蛋白质折叠类型的自动分类研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-26页 |
| 1.1 蛋白质分子结构与结构数据库 | 第10-18页 |
| 1.1.1 蛋白质结构层次 | 第10-17页 |
| 1.1.2 蛋白质结构数据库--PDB | 第17-18页 |
| 1.2 蛋白质折叠类型的分类研究 | 第18-23页 |
| 1.2.1 蛋白质结构分类数据库 | 第18-20页 |
| 1.2.2 蛋白质折叠类型分类方法的研究 | 第20-23页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第23页 |
| 1.4 课题来源及意义 | 第23-26页 |
| 第2章 蛋白质折叠类型模板设计及模板数据库的构建 | 第26-40页 |
| 2.1 引言 | 第26页 |
| 2.2 材料 | 第26-27页 |
| 2.3 方法 | 第27-33页 |
| 2.3.1 多结构比对算法--Mustang | 第27-28页 |
| 2.3.2 打分函数TM-score | 第28-29页 |
| 2.3.3 家族模板的设计与生成 | 第29-32页 |
| 2.3.4 系统聚类 | 第32页 |
| 2.3.5 折叠类型模板的设计与生成 | 第32-33页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第33-39页 |
| 2.4.1 家族模板数据库的构建 | 第33-34页 |
| 2.4.2 折叠类型模板数据库的构建 | 第34-35页 |
| 2.4.3 折叠类型模板相关参数计算与分析 | 第35-39页 |
| 2.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第3章 基于模板数据库的蛋白质折叠类型分类方法 | 第40-46页 |
| 3.1 引言 | 第40页 |
| 3.2 材料 | 第40-41页 |
| 3.3 方法 | 第41-42页 |
| 3.3.1 蛋白质折叠类型分类方法 | 第41页 |
| 3.3.2 评估参数 | 第41-42页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第42-45页 |
| 3.4.1 自洽性检验 | 第42-43页 |
| 3.4.2 独立性检验 | 第43-45页 |
| 3.5 本章小结 | 第45-46页 |
| 第4章 蛋白质折叠类型的自动化分类软件 | 第46-50页 |
| 4.1 引言 | 第46页 |
| 4.2 软件说明 | 第46-47页 |
| 4.2.1 软件组成 | 第46页 |
| 4.2.2 软件功能 | 第46页 |
| 4.2.3 应用环境 | 第46-47页 |
| 4.3 操作使用 | 第47-48页 |
| 4.3.1 解压 | 第47页 |
| 4.3.2 软件运行前的准备工作 | 第47页 |
| 4.3.3 运行过程 | 第47-48页 |
| 4.4 本章小结 | 第48-50页 |
| 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第58页 |
| 攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
