96页 |
| ·文昌鱼总RNA的提取 | 第86-87页 |
| ·LITAF基因中间片段的克隆 | 第87-88页 |
| ·LITAF基因全长的扩增 | 第88-90页 |
| ·LITAF基因序列分析 | 第90-94页 |
| ·LITAF基因在不同组织中的表达 | 第94-95页 |
| ·LPS刺激对LITAF基因表达量变化的影响 | 第95-96页 |
| 4 讨论 | 第96-99页 |
| 第五章 文昌鱼免疫相关microRNA的初步分析 | 第99-116页 |
| 1 前言 | 第99-100页 |
| 2 材料与方法 | 第100-103页 |
| ·文昌鱼的处理 | 第100页 |
| ·文昌鱼总RNA的提取 | 第100页 |
| ·文昌鱼小RNA的深度测序 | 第100-101页 |
| ·文昌鱼microRNA的芯片分析 | 第101页 |
| ·文昌鱼microRNA的实时定量分析 | 第101-102页 |
| ·文昌鱼microRNA的靶基因预测 | 第102-103页 |
| 3 结果与分析 | 第103-112页 |
| ·文昌鱼小RNA深度测序结果分析 | 第103-106页 |
| ·microRNA芯片结果分析 | 第106-109页 |
| ·免疫相关microRNA实时定量结果分析 | 第109-110页 |
| ·免疫相关microRNA靶基因分析 | 第110-112页 |
| 4 讨论 | 第112-116页 |
| 总结与展望 | 第116-117页 |
| 参考文献 | 第117-137页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第137-138页 |
| 致谢 | 第138页 |