摘要 | 第6-7页 |
abstract | 第7-8页 |
第一章 引言 | 第12-22页 |
1.1 长链非编码RNA研究进展 | 第12-15页 |
1.1.1 长链非编码RNA | 第12页 |
1.1.2 长链非编码RNA基因组特征 | 第12-13页 |
1.1.3 lncRNA生物学功能及作用机制 | 第13-14页 |
1.1.4 长链非编码RNA在畜牧领域研究现状 | 第14-15页 |
1.2 长链非编码RNA分析策略 | 第15-19页 |
1.2.1 转录组研究方法的飞速发展 | 第15页 |
1.2.2 长链非编码RNA鉴定方法 | 第15-17页 |
1.2.3 长链非编码RNA功能分析及相关数据库 | 第17-19页 |
1.3 猪骨骼肌生长发育研究 | 第19-20页 |
1.3.1 猪骨骼肌生长发育过程 | 第19页 |
1.3.2 骨骼肌发育相关的lncRNA研究进展 | 第19-20页 |
1.4 本研究技术路线、目的意义 | 第20-22页 |
1.4.1 技术路线 | 第20页 |
1.4.2 目的意义 | 第20-22页 |
第二章 材料与方法 | 第22-26页 |
2.1 实验数据来源 | 第22页 |
2.2 生物信息学分析方法 | 第22-26页 |
2.2.1 主要分析工具及数据库 | 第22-23页 |
2.2.2 数据质控原则 | 第23页 |
2.2.3 转录组比对、拼接和表达计算 | 第23页 |
2.2.4 lncRNA鉴定流程搭建 | 第23-24页 |
2.2.5 组织特异性分析 | 第24页 |
2.2.6 差异表达分析 | 第24-25页 |
2.2.7 PCA分析以及MDS分析 | 第25页 |
2.2.8 功能富集分析 | 第25-26页 |
第三章 结果与分析 | 第26-42页 |
3.1 转录组数据概述以及质量评估结果 | 第26-28页 |
3.1.1 转录组数据概述 | 第26页 |
3.1.2 数据质量评估结果 | 第26-28页 |
3.2 lincRNA鉴定与分析 | 第28-31页 |
3.2.1 lincRNA鉴定结果 | 第28-29页 |
3.2.2 lincRNA比较分析 | 第29页 |
3.2.3 lincRNA分子特征 | 第29-31页 |
3.3 组织特异性分析结果 | 第31-36页 |
3.4 骨骼肌生长发育相关的lincRNA分析结果 | 第36-42页 |
3.4.1 lincRNA的MDS及PCA结果 | 第36-38页 |
3.4.2 骨骼肌不同发育阶段的差异表达 | 第38-39页 |
3.4.3 与骨骼肌不同发育阶段相关的lincRNA | 第39-42页 |
第四章 讨论 | 第42-44页 |
第五章 全文总结 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-51页 |
致谢 | 第51-52页 |
作者简历 | 第52页 |