| 致谢 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-18页 |
| 1.1 泡桐丛枝病的研究进展 | 第9-11页 |
| 1.1.1 植原体的特点 | 第9页 |
| 1.1.2 植原体的分类 | 第9-10页 |
| 1.1.3 植原体的传播 | 第10页 |
| 1.1.4 植原体病害的致病机制 | 第10页 |
| 1.1.5 植原体病害的防治 | 第10-11页 |
| 1.1.6 泡桐丛枝病研究现状 | 第11页 |
| 1.2 lncRNAs的研究进展 | 第11-16页 |
| 1.2.1 lncRNAs概述 | 第11-12页 |
| 1.2.2 lncRNAs的作用机制 | 第12-13页 |
| 1.2.2.1 信号分子 | 第12页 |
| 1.2.2.2 诱饵分子 | 第12-13页 |
| 1.2.2.3 引导分子 | 第13页 |
| 1.2.2.4 支架分子 | 第13页 |
| 1.2.3 lncRNAs在植物中的的生物学功能 | 第13-15页 |
| 1.2.3.1 植物lncRNAs与花发育 | 第13-14页 |
| 1.2.3.2 植物lncRNAs与花粉发育 | 第14页 |
| 1.2.3.3 lncRNAs与逆境胁迫 | 第14-15页 |
| 1.2.3.4 植物lncRNAs的参与的其他生物学功能 | 第15页 |
| 1.2.4 植物lncRNAs的研究方法 | 第15-16页 |
| 1.3 本研究的目的与意义 | 第16-18页 |
| 2 引言 | 第18页 |
| 3 材料与方法 | 第18-24页 |
| 3.1 试验用主要试剂 | 第18-19页 |
| 3.2 试验用主要仪器 | 第19页 |
| 3.3 材料及处理 | 第19-20页 |
| 3.3.1 试验材料 | 第19页 |
| 3.3.2 试验处理 | 第19-20页 |
| 3.3.2.1 MMS处理 | 第19页 |
| 3.3.2.2 利福平处理 | 第19-20页 |
| 3.4 试验方法 | 第20-24页 |
| 3.4.1 泡桐totalRNA提取和检测 | 第20页 |
| 3.4.2 文库构建及上机测序 | 第20-21页 |
| 3.4.2.1 文库构建 | 第20-21页 |
| 3.4.2.2 上机测序和数据过滤 | 第21页 |
| 3.4.3 lncRNAs鉴定 | 第21-22页 |
| 3.4.4 lncRNAs分类 | 第22页 |
| 3.4.5 lncRNAs的靶基因预测 | 第22页 |
| 3.4.6 miRNA前体预测 | 第22页 |
| 3.4.7 差异lncRNAs的鉴定、分析 | 第22-23页 |
| 3.4.8 qRT-PCR验证 | 第23-24页 |
| 4 结果与分析 | 第24-36页 |
| 4.1 泡桐RNA的提取 | 第24-25页 |
| 4.2 泡桐lncRNAs的鉴定 | 第25-26页 |
| 4.3 mRNA和lncRNAs比较分析 | 第26-27页 |
| 4.4 lncRNAs注释及功能预测 | 第27-29页 |
| 4.4.1 lncRNAs的靶基因预测 | 第27-28页 |
| 4.4.2 lncRNAs家族预测 | 第28页 |
| 4.4.3 miRNAs前体预测 | 第28-29页 |
| 4.5 差异lncRNAs的分析 | 第29-32页 |
| 4.5.1 差异lncRNAs的鉴定和靶基因预测 | 第29页 |
| 4.5.2 差异lncRNAs靶基因GO富集分析 | 第29-30页 |
| 4.5.3 差异lncRNAs靶基因Pathway富集分析 | 第30-32页 |
| 4.6 与泡桐丛枝病相关的差异lncRNAs分析 | 第32-34页 |
| 4.6.1 与泡桐丛枝病相关的差异lncRNAs的鉴定 | 第32页 |
| 4.6.2 与泡桐丛枝病相关的差异lncRNAs靶基因GO富集分析 | 第32-33页 |
| 4.6.3 与泡桐丛枝病相关的差异lncRNAs靶基因Pathway富集分析 | 第33-34页 |
| 4.7 lncRNAs和靶基因的qRT-PCR验证 | 第34-36页 |
| 5 结论与讨论 | 第36-41页 |
| 5.1 结论 | 第36-37页 |
| 5.2 讨论 | 第37-41页 |
| 5.2.1 植原体感染引发泡桐的免疫反应 | 第37-39页 |
| 5.2.2 植原体感染对泡桐光合作用的影响 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-52页 |
| ABSTRACT | 第52-53页 |
| 附表 | 第54-71页 |
