| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| 1.1 G-四链体与基于分子对接的配体筛选 | 第11-18页 |
| 1.1.1 G-四链体的形成及生物功能 | 第11-12页 |
| 1.1.2 G-四链体-配体结合模式 | 第12-14页 |
| 1.1.3 靶向G-四链体的配体小分子研究现状及进展 | 第14-15页 |
| 1.1.4 分子对接 | 第15-17页 |
| 1.1.4.1 分子对接原理 | 第15-16页 |
| 1.1.4.2 “一致性”分子对接方法 | 第16-17页 |
| 1.1.5 发现新型G-四链体配体需要解决的问题 | 第17-18页 |
| 1.2 本论文的工作设想 | 第18-20页 |
| 第二章 构建用于对接软件评价的G-四链体-配体复合物测试集 | 第20-27页 |
| 2.1 前言 | 第20-22页 |
| 2.1.1 构建G-四链体-配体复合物测试集的必要性 | 第20页 |
| 2.1.2 构建G-四链体-配体复合物测试集的策略 | 第20-22页 |
| 2.2 G-四链体-配体复合物测试集分类 | 第22-25页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第25页 |
| 2.4 小结 | 第25-27页 |
| 第三章 常用分子对接软件对G-四链体-配体复合物重构的综合表现 | 第27-54页 |
| 3.1 前言 | 第27-29页 |
| 3.1.1 评估对接软件对G-四链体-配体复合物重构能力的必要性 | 第27-28页 |
| 3.1.2 分子对接软件对G-四链体-配体复合物测试集重构的综合表现评估策略 | 第28-29页 |
| 3.2 材料与方法 | 第29-33页 |
| 3.2.1 分子对接软件及参数设置 | 第29-31页 |
| 3.2.2 复合物结构处理 | 第31-32页 |
| 3.2.3 评估参数 | 第32-33页 |
| 3.3 实验结果 | 第33-52页 |
| 3.3.1 分子对接软件对整个测试集的综合表现 | 第33-45页 |
| 3.3.1.1 对接能力 | 第33-38页 |
| 3.3.1.2 采样能力 | 第38-42页 |
| 3.3.1.3 打分函数的虚拟筛选能力 | 第42-43页 |
| 3.3.1.4 打分函数的排名能力 | 第43-44页 |
| 3.3.1.5 平均耗时（对接速度） | 第44-45页 |
| 3.3.2 分子对接软件对各个测试子集的表现 | 第45-52页 |
| 3.3.2.1 分子对接软件对不同解析方法得到的复合物结构重构表现 | 第45-46页 |
| 3.3.2.2 分子对接软件对配体包埋的溶剂可及表面积百分比不同的复合物结构重构表现 | 第46页 |
| 3.3.2.3 分子对接软件对测试集中不同柔性的配体重构表现 | 第46-52页 |
| 3.4 讨论 | 第52-53页 |
| 3.5 小结 | 第53-54页 |
| 第四部分 靶向端粒G-四链体选择性配体的虚拟筛选 | 第54-62页 |
| 4.1 前言 | 第54-55页 |
| 4.1.1 发现靶向端粒G-四链体的新型选择性配体分子的意义 | 第54-55页 |
| 4.1.2 虚拟筛选策略 | 第55页 |
| 4.2 实验方法与结果 | 第55-61页 |
| 4.2.1 G-四链体结构预处理 | 第55-56页 |
| 4.2.2 数据库中化合物处理 | 第56-57页 |
| 4.2.3 荧光共振能量转移实验（FRET）（与丁婕琴同学合作） | 第57-60页 |
| 4.2.4 化合物抗肿瘤细胞活性测定（与高超同学合作） | 第60-61页 |
| 4.3 小结 | 第61-62页 |
| 第五部分 总结与展望 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 附录 | 第74-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
