| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1.1 甜叶菊糖苷研究现状 | 第14-20页 |
| 1.1.1 甜菊糖苷组成 | 第14-15页 |
| 1.1.2 甜菊糖苷生物合成途径 | 第15-16页 |
| 1.1.3 甜菊糖苷生物合成途径关键酶研究 | 第16-20页 |
| 1.2 转录组分析技术 | 第20-24页 |
| 1.2.1 RNA-Seq分析技术 | 第20-21页 |
| 1.2.2 RNA-Seq与DGE的关系 | 第21-22页 |
| 1.2.3 RNA-Seq的应用 | 第22-23页 |
| 1.2.4 转录组学在药用植物中的应用 | 第23-24页 |
| 1.3 水杨酸研究进展 | 第24-28页 |
| 1.3.1 水杨酸作用机理 | 第24-25页 |
| 1.3.2 水杨酸信号转导途径 | 第25-26页 |
| 1.3.3 水杨酸与次生代谢 | 第26-28页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第28-29页 |
| 1.5 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 甜叶菊叶片转录组测序及分析 | 第30-52页 |
| 2.1 材料和方法 | 第31-35页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第31页 |
| 2.1.2 糖苷提取及含量测定 | 第31页 |
| 2.1.3 RNA提取及检测 | 第31页 |
| 2.1.4 cDNA文库制备及Illumina HiSeq~(TM)2000上机测序 | 第31-32页 |
| 2.1.5 数据处理 | 第32-35页 |
| 2.1.6 Real-Time QPCR体系及反应条件 | 第35页 |
| 2.2 结果与分析 | 第35-49页 |
| 2.2.1 不同品系甜叶菊的主要糖苷成分含量分析 | 第35-36页 |
| 2.2.2 测序产量统计 | 第36页 |
| 2.2.3 de novo组装结果 | 第36-37页 |
| 2.2.4 基因功能注释结果 | 第37-39页 |
| 2.2.5 基因表达量统计 | 第39-40页 |
| 2.2.6 差异表达基因筛选 | 第40-41页 |
| 2.2.7 差异表达基因的GO功能显著性富集结果 | 第41-43页 |
| 2.2.8 差异表达基因的KEGG功能显著性富集结果 | 第43-45页 |
| 2.2.9 甜叶菊糖苷生物合成途径相关基因表达情况 | 第45-47页 |
| 2.2.10 甜叶菊糖基转移酶候选基因筛选 | 第47-49页 |
| 2.3 讨论 | 第49-52页 |
| 2.3.1 甜叶菊转录组研究重要性 | 第49-50页 |
| 2.3.2 甜叶菊糖苷候选基因的筛选 | 第50-52页 |
| 第三章 甜叶菊转录组微卫星挖掘及分子标记的研究 | 第52-62页 |
| 3.1 材料和方法 | 第52-54页 |
| 3.1.1 转录组数据材料及来源 | 第52-53页 |
| 3.1.2 简单重复序列(SSR)搜索分析 | 第53页 |
| 3.1.3 基因表达量计算 | 第53页 |
| 3.1.4 SSR引物设计 | 第53页 |
| 3.1.5 RNA提取 | 第53-54页 |
| 3.1.6 运用PCR对部分SSR进行验证 | 第54页 |
| 3.2 结果与分析 | 第54-59页 |
| 3.2.1 甜叶菊转录组序列中SSR重复基元分布 | 第54-56页 |
| 3.2.2 甜叶菊转录组序列中微卫星的长度分布 | 第56-57页 |
| 3.2.3 甜叶菊转录组中SSR序列对基因表达水平的影响 | 第57-58页 |
| 3.2.4 SSR引物筛选与验证 | 第58-59页 |
| 3.3 讨论 | 第59-62页 |
| 3.3.1 甜叶菊转录组中SSR微卫星分布特征 | 第59-60页 |
| 3.3.2 甜叶菊genic-SSR分子标记开发的重要性 | 第60-62页 |
| 第四章 甜叶菊对水杨酸信号响应机制研究 | 第62-88页 |
| 4.1 材料和方法 | 第63-68页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第63页 |
| 4.1.2 试验处理 | 第63-64页 |
| 4.1.3 测定指标 | 第64-68页 |
| 4.2 结果与分析 | 第68-82页 |
| 4.2.1 水杨酸对甜叶菊叶片糖苷含量的影响 | 第68-69页 |
| 4.2.2 水杨酸对甜叶菊叶片糖苷合成途径15个关键酶基因的影响 | 第69-70页 |
| 4.2.3 水杨酸对甜叶菊叶片抗氧化酶活性的影响 | 第70-71页 |
| 4.2.4 水杨酸对甜叶菊叶片过氧化氢含量的影响 | 第71-72页 |
| 4.2.5 水杨酸对甜叶菊叶片内源水杨酸含量的影响 | 第72页 |
| 4.2.6 水杨酸对甜叶菊叶片钙调蛋白基因的影响 | 第72-73页 |
| 4.2.7 水杨酸对甜叶菊水杨酸合成相关基因的影响 | 第73-74页 |
| 4.2.8 水杨酸对甜叶菊叶片中NPR1基因表达的影响 | 第74页 |
| 4.2.9 水杨酸对甜叶菊叶片数字基因表达谱的影响 | 第74-82页 |
| 4.3 讨论 | 第82-88页 |
| 4.3.1 水杨酸处理对甜叶菊叶片糖苷合成的影响 | 第82-84页 |
| 4.3.2 水杨酸处理诱导甜叶菊信号转导机制的初步研究 | 第84-86页 |
| 4.3.3 水杨酸处理诱导的甜叶菊脱落酸信号转导 | 第86-88页 |
| 第五章 结论与展望 | 第88-91页 |
| 5.1 结论 | 第88-89页 |
| 5.2 展望 | 第89-91页 |
| 创新点 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 攻读博士论文期间取得的成果 | 第101-102页 |
