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马铃薯(Solanum tuberosum L.)试管薯形成相关SNP标记的开发与QTL分析

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
缩略表第11-12页
第一章 前言第12-22页
    1.1 马铃薯种植及营养第12页
    1.2 试管块茎的形成及优势第12-15页
        1.2.1 试管薯的形成第12-13页
        1.2.2 脱毒试管薯的优势第13-14页
        1.2.3 多种因素影响试管薯的形成第14-15页
    1.3 马铃薯块茎遗传研究进展第15-18页
        1.3.1 马铃薯块茎形成相关QTL的研究进展第15-16页
        1.3.2 马铃薯四体遗传及遗传图谱构建第16-18页
    1.4 基于BSA的RNA-seq测序分析以及SNP标记开发第18-21页
        1.4.1 BSA技术第18-19页
        1.4.2 SNP标记第19页
        1.4.3 HRM技术第19-21页
    1.5 课题的提出第21-22页
第二章 MT I群体试管薯相关性状表型鉴定第22-28页
    2.1 材料与方法第22-23页
        2.1.1 植物材料第22页
        2.1.2 研究方法第22-23页
            2.1.2.1 基础苗的培养及繁殖第22页
            2.1.2.2 试管薯的诱导培养第22-23页
            2.1.2.3 数据记录和统计分析第23页
    2.2 结果与分析第23-28页
        2.2.1 两种光周期下匍匐茎发生和试管薯形成时间的群体分布第23-24页
        2.2.2 两种光周期下试管薯形成和膨大能力的群体分布第24-26页
        2.2.3 两种光周期下试管薯形成方式的群体分布第26-28页
第三章 基于BSA的RNA-seq测序分析以及结薯表型相关SNP标记开发第28-41页
    3.1 材料与方法第28-33页
        3.1.1 供试材料及处理方法第28-29页
        3.1.2 转录组测序第29-31页
            3.1.2.1 Trizol法抽提植物总RNA与混样第29-30页
            3.1.2.2 RNA混样质量检测及建库测序第30-31页
        3.1.3 SNP位点分析及引物设计第31页
            3.1.3.1 差异SNP位点筛选第31页
            3.1.3.2 小片段法引物设计第31页
        3.1.4 利用高分辨率熔解曲线对SNP分型第31-33页
            3.1.4.1 CTAB法小提植物总DNA及模板配制第31-32页
            3.1.4.2 PCR扩增及HRM法对SNP分型第32-33页
    3.2 结果与分析第33-41页
        3.2.1 转录组测序分析第33-38页
        3.2.2 SNP标记分型第38-41页
第四章 遗传连锁图谱和试管薯形成QTL分析第41-53页
    4.1 SNP标记加密图谱第41-42页
    4.2 多个试管薯形成性状的单标记分析第42-48页
        4.2.1 结薯率第42页
        4.2.2 单薯重第42-43页
        4.2.3 初始结薯时间第43页
        4.2.4 不同表型相关标记比较第43-48页
    4.3 QTL定位第48-52页
        4.3.1 结薯率相关QTL的定位第48-51页
        4.3.2 单薯重相关QTL的定位第51页
        4.3.3 初始结薯时间相关QTL定位第51-52页
    4.4 单标记分析结果与QTL定位结果分析讨论第52-53页
        4.4.1 相关标记与QTL定位结果比较第52页
        4.4.2 两亲本间染色体上QTL定位分析讨论第52-53页
第五章 讨论第53-55页
    5.1 表型鉴定结果与前人数据比较第53页
    5.2 相关标记以及QTL定位结果与前人结果比较第53-54页
    5.3 小结与展望第54-55页
参考文献第55-61页
致谢第61页

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