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整合分析RNA-seq数据鉴定猪骨骼肌生长发育相关lncRNAs

摘要第6-7页
abstract第7-8页
第一章 引言第12-22页
    1.1 长链非编码RNA研究进展第12-15页
        1.1.1 长链非编码RNA第12页
        1.1.2 长链非编码RNA基因组特征第12-13页
        1.1.3 lncRNA生物学功能及作用机制第13-14页
        1.1.4 长链非编码RNA在畜牧领域研究现状第14-15页
    1.2 长链非编码RNA分析策略第15-19页
        1.2.1 转录组研究方法的飞速发展第15页
        1.2.2 长链非编码RNA鉴定方法第15-17页
        1.2.3 长链非编码RNA功能分析及相关数据库第17-19页
    1.3 猪骨骼肌生长发育研究第19-20页
        1.3.1 猪骨骼肌生长发育过程第19页
        1.3.2 骨骼肌发育相关的lncRNA研究进展第19-20页
    1.4 本研究技术路线、目的意义第20-22页
        1.4.1 技术路线第20页
        1.4.2 目的意义第20-22页
第二章 材料与方法第22-26页
    2.1 实验数据来源第22页
    2.2 生物信息学分析方法第22-26页
        2.2.1 主要分析工具及数据库第22-23页
        2.2.2 数据质控原则第23页
        2.2.3 转录组比对、拼接和表达计算第23页
        2.2.4 lncRNA鉴定流程搭建第23-24页
        2.2.5 组织特异性分析第24页
        2.2.6 差异表达分析第24-25页
        2.2.7 PCA分析以及MDS分析第25页
        2.2.8 功能富集分析第25-26页
第三章 结果与分析第26-42页
    3.1 转录组数据概述以及质量评估结果第26-28页
        3.1.1 转录组数据概述第26页
        3.1.2 数据质量评估结果第26-28页
    3.2 lincRNA鉴定与分析第28-31页
        3.2.1 lincRNA鉴定结果第28-29页
        3.2.2 lincRNA比较分析第29页
        3.2.3 lincRNA分子特征第29-31页
    3.3 组织特异性分析结果第31-36页
    3.4 骨骼肌生长发育相关的lincRNA分析结果第36-42页
        3.4.1 lincRNA的MDS及PCA结果第36-38页
        3.4.2 骨骼肌不同发育阶段的差异表达第38-39页
        3.4.3 与骨骼肌不同发育阶段相关的lincRNA第39-42页
第四章 讨论第42-44页
第五章 全文总结第44-45页
参考文献第45-51页
致谢第51-52页
作者简历第52页

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