0 前言 | 第1-10页 |
1 综述 分子生物学技术在水域微生物多样性研究中的应用 | 第10-18页 |
·分子杂交法 | 第11页 |
·聚合酶链式反应法(PCR) | 第11-12页 |
·克隆基因文库分析法 | 第12-13页 |
·基因指纹图谱技术 | 第13-15页 |
·单链构象多态性法(SSCP) | 第13页 |
·变性梯度凝胶电泳法(DGGE) | 第13-14页 |
·温度梯度凝胶电泳法(TGGE) | 第14页 |
·限制性酶切片段长度多态性法(RFLP) | 第14页 |
·限制性酶切末端片段长度多态性法(T-RFLP) | 第14-15页 |
·不同分子生物学方法的联合研究 | 第15-18页 |
2 材料与方法 | 第18-28页 |
·现场采样时间地点 | 第18页 |
·材料和试剂 | 第18-19页 |
·仪器 | 第19页 |
·现场水样的采集和处理 | 第19-20页 |
·微生物的培养和细胞收集 | 第20-21页 |
·大肠杆菌的液体培养和细胞收集 | 第20页 |
·湖水中细菌的稀释、培养、分离和计数和收集 | 第20-21页 |
·琼脂平板培养 | 第21页 |
·基因组DNA的提取 | 第21-22页 |
·细菌液体培养物基因组DNA的提取 | 第21-22页 |
·滤膜样品(现场采样)的基因组DNA提取 | 第22页 |
·琼脂糖凝胶电泳 | 第22页 |
·聚合酶链式反应 | 第22-26页 |
·引物的选择 | 第22-23页 |
·PCR反应体系组成和反应条件 | 第23-25页 |
·PCR反应体系组成 | 第23-24页 |
·PCR反应条件 | 第24-25页 |
·PCR产物的检测和纯化 | 第25-26页 |
·PCR产物的限制性酶切和纯化 | 第26页 |
·PCR产物的限制性酶切 | 第26页 |
·酶切产物的纯化 | 第26页 |
·分离酶切片段-T-RFLP图谱 | 第26-28页 |
3 结果与讨论 | 第28-43页 |
·DNA提取 | 第28-29页 |
·PCR | 第29-32页 |
·PCR引物的选择 | 第29-30页 |
·PCR污染的控制 | 第30-31页 |
·PCR的效率 | 第31-32页 |
·PCR产物的纯化 | 第32页 |
·酶切片段的分离和末端片段的检测 | 第32-41页 |
·空白试验、精确度和大肠杆菌T-RFLP图谱的预测和验证 | 第32-33页 |
·湖水细菌分离、纯培养菌株的检验 | 第33-37页 |
·湖水膜样T-RFLP分析 | 第37-41页 |
·细菌类群的分析 | 第37-40页 |
·自由生活的细菌和颗粒吸附细菌T-RFLP图谱比较 | 第40-41页 |
·平板培养的细菌和湖水膜样细菌T-RFLP图谱的比较 | 第41页 |
·T-RFLP方法与相应分析策略的优点与存在的问题 | 第41-43页 |
4 致谢 | 第43-44页 |
5 参考文献 | 第44-48页 |
6 附表1根据MspⅠ-T-RFLP数据分析RDP数据库中与湖水0.2-1μm膜样相似的微生物类群 | 第48-54页 |
7 附表2根据RsaⅠ-T-RFLP数据分析RDP数据库中与湖水1μm膜样相似的微生物类群 | 第54-55页 |