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香菇内源型甲醛代谢关键酶GGT的全长cDNA克隆及外源表达研究

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
缩略语表第12-13页
1 前言第13-26页
    1.1 香菇概述第13-14页
    1.2 香菇内源型甲醛的研究第14-16页
        1.2.1 香菇甲醛形成机理第14-15页
        1.2.2 香菇甲醛存在规律第15-16页
    1.3 γ-谷氨酰转肽酶的研究第16-18页
        1.3.1 γ-谷氨酰转肽酶概述第16页
        1.3.2 GGT的序列和结构第16-17页
        1.3.3 GGT的酶学性质第17-18页
    1.4 RACE技术及其原理第18-21页
        1.4.1 RACE简介第18-19页
        1.4.2 3’RACE反应第19页
        1.4.3 5’RACE反应第19-20页
        1.4.4 RACE技术在基因研究中的应用第20-21页
    1.5 毕赤酵母表达系统第21-25页
        1.5.1 毕赤酵母宿主菌株第21-22页
        1.5.2 毕赤酵母表达载体第22-23页
        1.5.3 毕赤酵母甲醇利用型第23页
        1.5.4 外源基因转化毕赤酵母第23-25页
    1.6 本研究的目的和意义第25-26页
2 材料与方法第26-51页
    2.1 试验材料第26-27页
        2.1.1 供试菌株和载体第26页
        2.1.2 酶与试剂盒第26页
        2.1.3 其它试剂第26页
        2.1.4 常用仪器第26-27页
        2.1.5 培养基第27页
    2.2 试验方法第27-29页
        2.2.1 香菇子实体RNA提取及反转录第27-28页
        2.2.2 RNA检测第28页
        2.2.3 除去RNA中的DNA第28-29页
    2.3 香菇GGT cDNA特异性序列的获得第29-33页
        2.3.1 反转录合成cDNA第一链第29-31页
        2.3.2 PCR体系与程序第31页
        2.3.3 香菇GGT cDNA特异性序列电泳检测第31页
        2.3.4 PCR产物切胶回收第31-32页
        2.3.5 香菇GGT cDNA特异性序列的T-A克隆和测序第32-33页
        2.3.6 香菇GGT cDNA特异性序列测序结果的同源性分析第33页
        2.3.7 香菇GGT cDNA特异性序列测序结果CDS分析第33页
    2.4 香菇GGT cDNA 3’末端序列扩增第33-36页
        2.4.1 反转录反应第33-34页
        2.4.2 巢式PCR反应第34-35页
        2.4.3 琼脂糖凝胶电泳检测第35页
        2.4.4 香菇GGT cDNA 3’末端序列PCR产物切胶回收第35页
        2.4.5 香菇GGT cDNA 3’末端序列PCR产物T-A克隆与测序第35-36页
    2.5 香菇GGT cDNA 5’末端序列扩增第36-41页
        2.5.1 去磷酸化处理第36-37页
        2.5.2 “去帽子”反应第37页
        2.5.3 5’RACE Adaptor的连接第37-38页
        2.5.4 反转录反应第38-39页
        2.5.5 Outer PCR反应第39-40页
        2.5.6 Inner PCR反应第40页
        2.5.7 琼脂糖凝胶电泳第40页
        2.5.8 香菇GGT cDNA 3’末端序列PCR产物切胶回收第40页
        2.5.9 香菇GGT cDNA 3’末端序列PCR产物T-A克隆与测序第40-41页
        2.5.10 香菇GGT全长cDNA序列的拼接第41页
    2.6 香菇GGT的生物信息学分析第41-42页
        2.6.1 香菇GGT ORF及氨基酸序列预测第41页
        2.6.2 香菇GGT的氨基酸组成及理化性质分析第41页
        2.6.3 香菇GGT信号肽预测第41页
        2.6.4 香菇GGT糖基化位点预测第41页
        2.6.5 香菇GGT磷酸化位点预测第41-42页
        2.6.6 香菇GGT亲水/疏水性分析第42页
        2.6.7 不同物种GGT的氨基酸序列同源性对比第42页
    2.7 大肠杆菌表达载体和香菇GGT大肠杆菌工程菌的构建第42-46页
        2.7.1 香菇GGT基因的PCR扩增及产物回收测序第42-43页
        2.7.2 大肠杆菌重组表达载体的构建第43-44页
        2.7.3 香菇GGT大肠杆菌工程菌的构建第44页
        2.7.4 重组GGT的诱导表达和纯化第44-46页
    2.8 毕赤酵母表达载体和香菇GGT毕赤酵母工程菌的构建第46-51页
        2.8.1 香菇GGT基因的PCR扩增及产物回收测序第46-47页
        2.8.2 毕赤酵母重组表达载体的构建第47-48页
        2.8.3 香菇GGT毕赤酵母工程菌的构建第48-49页
        2.8.4 重组GGT的表达第49-51页
3 结果与分析第51-71页
    3.1 香菇子实体RNA提取及反转录第51-52页
        3.1.1 RNA提取及质量检测第51页
        3.1.2 除去RNA中的DNA第51-52页
    3.2 香菇GGT cDNA特异性序列的获得第52-54页
        3.2.1 香菇GGT cDNA特异性序列PCR及测序结果第52-53页
        3.2.2 香菇GGT特异性cDNA特异性序列同源性分析第53页
        3.2.3 香菇GGT cDNA特异性序列测序结果CDS分析第53-54页
    3.3 香菇GGT cDNA 3’末端序列扩增第54-55页
        3.3.1 香菇GGT cDNA 3’末端PCR结果第54页
        3.3.2 香菇GGT cDNA 3’末端测序结果第54-55页
    3.4 香菇GGT cDNA 5’末端扩增第55页
        3.4.1 香菇GGT cDNA 5’末端PCR结果第55页
    3.5 香菇GGT全长cDNA序列的拼接第55-56页
    3.6 香菇GGT的生物信息学分析第56-61页
        3.6.1 香菇GGT ORF及氨基酸序列预测第56页
        3.6.2 香菇GGT的氨基酸组成及理化性质分析第56-57页
        3.6.3 香菇GGT信号肽预测第57-58页
        3.6.4 香菇GGT糖基化位点预测第58页
        3.6.5 香菇GGT磷酸化位点预测第58-59页
        3.6.6 香菇GGT亲水/疏水性分析第59页
        3.6.7 不同物种GGT的氨基酸序列同源性对比第59-61页
    3.7 大肠杆菌表达载体和香菇GGT大肠杆菌工程菌的构建第61-66页
        3.7.1 香菇GGT基因的PCR扩增及产物回收测序第61页
        3.7.2 大肠杆菌重组表达载体的构建第61-62页
        3.7.3 香菇GGT大肠杆菌工程菌的构建第62-63页
        3.7.4 重组GGT的诱导表达和纯化第63-66页
    3.8 毕赤酵母表达载体和香菇GGT毕赤酵母工程菌的构建第66-71页
        3.8.1 香菇GGT基因的PCR扩增及产物回收测序第66页
        3.8.2 毕赤酵母重组表达载体的构建第66-68页
        3.8.3 香菇GGT毕赤酵母工程菌的构建第68-70页
        3.8.4 重组GGT的表达第70-71页
4 总结与讨论第71-75页
    4.1 总结第71-72页
    4.2 讨论第72-75页
        4.2.1 香菇GGT全长cDNA序列的克隆第72-73页
        4.2.2 大肠杆菌表达载体和香菇GGT大肠杆菌工程菌的构建第73页
        4.2.3 毕赤酵母表达载体和香菇GGT毕赤酵母工程菌的构建第73-75页
参考文献第75-81页
致谢第81-82页
附录一 RNA提取系列试剂第82-83页
附录二 香菇GGT cDNA特异性序列第83-84页
附录三 香菇GGT 3’末端序列第84-85页
附录四 香菇GGT 5’末端序列第85-86页
附录五 香菇GGT cDNA全长序列第86-88页
附录六 重组GGT纯化相关试剂配制第88页

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