| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第9-16页 |
| 1.1 高通量测序技术简介 | 第9-11页 |
| 1.1.1 常用的高通量测序平台 | 第9-10页 |
| 1.1.2 高通量测序在微生物研究中的应用-细菌分类及宏基因组…… | 第10-11页 |
| 1.2 湖泊细菌多样性的研究 | 第11页 |
| 1.3 本论文研究对象、目的及内容 | 第11-16页 |
| 1.3.1 研究对象 | 第11-13页 |
| 1.3.2 研究目的 | 第13页 |
| 1.3.3 研究内容 | 第13-15页 |
| 1.3.4 技术路线图 | 第15-16页 |
| 第二章 材料与方法 | 第16-21页 |
| 2.1 样品采集地点 | 第16-17页 |
| 2.2 样品采集与水样预处理 | 第17页 |
| 2.3 基因组DNA的提取 | 第17-19页 |
| 2.4 测序 | 第19-20页 |
| 2.4.1 PCR扩增 | 第19页 |
| 2.4.2 PCR产物的混样与纯化 | 第19页 |
| 2.4.3 文库构建与上机测序 | 第19-20页 |
| 2.5 实验中主要仪器、试剂信息 | 第20-21页 |
| 第三章 结果与分析 | 第21-40页 |
| 3.1 测序数据预处理与质控统计 | 第21-22页 |
| 3.2 OTUs聚类及物种注释 | 第22-27页 |
| 3.3 浮游细菌群落丰度与分布 | 第27-34页 |
| 3.4 浮游细菌群落组间分析 | 第34-40页 |
| 第四章 讨论 | 第40-43页 |
| 第五章 结论与展望 | 第43-45页 |
| 5.1 结论 | 第43-44页 |
| 5.2 展望 | 第44-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-51页 |
| 附录A | 第51-52页 |
| 附录B | 第52-61页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第61页 |