| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第13-24页 |
| 1.1 植物中多倍体进化的研究现状 | 第13-19页 |
| 1.1.1 多倍体的形成机制 | 第13-14页 |
| 1.1.2 同源多倍体和异源多倍体的差异 | 第14-15页 |
| 1.1.3 多倍体中广泛存在同祖染色体交换的现象 | 第15-16页 |
| 1.1.4 多倍体的强适应性 | 第16-17页 |
| 1.1.5 多倍体的进化 | 第17-18页 |
| 1.1.6 新合成多倍体的基因组修饰 | 第18-19页 |
| 1.2 异源四倍体烟草的进化 | 第19-20页 |
| 1.3 烟草中抗TMV基因N基因 | 第20-22页 |
| 1.3.1 抗病基因的进化 | 第20页 |
| 1.3.2 N基因的进化 | 第20-21页 |
| 1.3.3 N基因的温度敏感性 | 第21页 |
| 1.3.4 N基因与P50基因的互作 | 第21-22页 |
| 1.4 逆境对基因组稳定性的影响 | 第22页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第22-24页 |
| 2 材料和方法 | 第24-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2 参考基因组 | 第24页 |
| 2.3 TMV侵染以及抗性鉴定 | 第24页 |
| 2.4 烟草的杂交和发芽实验 | 第24-25页 |
| 2.5 N基因的定位与N基因所在染色体遗传图谱的构建 | 第25-28页 |
| 2.5.1 通过番茄的线性对N基因定位和侧翼序列标记的开发 | 第25-26页 |
| 2.5.2 利用BSA结合RNA测序的方法构建N基因连锁图谱 | 第26-28页 |
| 2.6 N基因所在染色体同祖染色体遗传图谱的构建 | 第28页 |
| 2.7 FPNIPCR方法对突变体侧翼序列的扩增 | 第28-31页 |
| 2.8 基因组原位杂交(Genome in situ hybridization,GISH) | 第31-35页 |
| 2.8.1 染色体固定 | 第31页 |
| 2.8.2 酶解制片 | 第31页 |
| 2.8.3 探针及封阻DNA的制备 | 第31-32页 |
| 2.8.4 原位杂交过程 | 第32-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-60页 |
| 3.1 N基因具有较高的自发突变率 | 第35-36页 |
| 3.2 构建高通量方法鉴定N基因功能缺失突变体 | 第36-38页 |
| 3.3 大部分N基因功能缺失由N基因及其侧翼序列的丢失引起 | 第38-40页 |
| 3.4 N基因所在染色体连锁图的构建 | 第40-42页 |
| 3.5 突变方式为染色体大片段序列丢失和整条染色体缺失 | 第42-44页 |
| 3.6 突变体N160发生了同祖染色体的交换 | 第44-47页 |
| 3.6.1 将突变体N160缺失边界定位于36bp之间 | 第44-45页 |
| 3.6.2 突变体N160独立突变事件后产生特有的序列 | 第45页 |
| 3.6.3 同祖染色体交换是突变体N160N位点大片段序列丢失的机制 | 第45-47页 |
| 3.7 NH-染色体连锁图谱的构建 | 第47-48页 |
| 3.8 突变体N160自交F2群体中同祖染色体上标记分离比例的偏离 | 第48-51页 |
| 3.9 染色体大片段缺失由同祖染色体交换引起 | 第51-52页 |
| 3.10 染色体丢失和同祖染色体交换是N基因功能缺失的主要原因 | 第52-53页 |
| 3.11 基因组原位杂交实验证明染色体的丢失和同祖染色体交换 | 第53-55页 |
| 3.12 同祖染色体交换只发生在N-染色体靠近端粒的位置 | 第55-57页 |
| 3.13 大片段缺失和同祖染色体交换对存活力的影响 | 第57-59页 |
| 3.14 PVY的入侵没有提高烟草中N基因的突变率 | 第59-60页 |
| 4 讨论 | 第60-65页 |
| 4.1 N基因的高突变率为自发突变,不是来源于无毒基因的压力 | 第60-61页 |
| 4.2 在多倍体基因组进化中过不同的遗传事件的比重不同 | 第61页 |
| 4.3 染色体不同位置发生同祖染色体交换的频率不同 | 第61-62页 |
| 4.4 烟草基因组中的染色体丢失 | 第62页 |
| 4.5 频繁的染色体丢失和同祖染色体的交换是多倍体快速进化的原因 | 第62-63页 |
| 4.6 未来的工作 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-73页 |
| 附录 | 第73-83页 |
| 附件一 论文中所用引物序列表 | 第73-80页 |
| 附件二 论文中调取的TN90基因组Scaffold信息 | 第80-81页 |
| 附件三 突变体N160中形成的特异嵌合序列N160-FS | 第81-82页 |
| 附件四 突变体N160与两个Scaffold比对的结果 | 第82-83页 |
| 作者简介 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84-86页 |
