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烟草基因Nt21与Nt92的功能初探

摘要第14-16页
Abstract第16-17页
缩略词第18-19页
第一章 前言第19-33页
    1.1 烟草第19-26页
        1.1.1 烟草的进化与分类第19-21页
        1.1.2 烟草的基因组第21-22页
        1.1.3 烟草腺毛第22页
        1.1.4 腺毛分泌物(西柏烷烃)第22-26页
    1.2 转录因子第26-31页
        1.2.1 MYB转录因子第27-30页
        1.2.2 WRKY转录因子第30-31页
    1.3 DUF基因家族的相关研究第31-32页
    1.4 本研究的目的和意义第32-33页
第二章 材料与方法第33-69页
    2.1 实验材料第33-38页
        2.1.1 烟草材料第33页
        2.1.2 载体质粒与菌株第33-35页
            2.1.2.1 载体质粒第33-34页
            2.1.2.2 载体图谱第34-35页
            2.1.2.3 菌株第35页
        2.1.3 主要酶类、试剂盒及仪器第35-38页
            2.1.3.1 酶类第35-36页
            2.1.3.2 试剂盒第36页
            2.1.3.3 抗生素第36-37页
            2.1.3.4 其他试剂第37页
            2.1.3.5 仪器第37-38页
    2.2 实验方法第38-69页
        2.2.1 烟草材料的生长和处理第38-40页
            2.2.1.1 烟草无菌苗的获得——种子的消毒第38-39页
            2.2.1.2 组织表达谱的取样第39页
            2.2.1.3 烟草幼苗的激素处理方法第39-40页
        2.2.2 基本培养基的配制第40-41页
        2.2.3 烟草叶片的瞬时转化第41-42页
            2.2.3.1 本氏烟的栽培第41页
            2.2.3.2 本氏烟的瞬时转化方法第41-42页
            2.2.3.3 相关溶液的配制第42页
        2.2.4 激光共聚焦扫描观察第42页
        2.2.5 农杆菌介导的烟草遗传转化第42-43页
        2.2.6 GUS组织化学分析第43-44页
            2.2.6.1 GUS染色液的配制第43-44页
            2.2.6.2 组织染色步骤第44页
        2.2.7 扫描电镜观察第44-45页
            2.2.7.1 具体步骤第44-45页
            2.2.7.2 固定液的配制第45页
        2.2.8 罗丹明染色第45页
        2.2.9 生物信息学分析第45-46页
        2.2.10 烟草基因组DNA的提取第46-47页
            2.2.10.1 具体步骤第46页
            2.2.10.2 溶液配制第46-47页
        2.2.11 烟草总RNA的提取第47-48页
        2.2.12 RNA样品中基因组DNA的去除第48页
        2.2.13 cDNA第一链的合成第48-49页
        2.2.14 PCR技术第49-53页
            2.2.14.1 普通taq酶PCR第49-50页
            2.2.14.2 高保真酶PCR第50页
            2.2.14.3 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)第50-52页
            2.2.14.4 荧光定量PCR及普通PCR检测所用引物第52-53页
        2.2.15 DNA片段的回收第53-54页
            2.2.15.1 DNA的凝胶回收第53-54页
            2.2.15.2 PCR/酶切产物的回收第54页
        2.2.16 DNA的酶切第54页
        2.2.17 DNA片段的去磷酸化第54-55页
        2.2.18 DNA片段加A尾第55页
        2.2.19 DNA连接反应第55页
        2.2.20 Gateawy克隆系统第55-57页
            2.2.20.1 BP反应第55-56页
            2.2.20.2 LR反应第56-57页
        2.2.21 In-Fusion无缝连接第57-58页
        2.2.22 质粒的提取第58-59页
        2.2.23 感受态的制备第59-60页
            2.2.23.1 大肠杆菌热激化感受态第59-60页
            2.2.23.2 农杆菌热激化感受态的制备第60页
        2.2.24 感受态细胞的转化第60-61页
            2.2.24.1 大肠杆菌感受态细胞的转化第60页
            2.2.24.2 农杆菌感受态细胞的转化第60-61页
        2.2.25 烟草遗传转化载体的构建第61-63页
            2.2.25.1 组织定位表达载体的构建第61页
            2.2.25.2 过表达、亚细胞定位载体的构建第61-62页
            2.2.25.3 RNAi抑制表达载体的构建第62-63页
        2.2.26 转基因植株鉴定第63页
        2.2.27 酵母自激活实验第63-66页
            2.2.27.1 原理第63-64页
            2.2.27.2 载体构建第64页
            2.2.27.3 自激活实验第64-66页
        2.2.28 数字基因表达谱测序(DGE)第66-69页
            2.2.28.1 样品制备第66页
            2.2.28.2 测序流程第66-68页
            2.2.28.3 分析流程第68-69页
第三章 Nt21基因的功能研究第69-97页
    3.1 Nt21生物信息学分析第69-73页
        3.1.1 Nt21的分子遗传进化第69-71页
        3.1.2 Nt21基因及蛋白序列的分析第71-73页
    3.2 Nt21亚细胞定位分析第73-74页
        3.2.1 Nt21亚细胞定位载体的构建第73页
        3.2.2 Nt21蛋白的定位第73-74页
    3.3 Nt21蛋白的自激活活性检测第74-77页
        3.3.1 BD载体的构建(pGBKT7-Nt21F)第74-75页
        3.3.2 Nt21蛋白自激活活性检测第75-77页
            3.3.2.1 Nt21全长自激活活性检测第75页
            3.3.2.2 Nt21蛋白自激活结构域验证第75-77页
    3.4 Nt21的表达模式分析第77-82页
        3.4.1 Nt21启动子区顺式作用元件的预测第77-78页
        3.4.2 Nt21的组织表达模式分析第78-82页
            3.4.2.1 qRT-PCR分析Nt21的组织表达模式第78-79页
            3.4.2.2 Nt21组织定位表达载体的构建第79-80页
            3.4.2.3 Nt21启动子融合GUS表达的转基因烟草鉴定第80-81页
            3.4.2.4 Nt21的组织表达模式第81页
            3.4.2.5 ABA处理下Nt21的表达模式第81-82页
    3.5 Nt21转基因烟草的表型分析第82-91页
        3.5.1 Nt21表达载体的构建第82-84页
            3.5.1.1 Nt21过表达载体的构建(pCXSN-HA-Nt21)第82-83页
            3.5.1.2 Nt21干扰表达载体的构建(pH7GWIWG2(Ⅱ)-Nt21)第83-84页
        3.5.2 Nt21转基因烟草的鉴定第84-85页
            3.5.2.1 Nt21过表达转基因烟草的鉴定第84-85页
            3.5.2.2 Nt21 RNAi干扰转基因烟草的鉴定第85页
        3.5.3 转基因烟草中Nt21的表达水平第85-87页
            3.5.3.1 qRT-PCR检测T_0代过表达转基因烟草中Nt21的表达水平第85-86页
            3.5.3.2 qRT-PCR检测T_0代RNAi干扰转基因烟草中Nt21的表达水平第86-87页
        3.5.4 转基因烟草中烷烃类合成相关Maker基因的检测第87-90页
            3.5.4.1 qRT-PCR检测T_0代过表达转基因烟草中CYC/CYP的表达水平第87-88页
            3.5.4.2 qRT-PCR检测T_o代RNAi转基因烟草中CYC/CYP的表达水平第88-90页
        3.5.5 Nt21转基因烟草叶片的显微观察第90-91页
    3.6 Nt21过表达转基因植株的数字表达谱分析(DGE)第91-97页
        3.6.1 RNA样品质检第91-92页
        3.6.2 GO富集分析第92-96页
        3.6.3 KEGG pathway分析第96-97页
第四章 Nt92基因功能研究第97-123页
    4.1 Nt92生物信息学分析第97-101页
        4.1.1 DUF868家族特征及序列分析第97-99页
        4.1.2 烟草DUF868基因第99-100页
        4.1.3 Nt92基因及蛋白序列的分析第100-101页
    4.2 Nt92亚细胞定位分析第101-103页
        4.2.1 Nt92亚细胞定位表达载体的构建第101-102页
        4.2.2 Nt92蛋白的定位第102-103页
    4.3 Nt92蛋白的自激活活性检测第103-104页
        4.3.1 BD载体的构建(pGBKT7-Nt92)第103页
        4.3.2 Nt92蛋白自激活活性检测第103-104页
    4.4 Nt92的表达模式分析第104-109页
        4.4.1 Nt92启动子区顺式作用元件的预测第104-106页
        4.4.2 Nt92的组织表达模式分析第106-109页
            4.4.2.1 qRT-PCR分析Nt92的组织表达模式第106页
            4.4.2.2 Nt92组织定位表达载体的构建第106-107页
            4.4.2.3 Nt92启动子融合GUS表达的转基因烟草鉴定第107-108页
            4.4.2.4 Nt92的组织表达模式第108-109页
    4.5 Nt92转基因的表型分析第109-116页
        4.5.1 Nt92表达载体的构建第109-110页
            4.5.1.1 Nt92过表达载体的构建(pCXSN-Myc-Nt92)第109-110页
            4.5.1.2 Nt92干扰表达载体的构建(pH7GWIWG2(Ⅱ)-Nt92)第110页
        4.5.2 Nt92转基因烟草植株的鉴定第110-112页
            4.5.2.1 Nt92过表达转基因烟草的鉴定第110-111页
            4.5.2.2 Nt92 RNAi干扰转基因烟草的鉴定第111-112页
        4.5.3 转基因烟草中Nt92的表达水平第112-113页
            4.5.3.1 qRT-PCR检测T_0代过表达转基因烟草中Nt92的表达水平第112页
            4.5.3.2 qRT-PCR检测T_0代RNA干扰转基因烟草中Nt92的表达水平第112-113页
        4.5.4 转基因烟草中烷烃类合成相关Maker基因的检测第113-116页
            4.5.4.1 qRT-PCR检测T_0代过表达转基因烟草中CYC/CYP的表达水平第113-115页
            4.5.4.2 qRT-PCR检测T_0代RNAi转基因烟草中CYC/CYP的表达水平第115-116页
    4.6 Nt92过表达转基因植株的数字表达谱分析(DGE)第116-123页
        4.6.1 GO富集分析第116-118页
        4.6.2 KEGG-pathway分析第118-123页
第五章 讨论第123-138页
    5.1 Nt21基因功能分析第123-136页
        5.1.1 Nt21的组织表达特异性第123-124页
        5.1.2 Nt21蛋白的定位第124-128页
        5.1.3 Nt21蛋白的自激活验证第128-130页
        5.1.4 Nt21转基因植株的表型分析第130页
        5.1.5 Nt21过表达转基因植株的数字表达谱第130-136页
    5.2 Nt92基因功能分析第136-138页
        5.2.1 Nt92的组织表达特异性第136页
        5.2.2 Nt92蛋白的定位与自激活验证第136页
        5.2.3 Nt92转基因植株的表型分析第136-137页
        5.2.4 Nt92过表达转基因植株的数字表达谱第137-138页
第六章 总结第138-140页
    6.1 Nt21第138-139页
    6.2 Nt92第139-140页
致谢第140-141页
参考文献第141-145页

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