蛋白质结构预测方法学研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-40页 |
| ·蛋白质结构预测和分子对接方法的研究意义 | 第14-18页 |
| ·研究意义 | 第14-16页 |
| ·蛋白质分子间相互作用和识别的机制 | 第16-17页 |
| ·蛋白质分子对接的基本概念 | 第17-18页 |
| ·蛋白质分子对接常用算法和程序介绍 | 第18-26页 |
| ·蛋白质分子对接搜索方法 | 第18-22页 |
| ·蛋白质分子对接打分函数 | 第22-23页 |
| ·蛋白质分子对接程序简介 | 第23-25页 |
| ·蛋白质分子对接研究的热点问题 | 第25-26页 |
| ·蛋白质折叠的研究意义和进展 | 第26-30页 |
| ·研究意义 | 第26-27页 |
| ·蛋白质折叠的理论基础 | 第27-28页 |
| ·蛋白质折叠模型简介 | 第28-30页 |
| ·蛋白质折叠的研究热点 | 第30页 |
| ·复杂网络及其在蛋白质结构功能研究中的应用 | 第30-40页 |
| ·研究意义 | 第30-32页 |
| ·复杂网络的基本概念 | 第32-35页 |
| ·网络演化模型简介 | 第35-37页 |
| ·蛋白质科学中网络问题的研究 | 第37-39页 |
| ·蛋白质结构网络研究的热点问题 | 第39-40页 |
| 第2章 蛋白质分子对接打分函数的研究 | 第40-69页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·基于蛋白质Others 类型的打分函数 | 第40-48页 |
| ·研究体系 | 第41页 |
| ·研究方法 | 第41-42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-48页 |
| ·基于网络的蛋白质-蛋白质打分函数 | 第48-67页 |
| ·体系和方法 | 第49-53页 |
| ·结果和讨论 | 第53-67页 |
| ·本章小结 | 第67-69页 |
| 第3章 蛋白质分子对接搜索方法的改进 | 第69-103页 |
| ·引言 | 第69页 |
| ·基于MPI 的蛋白质对接算法 | 第69-96页 |
| ·并行计算技术 | 第70-71页 |
| ·串行程序分析 | 第71-73页 |
| ·测试环境 | 第73-74页 |
| ·并行方案 | 第74-81页 |
| ·结果与分析 | 第81-96页 |
| ·基于蚁群算法的蛋白质搜索方法 | 第96-101页 |
| ·研究体系 | 第97页 |
| ·研究方法 | 第97-98页 |
| ·结果与讨论 | 第98-101页 |
| ·本章小结 | 第101-103页 |
| 第4章 蛋白质氨基酸网络研究 | 第103-126页 |
| ·引言 | 第103-104页 |
| ·氨基酸演化网络模型 | 第104-119页 |
| ·材料和研究体系 | 第105-107页 |
| ·理论和模型 | 第107-112页 |
| ·结果和讨论 | 第112-119页 |
| ·保守性氨基酸网络分析 | 第119-124页 |
| ·系统和方法 | 第119-120页 |
| ·结果和讨论 | 第120-124页 |
| ·本章小结 | 第124-126页 |
| 结论与展望 | 第126-130页 |
| 主要结论和创新点 | 第126-128页 |
| 对今后工作的展望 | 第128-130页 |
| 参考文献 | 第130-146页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文和软件著作权 | 第146-149页 |
| 致谢 | 第149页 |
