| 摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 缩略词 | 第16-18页 |
| 第一章 绪论 | 第18-26页 |
| 1.1 湖泊微生物多样性 | 第18-19页 |
| 1.1.1 古生菌域 | 第18页 |
| 1.1.2 细菌域 | 第18-19页 |
| 1.1.3 真核生物域 | 第19页 |
| 1.2 湖泊微生物多样性研究方法 | 第19-21页 |
| 1.2.1 可培养湖泊细菌多样性的研究方法 | 第19-20页 |
| 1.2.2 研究湖泊细菌多样性的免培养方法 | 第20-21页 |
| 1.3 拮抗微生物的筛选 | 第21-23页 |
| 1.3.1 鲍曼不动杆菌 | 第22-23页 |
| 1.3.2 金黄色葡萄球菌 | 第23页 |
| 1.4 细菌的多相分类鉴定 | 第23-24页 |
| 1.5 本论文研究的立项依据 | 第24-26页 |
| 第二章 八个湖泊样品可培养细菌多样性分析 | 第26-54页 |
| 2.1 试验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 试验样品 | 第26页 |
| 2.1.2 培养基 | 第26页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第26页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第26-28页 |
| 2.2 试验方法 | 第28-29页 |
| 2.2.1 样品处理 | 第28页 |
| 2.2.2 可培养细菌区系的多样性 | 第28-29页 |
| 2.3 试验结果与分析 | 第29-53页 |
| 2.3.1 菌落表型特征挑选 | 第29-30页 |
| 2.3.2 基于细菌16S rDNA序列的分类鉴定 | 第30-47页 |
| 2.3.3 可培养细菌多样性和群落分析 | 第47-53页 |
| 2.4 本章小结 | 第53-54页 |
| 第三章 湖泊拮抗菌的筛选及四株拮抗菌的基因组分析 | 第54-69页 |
| 3.1 试验材料 | 第54-55页 |
| 3.1.1 试验样品 | 第54页 |
| 3.1.2 培养基与溶液 | 第54页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第54页 |
| 3.1.4 主要仪器 | 第54页 |
| 3.1.5 拮抗指示菌株 | 第54-55页 |
| 3.2 试验方法 | 第55-56页 |
| 3.2.1 拮抗菌的筛选 | 第55页 |
| 3.2.2 4株拮抗菌的基因组的测序 | 第55页 |
| 3.2.3 基于4株拮抗菌基因组序列的生物信息学分析 | 第55-56页 |
| 3.3 试验结果与分析 | 第56-68页 |
| 3.3.1 拮抗菌的筛选结果 | 第56-57页 |
| 3.3.2 基于4株拮抗菌株基因组序列的生物信息学分析 | 第57-68页 |
| 3.4 本章小结 | 第68-69页 |
| 第四章 七株新菌的多相分类 | 第69-111页 |
| 4.1 试验材料 | 第69-70页 |
| 4.1.1 菌株来源 | 第69-70页 |
| 4.1.2 培养基 | 第70页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第70页 |
| 4.1.4 主要仪器 | 第70页 |
| 4.2 试验方法 | 第70-73页 |
| 4.2.1 微生物表型特征及保藏 | 第71页 |
| 4.2.2 微生物生理生化特征的鉴定 | 第71-72页 |
| 4.2.3 微生物遗传学特征的分析鉴定 | 第72页 |
| 4.2.4 微生物化学特征的分析鉴定 | 第72-73页 |
| 4.3 试验结果与分析 | 第73-110页 |
| 4.3.1 柠檬色水交汇杆菌(Confluentibacter citreus) XJNY~T的多相分类鉴定 | 第73-78页 |
| 4.3.2 玫瑰色假红杆菌(Pseudorhodobacter roseum)XJSP~T的多相分类鉴定 | 第78-83页 |
| 4.3.3 盐生海杆菌(Marinobacter salexigens) HJR7~T的多相分类鉴定 | 第83-88页 |
| 4.3.4 海洋噬冷菌(Algoriphagus marinus) am2~T的多相分类鉴定 | 第88-94页 |
| 4.3.5 沉积物交替单胞菌(Alteromonas sediminis) U0105~T的多相分类鉴定 | 第94-99页 |
| 4.3.6 橘色极地杆菌(Polaribacter tangerinus)WS2-14~T的多相分类鉴定 | 第99-105页 |
| 4.3.7 红色海水菌(Aquimarina rubra)SS2-9~T的多相分类鉴定 | 第105-110页 |
| 4.4 本章小结 | 第110-111页 |
| 第五章 总结与展望 | 第111-114页 |
| 5.1 8个湖泊样品的细菌多样性的分析 | 第111页 |
| 5.2 7个湖泊样品拮抗菌的筛选 | 第111-112页 |
| 5.3 4株拮抗菌的基因组分析 | 第112页 |
| 5.4 7株新菌的多相分类 | 第112-113页 |
| 5.5 展望 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-128页 |
| 附录 | 第128-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
| 资助情况 | 第131-132页 |
| 攻读学位期间发表和撰写的学术论文目录 | 第132-134页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第134页 |
