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铜绿微囊藻及衍生物对萼花臂尾轮虫生活史特征和抗氧化系统影响的研究

摘要第3-7页
ABSTRACT第7-11页
第1章 绪论第18-26页
    1.1 引言第18页
    1.2 水华微囊藻对浮游动物影响的研究进展第18-19页
        1.2.1 蓝藻水华的成因、危害第18-19页
        1.2.2 水华微囊藻对浮游动物的影响第19页
    1.3 水华衍生物对浮游动物影响的研究进展第19-21页
        1.3.1 微囊藻毒素第19-20页
        1.3.2 非离子氨第20页
        1.3.3 亚硝酸盐第20-21页
        1.3.4 水华衍生物对浮游动物的影响第21页
    1.4 轮虫—潜在的毒理学研究模式动物第21-23页
        1.4.1 轮虫毒理学研究的生态学基础第22-23页
        1.4.2 轮虫毒理学研究的分子生物学基础第23页
    1.5 本文研究目的与意义第23-26页
        1.5.1 研究目的第23页
        1.5.2 研究意义第23-24页
        1.5.3 技术路线第24-25页
        1.5.4 主要创新点第25-26页
第2章 有毒、无毒铜绿微囊藻对萼花臂尾轮虫生活史和摄食的影响第26-42页
    2.1 引言第26-27页
    2.2 材料与方法第27-31页
        2.2.1 轮虫的培养第27页
        2.2.2 藻种来源与培养第27-29页
        2.2.3 实验设计第29-30页
        2.2.4 数据处理第30-31页
        2.2.5 统计分析第31页
    2.3 结果第31-39页
        2.3.1 轮虫生命表参数变化第31-33页
        2.3.2 轮虫生活史特征变化第33-36页
        2.3.3 摄食强度第36-39页
    2.4 讨论第39-41页
        2.4.1 微囊藻对轮虫生长的影响第39-40页
        2.4.2 微囊藻对轮虫生活史参数的影响第40-41页
        2.4.3 蓝藻—轮虫相互作用第41页
    2.5 本章小结第41-42页
第3章 有毒、无毒铜绿微囊藻对萼花臂尾轮虫消化酶活性、抗氧化酶活性和营养含量的影响第42-58页
    3.1 引言第42-43页
    3.2 材料第43-46页
        3.2.1 培养和处理第43-44页
        3.2.2 实验设计第44-46页
    3.3 方法第46-48页
        3.3.1 生化指标测定第46-48页
            3.3.1.1 AMS测定第46页
            3.3.1.2 Pepsase测定第46页
            3.3.1.3 Trypsin测定第46-47页
            3.3.1.4 CL测定第47页
            3.3.1.5 SOD测定第47页
            3.3.1.6 CAT测定第47页
            3.3.1.7 GPx测定第47页
            3.3.1.8 Glycogen测定第47页
            3.3.1.9 Protein测定第47页
            3.3.1.10 TG测定第47-48页
        3.3.2 统计分析第48页
    3.4 结果第48-55页
        3.4.1 轮虫摄食率变化第48-50页
        3.4.2 不同藻类混合液对轮虫消化酶活性影响第50-52页
        3.4.3 不同藻类混合液对轮虫抗氧化酶活性影响第52-53页
        3.4.4 不同藻类混合液对轮虫营养含量影响第53-55页
    3.5 讨论第55-57页
    3.6 本章小结第57-58页
第4章 藻毒素和氯化铵对萼花臂尾轮虫繁殖性能和表型特征的交互影响第58-73页
    4.1 引言第58-59页
    4.2 材料与方法第59-61页
        4.2.1 轮虫的培养第59页
        4.2.2 实验设计第59-61页
        4.2.3 统计分析第61页
    4.3 结果第61-69页
        4.3.1 生殖历时第61-62页
            4.3.1.1 繁殖前期第61页
            4.3.1.2 繁殖期第61-62页
            4.3.1.3 繁殖后期第62页
        4.3.2 每个雌体的总子代数第62-65页
        4.3.3 行为响应第65-67页
        4.3.4 表型特征第67-69页
    4.4 讨论第69-72页
    4.5 本章小结第72-73页
第5章 藻毒素和氯化铵对萼花臂尾轮虫生命表参数和谷胱甘肽相关酶的影响第73-97页
    5.1 引言第73-74页
    5.2 材料和方法第74-83页
        5.2.1 轮虫的培养第74页
        5.2.2 实验设计第74-75页
        5.2.3 生化测定第75-76页
            5.2.3.1 ROS测定第75-76页
            5.2.3.2 Na~+/K~+ - ATPase测定第76页
            5.2.3.3 GSH测定第76页
            5.2.3.4 GPx测定第76页
            5.2.3.5 GR测定第76页
            5.2.3.6 GST测定第76页
        5.2.4 PHGPx基因RACE技术扩增全长第76-83页
            5.2.4.1 轮虫RNA提取(优化的TRlzol法)第76-77页
            5.2.4.2 RNA质量、浓度确定第77-78页
            5.2.4.3 cDNA反转录合成第78页
            5.2.4.4 目的基因兼并引物设计第78页
            5.2.4.5 目的基因PCR扩增第78-79页
            5.2.4.6 目的基因PCR产物割胶回收第79页
            5.2.4.7 连接PMD~(TM)-19T载体第79-80页
            5.2.4.8 菌液PCR验证第80页
            5.2.4.9 测序比对第80页
            5.2.4.10 cDNA末端快速扩增基因全长第80-82页
            5.2.4.11 PHGPx基因荧光定量PCR第82-83页
        5.2.5 统计分析第83页
    5.3 结果第83-93页
        5.3.1 轮虫生命表参数变化第83-85页
        5.3.2 ROS含量变化第85页
        5.3.3 Na~+/K~+ - ATPase活性变化第85-88页
        5.3.4 GSH相关酶活性变化第88-90页
        5.3.5 PHGPx基因序列分析、同源比对和三级结构预测第90-93页
            5.3.5.1 PHGPx cDNA序列分析第90-91页
            5.3.5.2 PHGPx进化树分析第91-92页
            5.3.5.3 PHGPx蛋白三级结构预测第92-93页
        5.3.6 PHGPx基因表达量变化第93页
    5.4 讨论第93-96页
    5.5 本章小结第96-97页
第6章 藻毒素和亚硝酸盐不同温度下对萼花臂尾轮虫寿命和热休克响应的影响第97-117页
    6.1 引言第97-98页
    6.2 材料和方法第98-100页
        6.2.1 轮虫的培养第98页
        6.2.2 实验设计第98-99页
        6.2.3 ROS测定第99页
        6.2.4 hsp40、hsp60、hsp70和hsp90 mRNA表达水平测定第99-100页
        6.2.5 统计分析第100页
    6.3 结果第100-114页
        6.3.1 轮虫寿命变化第100-102页
        6.3.2 ROS含量变化第102页
        6.3.3 hsp40、hsp60、hsp70和hsp90 mRNA表达水平变化第102-114页
    6.4 讨论第114-116页
    6.5 本章小结第116-117页
第7章 藻毒素和亚硝酸盐对萼花臂尾轮虫生长、脂质过氧化和抗氧化响应的联合效应第117-137页
    7.1 引言第117-118页
    7.2 材料与方法第118-124页
        7.2.1 轮虫的培养第118页
        7.2.2 实验设计第118-119页
        7.2.3 ROS、MDA含量和抗氧化酶活性测定第119-120页
            7.2.3.1 ROS测定第120页
            7.2.3.2 MDA测定第120页
            7.2.3.3 SOD测定第120页
            7.2.3.4 CAT测定第120页
            7.2.3.5 GSH测定第120页
        7.2.4 抗氧化酶基因mRNA表达水平测定第120-121页
        7.2.5 抗氧化蛋白体外原核表达和纯化第121-123页
            7.2.5.1 质粒转化至BL21 (DE3)感受态细胞第121页
            7.2.5.2 表达鉴定第121页
            7.2.5.3 表达优化第121-122页
            7.2.5.4 可溶性分析第122页
            7.2.5.5 放大表达与亲和纯化第122页
            7.2.5.6 Western Blot第122-123页
            7.2.5.7 透析第123页
        7.2.6 不同温度、pH和变性剂下蛋白活性分析第123-124页
        7.2.7 统计分析第124页
    7.3 结果第124-134页
        7.3.1 生长、存活和繁殖性能变化第124-126页
        7.3.2 ROS和MDA含量变化第126-128页
        7.3.3 SOD、CAT和GSH含量变化第128-129页
        7.3.4 MnSOD、 CuZnSOD和CAT mRNA表达水平变化第129-132页
        7.3.5 MnSOD蛋白原核表达纯化和不同胁迫下的活性测定第132-134页
    7.4 讨论第134-136页
    7.5 本章小结第136-137页
第8章 转录组水平上萼花臂尾轮虫响应有毒铜绿微囊藻的分子机理第137-156页
    8.1 引言第137-138页
    8.2 材料和方法第138-141页
        8.2.1 轮虫的培养第138页
        8.2.2 藻类的培养第138页
        8.2.3 实验设计第138页
        8.2.4 轮虫总RNA提取和转录组测序第138-139页
        8.2.5 测序原始数据处理第139页
        8.2.6 拼接结果的注释第139页
        8.2.7 基因表达量分析第139页
        8.2.8 COG分类第139-140页
        8.2.9 差异表达基因筛选第140页
        8.2.10 Gene Ontology功能显著性富集分析第140页
        8.2.11 Pathway显著性富集分析第140页
        8.2.12 差异表达基因的qPCR验证第140-141页
    8.3 结果第141-153页
        8.3.1 摄食有毒微囊藻和小球藻的轮虫种群生长率变化第141页
        8.3.2 萼花臂尾轮虫在不同培养条件下的RNA-seq第141-153页
            8.3.2.1 测序数据质量评估第141-142页
            8.3.2.2 转录本测序的组装与拼接以及基因功能注释第142-146页
            8.3.2.3 差异表达基因分析第146-153页
            8.3.2.4 实时定量检测RNA-seq数据第153页
    8.4 讨论第153-155页
    8.5 本章小结第155-156页
总结与展望第156-158页
参考文献第158-179页
在读期间发表的学术论文及研究成果第179-181页
致谢第181页

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