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水稻组蛋白去乙酰化酶基因的分离和功能鉴定

缩略词表第1-8页
中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
1.文献综述第12-33页
   ·组蛋白乙酰化的表观遗传基础第12-16页
     ·染色质的基本结构单位——核小体第12-13页
     ·异染色质与染色质沉默第13-14页
     ·染色质重建是基因表达调控过程中的重要环节第14页
     ·染色质调节因子第14-15页
     ·组蛋白修饰及其在基因调节中的作用和机制第15-16页
     ·组蛋白乙酰化模式在发育过程中的传递第16页
   ·组蛋白乙酰化在基因转录调控中的作用第16-22页
     ·组蛋白乙酰化位点第16-17页
     ·组蛋白乙酰化对染色质结构的作用机制第17页
     ·组蛋白乙酰化酶(Histone Acetyltransferase/HAT)第17-19页
       ·组蛋白乙酰化酶的分类第17-18页
       ·组蛋白乙酰转移酶(HAT)的作用方式第18-19页
     ·组蛋白去乙酰化酶(Histone Deacetylase/HDAC)第19-21页
       ·组蛋白去乙酰化酶的分类第19-21页
       ·组蛋白去乙酰化酶(HDAC)的作用方式第21页
     ·组蛋白去乙酰化酶基因在植物基因调控和发育中的作用第21-22页
   ·与本研究有关的DNA甲基化研究进展第22-25页
     ·植物DNA甲基化特征第22-23页
     ·植物DNA甲基转移酶第23-24页
     ·植物DNA甲基化的生物学功能第24页
     ·DNA甲基化与植物转座因子活动第24-25页
       ·转座因子及其结构特点第24-25页
       ·DNA甲基化对转座因子的调节第25页
   ·与本研究有关的细胞程序性死亡的研究现状第25-27页
     ·细胞程序性死亡的概述第25页
     ·植物PCD的特征第25-26页
     ·植物PCD的相关基因及其调控信号第26页
     ·植物超敏反应与PCD第26-27页
   ·植物染色质因子及细胞程序性死亡的研究方法第27-31页
     ·功能获得与缺失第27-28页
     ·染色质免疫沉淀第28-29页
     ·DNA甲基化第29-30页
     ·基因芯片第30-31页
     ·TUNEL assay第31页
   ·本研究的目的和意义第31-33页
2 材料与方法第33-48页
   ·水稻材料第33页
   ·水稻组蛋白去乙酰化酶基因的整理和归类第33页
   ·序列分析第33-34页
   ·水稻组蛋白去乙酰化酶(HDAC)基因的获取第34页
   ·载体的构建第34-35页
     ·转化载体第34页
     ·亚细胞定位载体第34-35页
   ·遗传转化第35-36页
   ·总DNA抽提与SOUTHERN杂交第36-37页
   ·RNA抽提、RT-PCR和NORTHERN杂交第37-38页
   ·水稻全基因组芯片分析第38-39页
   ·活性氧(ROS)积累的检测第39页
   ·原位TUNEL分析第39-40页
   ·GFP观察第40-41页
   ·组蛋白抽提和WESTERN印迹第41页
   ·染色质免疫沉淀和定量PCR分析第41-42页
   ·氧化胁迫处理第42-43页
   ·DNA胞嘧啶甲基化分析第43-48页
3 结果与分析第48-97页
   ·水稻基因组中组蛋白去乙酰化酶基因的分离克隆与转基因材料的获得第48-67页
     ·组蛋白去乙酰化酶基因全长编码序列的获得与序列分析第48-64页
       ·RPD3/HDA1超家族HDAC基因克隆与序列分析第48-54页
       ·HD2家族组蛋白去乙酰化酶基因克隆与序列分析第54-60页
       ·SIR2家族组蛋白去乙酰化酶基因克隆与序列分析第60-64页
     ·遗传转化材料的获得第64-67页
       ·抑制表达载体的构建第64页
       ·超量表达转化载体的构建第64-65页
       ·农杆菌介导的转化第65页
       ·转基因植株的阳性检测和拷贝数分析第65-67页
   ·转基因材料分析与HDAC功能研究第67-97页
     ·组蛋白去乙酰化酶基因OsSRT1对程序性细胞死亡的调控作用第67-91页
       ·OsSRT1基因结构分析第67-69页
       ·OsSRT1表达模式第69-70页
       ·OsSRT1的亚细胞定位第70-71页
       ·OsSRT1的抑制表达家系出现假病斑表型第71-75页
       ·OsSRT1抑制表达诱导水稻植株的氧爆发第75-76页
       ·OsSRT1转基因假病斑植株中TUNEL测定第76-77页
       ·OsSRT1超量表达增加了植株的氧化胁迫耐受能力第77-79页
       ·OsSRT1的抑制表达表达植株水稻全基因组芯片分析第79-85页
       ·OsSRT1 RNAi诱导转座因子和PCD标志基因的H3K9乙酰化第85-88页
       ·胞嘧啶甲基化分析第88-90页
       ·转座分析第90-91页
     ·OsHDT702表达受到抑制后对水稻叶片形态的影响第91-93页
     ·OsHDA710表达受到抑制后对水稻植株高度的影响第93-97页
4 讨论第97-100页
   ·OsSRT1可能具有更加广泛的功能第97-98页
   ·OsSRT1在细胞程序性死亡途径的调控作用第98页
   ·OsSRT1在保持基因组的稳定性上的重要性第98-100页
参考文献第100-112页
附录Ⅰ 部分实验的操作流程第112-119页
附录Ⅱ 简历第119-120页
致谢第120页

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