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浮游细菌遗传多样性分析的T-RFLP方法研究

0 前言第1-10页
1 综述 分子生物学技术在水域微生物多样性研究中的应用第10-18页
   ·分子杂交法第11页
   ·聚合酶链式反应法(PCR)第11-12页
   ·克隆基因文库分析法第12-13页
   ·基因指纹图谱技术第13-15页
     ·单链构象多态性法(SSCP)第13页
     ·变性梯度凝胶电泳法(DGGE)第13-14页
     ·温度梯度凝胶电泳法(TGGE)第14页
     ·限制性酶切片段长度多态性法(RFLP)第14页
     ·限制性酶切末端片段长度多态性法(T-RFLP)第14-15页
   ·不同分子生物学方法的联合研究第15-18页
2 材料与方法第18-28页
   ·现场采样时间地点第18页
   ·材料和试剂第18-19页
   ·仪器第19页
   ·现场水样的采集和处理第19-20页
   ·微生物的培养和细胞收集第20-21页
     ·大肠杆菌的液体培养和细胞收集第20页
     ·湖水中细菌的稀释、培养、分离和计数和收集第20-21页
     ·琼脂平板培养第21页
   ·基因组DNA的提取第21-22页
     ·细菌液体培养物基因组DNA的提取第21-22页
     ·滤膜样品(现场采样)的基因组DNA提取第22页
   ·琼脂糖凝胶电泳第22页
   ·聚合酶链式反应第22-26页
     ·引物的选择第22-23页
     ·PCR反应体系组成和反应条件第23-25页
       ·PCR反应体系组成第23-24页
       ·PCR反应条件第24-25页
     ·PCR产物的检测和纯化第25-26页
   ·PCR产物的限制性酶切和纯化第26页
     ·PCR产物的限制性酶切第26页
     ·酶切产物的纯化第26页
   ·分离酶切片段-T-RFLP图谱第26-28页
3 结果与讨论第28-43页
   ·DNA提取第28-29页
   ·PCR第29-32页
     ·PCR引物的选择第29-30页
     ·PCR污染的控制第30-31页
     ·PCR的效率第31-32页
     ·PCR产物的纯化第32页
   ·酶切片段的分离和末端片段的检测第32-41页
     ·空白试验、精确度和大肠杆菌T-RFLP图谱的预测和验证第32-33页
     ·湖水细菌分离、纯培养菌株的检验第33-37页
     ·湖水膜样T-RFLP分析第37-41页
       ·细菌类群的分析第37-40页
       ·自由生活的细菌和颗粒吸附细菌T-RFLP图谱比较第40-41页
       ·平板培养的细菌和湖水膜样细菌T-RFLP图谱的比较第41页
   ·T-RFLP方法与相应分析策略的优点与存在的问题第41-43页
4 致谢第43-44页
5 参考文献第44-48页
6 附表1根据MspⅠ-T-RFLP数据分析RDP数据库中与湖水0.2-1μm膜样相似的微生物类群第48-54页
7 附表2根据RsaⅠ-T-RFLP数据分析RDP数据库中与湖水1μm膜样相似的微生物类群第54-55页

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