| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-14页 |
| 缩略词表 | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-55页 |
| 引言 | 第16页 |
| 第一节 植物与病原物互作分子机制研究进展 | 第16-34页 |
| 1.植物与病原菌互作概述 | 第16-18页 |
| 2.植物对病原物信号的识别机制 | 第18-21页 |
| 3.活性氧产生与清除机制 | 第21-22页 |
| 4.蛋白磷酸酶与激酶 | 第22-23页 |
| 5.钙离子结合蛋白 | 第23-24页 |
| 6.G蛋白类 | 第24-25页 |
| 7.抗逆转录因子 | 第25-27页 |
| 8.泛素—26S蛋白酶降解途径 | 第27-28页 |
| 9.抗病相关激素合成与信号通路 | 第28-31页 |
| 10.植物抗病性物质的合成 | 第31-34页 |
| 第二节 芸薹属功能基因组学与结球大白菜软腐病研究进展 | 第34-40页 |
| 1.芸薹属作物功能基因组研究进展 | 第34-36页 |
| 2.软腐病菌致病特点及其致病分子机制研究进展 | 第36-40页 |
| 第三节 EST技术特征及其应用 | 第40-46页 |
| 1.EST技术概述与获取 | 第40-41页 |
| 2.生物信息学在分析EST数据中的应用 | 第41-44页 |
| 3.EST的应用 | 第44-46页 |
| 第四节 DNA芯片的技术特征及其应用 | 第46-52页 |
| 1.DNA芯片技术简介 | 第46页 |
| 2.DNA芯片的类型与制作方式 | 第46-47页 |
| 3.DNA芯片分析样品的标记与制备 | 第47页 |
| 4.DNA芯片的扫描 | 第47页 |
| 5.DNA芯片数据分析 | 第47-50页 |
| 6.DNA芯片的应用 | 第50-52页 |
| 第五节 本研究的目的、意义与技术路线 | 第52-55页 |
| 1.立题目的和意义 | 第52-53页 |
| 2.技术路线 | 第53-55页 |
| 第二章 结球大白菜表达序列标签(ESTS)的获取、生物信息学分析和ESTS数据库的构建 | 第55-79页 |
| 前言 | 第55页 |
| 第一节 材料与方法 | 第55-60页 |
| 1.材料 | 第55-56页 |
| 2.方法 | 第56-60页 |
| 第二节 结果与分析 | 第60-75页 |
| 1.高质量ESTs数据的获取 | 第60页 |
| 2.新序列频率的评估 | 第60-61页 |
| 3.ESTs的ASSEMBLY分析 | 第61-62页 |
| 4.ESTs序列的BLAST(x)分析与功能分类 | 第62-64页 |
| 5.SSH cDNA库中出现频率较高的基因信息统计分析 | 第64-67页 |
| 6.公共数据库中同时期结球大白菜ESTs序列比较分析 | 第67页 |
| 7.结球大白菜UNIESTs的类似物在拟南芥染色体上的"定位" | 第67-68页 |
| 8.数据库的构建 | 第68-70页 |
| 9.数据格式转换及对数据库操作应用程序的开发与升级: | 第70-75页 |
| 第三节 讨论 | 第75-79页 |
| 1.结球大白菜SSH cDNA文库质量的评价 | 第75-76页 |
| 2.结球大白菜ESTs在比较基因组学及抗软腐病分子机制研究中的价值 | 第76页 |
| 3.软腐病菌胁迫下结球大白菜多基因表达符合植物疾病防卫的一般机制 | 第76-77页 |
| 4.生物信息学工具在分析结球大白菜ESTs中的应用 | 第77-79页 |
| 第三章 软腐病致病过程中结球大白菜基因表达谱分析 | 第79-107页 |
| 前言 | 第79页 |
| 第一节 材料与方法 | 第79-88页 |
| 1.材料 | 第79页 |
| 2.方法 | 第79-88页 |
| 第二节 结果与分析 | 第88-100页 |
| 1.四个软腐欧文氏菌致病因子基因片段作为阴性对照探针 | 第88-89页 |
| 2.不同品种对软腐病菌的反应特征与抗病材料的抗性鉴定 | 第89页 |
| 3.挑选出4128个克隆,用于制作探针模板 | 第89-90页 |
| 4.RNA提取与检测 | 第90-91页 |
| 5.生物芯片的制备和杂交 | 第91-94页 |
| 6.不同时间点基因差异表达明显 | 第94-100页 |
| 第三节 讨论 | 第100-107页 |
| 1.基因芯片及杂交质量的控制 | 第100页 |
| 2.cDNA芯片杂交结果与探针来源相关性分析 | 第100-101页 |
| 3.植物防卫反应相关基因的表达谱分析 | 第101-105页 |
| 4.下调表达基因类型 | 第105-107页 |
| 第四章 软腐病菌侵染过程中结球大白菜木质素含量及其相关基因表达分析 | 第107-128页 |
| 前言 | 第107页 |
| 第一节 材料与方法 | 第107-117页 |
| 1.材料种植、接种、取材与DAB染色 | 第107-108页 |
| 2.木质素含量检测 | 第108-109页 |
| 3.RNA提取 | 第109页 |
| 4.木质素合成基因C4H和CCoAOMT全长cDNA的克隆与分析 | 第109-113页 |
| 5.引物设计、RT-PCR扩增与克隆 | 第113-117页 |
| 第二节 结果与分析 | 第117-125页 |
| 1.DAB染色观察接种Ecc后症状变化 | 第117页 |
| 2.KLASON木质素检测 | 第117-118页 |
| 3.木质素单体变化 | 第118-119页 |
| 4.结球大白菜C4H和CCoAOMT全长cDNA克隆与分析 | 第119-122页 |
| 5.木质素合成途径相关基因表达分析 | 第122-125页 |
| 第三节 讨论 | 第125-128页 |
| 1.结球大白菜"防卫"木质素单体组成比例与发育木质素不同 | 第125-126页 |
| 2.结球大白菜木质素合成途径基因被软腐病菌诱导增强表达 | 第126-127页 |
| 3.结球大白菜木质素合成途径基因表达变化与木质素单体变化相一致 | 第127-128页 |
| 全文总结与创新点 | 第128-130页 |
| 1.全文结论 | 第128-129页 |
| 2.创新点 | 第129-130页 |
| 参考文献 | 第130-150页 |
| 附件与附表 | 第150-187页 |
| 附件1:用于提取ESTs BLAST(x)注释结果的PERL程序 | 第150-153页 |
| 附表2.接种后0.5、2、6、9、12和24小时的差异表达基因 | 第153-187页 |
| 致谢 | 第187-188页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第188页 |
