| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第10-18页 |
| 1.1 分子标记在蓖麻上的研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.1 基因定位 | 第11-12页 |
| 1.1.2 遗传图谱构建 | 第12页 |
| 1.1.3 遗传多样性分析与种质资源研究 | 第12页 |
| 1.1.4 分子标记反应体系构建与优化 | 第12-13页 |
| 1.1.5 其它应用 | 第13页 |
| 1.2 关联分析 | 第13-16页 |
| 1.2.1 关联分析的统计学原理 | 第14页 |
| 1.2.2 连锁不平衡程度量标准 | 第14-15页 |
| 1.2.3 影响连锁不平衡的因素 | 第15页 |
| 1.2.4 基于全基因组途径的关联分析策略 | 第15-16页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第16-17页 |
| 1.4 技术路线 | 第17-18页 |
| 2 材料和方法 | 第18-28页 |
| 2.1 实验材料及种植 | 第18-21页 |
| 2.2 仪器和试剂 | 第21-22页 |
| 2.2.1 实验主要仪器 | 第21页 |
| 2.2.2 主要试剂来源 | 第21-22页 |
| 2.3 试验方法 | 第22-24页 |
| 2.3.1 蓖麻基因组DNA的提取 | 第22页 |
| 2.3.2 SSR反应和扩增体系 | 第22-23页 |
| 2.3.3 6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第23-24页 |
| 2.4 性状统计调查与测定 | 第24-26页 |
| 2.4.1 蓖麻表型统计 | 第24-25页 |
| 2.4.2 含油率测定 | 第25-26页 |
| 2.5 基因型数据处理 | 第26页 |
| 2.6 多样性分析及基于主成分的聚类分析 | 第26页 |
| 2.7 遗传多样性分析 | 第26页 |
| 2.8 标记间连锁不平衡度分析 | 第26页 |
| 2.9 群体结构分析 | 第26-27页 |
| 2.10 性状和标记的关联分析 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-49页 |
| 3.1 表型性状多样性分析 | 第28-32页 |
| 3.2 基于主成分的聚类分析 | 第32-39页 |
| 3.2.1 KMO和Bartlett’s球形度检验 | 第32-33页 |
| 3.2.2 获取主成分 | 第33-35页 |
| 3.2.3 因子旋转 | 第35-36页 |
| 3.2.4 聚类分析 | 第36-39页 |
| 3.3 遗传多样性分析 | 第39-42页 |
| 3.4 标记间连锁不平衡度分析 | 第42-44页 |
| 3.5 群体结构分析 | 第44页 |
| 3.6 分子标记与表型性状的关联分析 | 第44-49页 |
| 3.6.1 p<0.001水平下与表型关联位点 | 第45-46页 |
| 3.6.2 p<0.01水平下与表型关联位点 | 第46-49页 |
| 4 讨论 | 第49-51页 |
| 4.1 材料选择 | 第49页 |
| 4.2 表型统计 | 第49页 |
| 4.3 标记数量 | 第49页 |
| 4.4 基因型统计 | 第49页 |
| 4.5 聚类问题 | 第49页 |
| 4.6 群体结构问题 | 第49-50页 |
| 4.7 关联分析 | 第50-51页 |
| 5 全文结论 | 第51-53页 |
| 5.1 表型多样性分析 | 第51页 |
| 5.2 基于主成分的聚类分析 | 第51页 |
| 5.3 遗传多样性分析 | 第51页 |
| 5.4 标记间连锁不平衡分析 | 第51-52页 |
| 5.5 群体结构分析 | 第52页 |
| 5.6 标记与性状间关联分析 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 作者简介 | 第60-61页 |
| 导师简介 | 第61页 |