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披碱草属遗传多样性、P基因组特异重复序列克隆和小麦EST-SSR标记开发

摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
第一部分 披碱草属植物的遗传多样性分析第15-62页
 1 引言第16-27页
   ·披碱草属植物的分类学状况第16-17页
   ·系统演化和遗传多样性研究的方法第17-22页
     ·形态学研究第17页
     ·细胞学研究第17-19页
     ·生化标记第19页
     ·分子标记第19-22页
   ·遗传多样性研究的数据分析与取样策略第22-23页
     ·数据分析第22页
     ·取样策略第22-23页
   ·披碱草属植物的系统演化和遗传多样性第23-25页
     ·生化标记分析第23-24页
     ·披碱草属植物多样性的分子标记分析第24-25页
   ·问题与展望第25-26页
   ·本研究目的与意义第26-27页
 2 材料和方法第27-35页
   ·材料第27-29页
   ·实验方法第29-35页
     ·DNA的提取第29-30页
     ·SSR和ISSR分析第30-31页
     ·电泳第31-33页
     ·数据统计分析第33-35页
 3 结果与分析第35-56页
   ·ISSR和SSR在披碱草属植物分析中的标记效率研究第35-39页
     ·引物筛选第35-36页
     ·遗传多样性分析第36-37页
     ·ISSR和SSR标记的标记效率分析第37-39页
     ·ISSR和SSR标记相关性第39页
   ·中国境内Elymus dahuricus complex物种的遗传多样性分析第39-48页
     ·ISSR和SSR位点多态性与变异分布状况第39-41页
       ·SSR分析第39页
       ·ISSR分析第39-41页
     ·4个E.dahuricus complex物种的亲缘关系分析第41-48页
   ·中国境内E.sibiricus的遗传多样性分析第48-56页
     ·SSR引物的筛选第48页
     ·E.sibiricus的居群内遗传结构分析第48-49页
     ·E.sibiricus的居群的遗传分化状况研究第49-51页
     ·E.sibiricus在我国境内的的遗传变异分布状况第51-56页
 4 讨论第56-62页
   ·ISSR和SSR标记在披碱草属物种中的标记效率第56-58页
   ·中国境内E.dahuricus complex物种的遗传多样性和系统演化第58-59页
   ·中国境内E.sibiricus物种的遗传多样性第59-62页
第二部分 P基因组特异重复序列的克隆第62-95页
 1 引言第63-74页
   ·重复序列的种类、功能、应用和分离第63-71页
     ·重复序列的种类与特征第63-66页
       ·串联重复序列第63-66页
       ·散布重复序列第66页
     ·重复序列的功能第66-67页
     ·重复序列的应用第67-69页
       ·研究物种的起源和进化第67-68页
       ·外源遗传物质鉴定第68页
       ·染色体分子指纹图谱绘制第68-69页
       ·遗传作图构建第69页
     ·特异重复序列的分离方法第69-71页
       ·基因文库法第69页
       ·回收酶切产物中的特异DNA片断第69页
       ·回收Relic DNA第69-70页
       ·基因组探针法第70页
       ·基因组减法杂交法第70页
       ·回收特异RAPD片断法第70页
       ·带反馈控制的PCR增效减法杂交第70-71页
   ·小麦族重复序列研究概况第71-72页
     ·小麦属第71页
     ·黑麦属第71页
     ·大麦属第71页
     ·山羊草属第71-72页
     ·小麦族其它植物第72页
   ·P基因组重复序列研究现状第72页
   ·本研究的目的意义第72-74页
 2 材料与方法第74-84页
   ·试验材料第74页
   ·试验设计第74-76页
   ·实验方法第76-84页
     ·基因组总DNA的提取第76页
     ·RAPD分析第76页
     ·ISSR分析第76页
     ·基因组特异片段的回收、克隆第76-81页
       ·琼脂糖凝胶中DNA片段的回收与纯化第76-77页
       ·聚丙烯酰胺凝胶中DNA片段的回收第77页
       ·PCR产物连接第77-78页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第78页
       ·PCR产物的转化第78-79页
       ·菌液PCR检测第79-80页
       ·质粒提取第80-81页
       ·质粒酶切鉴定第81页
     ·Southern杂交第81-83页
     ·SCAR-PCR分析第83-84页
 3 结果与分析第84-93页
   ·RAPD扩增产物的特异重复序列克隆及应用第84-89页
     ·P基因组特异片段的RAPD筛选第84-85页
     ·P基因组特异片段的回收、克隆第85页
     ·特异DNA片段在基因组的分布第85-86页
     ·序列分析第86-87页
     ·SCAR标记的建立第87-89页
   ·ISSR扩增产物的特异重复序列克隆及应用第89-93页
     ·特异片断筛选第89-90页
     ·P基因组特异片断的回收、克隆第90页
     ·特异DNA片段在基因组的分布第90-91页
     ·序列分析第91-92页
     ·SCAR标记的建立第92-93页
 4 讨论第93-95页
   ·基因组特异重复序列分离方法比较第93页
   ·基因组演化关系第93-94页
   ·基因组特异重复序列的应用第94-95页
第三部分 EST-SSR标记的开发和作图第95-126页
 1 引言第96-100页
   ·EST-SSR的优点第97-98页
   ·EST中SSR的分布特点第98-99页
   ·本研究的目的意义第99-100页
 2 材料与方法第100-102页
   ·小麦EST-SSR序别的查找第100页
   ·EST-SSR引物的设计第100页
   ·植物材料第100-101页
   ·PCR扩增与电泳检测第101页
   ·遗传图谱绘制第101页
   ·EST序列功能分析第101-102页
 2 结果与分析第102-123页
   ·EST-SSR的特点与EST-SSR引物开发第102-109页
     ·EST数据库中SSR的频率与分布第102-103页
     ·引物设计和扩增结果检测第103-109页
   ·EST-SSR的缺体—四体定位第109-113页
     ·染色体定位第109页
     ·共线性关系第109-113页
   ·遗传图谱绘制第113-117页
   ·EST功能分析第117-123页
     ·EST的功能第117-118页
     ·推测功能的基因(EST)的染色体定位和遗传作图第118-123页
 3 讨论第123-126页
   ·EST-SSR的开发与作图第123页
   ·EST中SSR的出现频率第123-124页
   ·EST-SSR标记的共线性关系第124页
   ·EST-SSR的生物学功能分析第124-126页
参考文献第126-144页
致谢第144-145页
博士后期间主持的研究课题第145-146页
博士后期间发表的研究论文第146-148页
博士后期间撰写的论文第148页

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