| 摘要 | 第5-8页 |
| abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第14-48页 |
| 1.1 大肠杆菌简介 | 第14-18页 |
| 1.1.1 大肠杆菌的形态与结构特征 | 第15-16页 |
| 1.1.2 大肠杆菌的遗传与增殖 | 第16-18页 |
| 1.1.3 大肠杆菌的致病性 | 第18页 |
| 1.2 大肠杆菌运动性介绍 | 第18-28页 |
| 1.2.1 大肠杆菌的运动部件 | 第19-24页 |
| 1.2.2 大肠杆菌的个体游动 | 第24-26页 |
| 1.2.3 大肠杆菌的群体运动与生物膜形成 | 第26-28页 |
| 1.3 大肠杆菌趋化性介绍 | 第28-36页 |
| 1.3.1 大肠杆菌的受体系统 | 第28-31页 |
| 1.3.2 大肠杆菌的信号通路 | 第31-33页 |
| 1.3.3 大肠杆菌的趋化行为 | 第33-36页 |
| 1.4 模型建立 | 第36-43页 |
| 1.4.1 趋化转导模型 | 第36-41页 |
| 1.4.2 鞭毛马达模型 | 第41-43页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第43-45页 |
| 1.6 主要工作介绍 | 第45-48页 |
| 第二章 实验方法介绍 | 第48-56页 |
| 2.1 实验试剂配制 | 第48-49页 |
| 2.2 菌种改造的DNA重组技术介绍 | 第49-56页 |
| 2.2.1 热击法转化 | 第50-51页 |
| 2.2.2 电穿孔转化 | 第51-52页 |
| 2.2.3 聚合酶链式反应 | 第52-53页 |
| 2.2.4 λ噬菌体Red重组系统基因删除 | 第53-56页 |
| 第三章 生长条件对大肠杆菌趋化的影响 | 第56-78页 |
| 3.1 实验背景与意义 | 第56页 |
| 3.2 实验过程和数据采集 | 第56-65页 |
| 3.2.1 细菌的培养与处理 | 第57-59页 |
| 3.2.2 实验观察样品的制作 | 第59-61页 |
| 3.2.3 实验装置与原理介绍 | 第61-63页 |
| 3.2.4 实验数据采集 | 第63-65页 |
| 3.3 实验数据的处理 | 第65-67页 |
| 3.3.1 小球标记法实验数据基本处理 | 第65-66页 |
| 3.3.2 毛细管实验数据 | 第66-67页 |
| 3.4 实验数据分析与说明 | 第67-73页 |
| 3.4.1 生长曲线 | 第67-68页 |
| 3.4.2 CW bias分布测量 | 第68-69页 |
| 3.4.3 无刺激下的马达关联时间 | 第69-70页 |
| 3.4.4 高浓度刺激下的恢复时间测量 | 第70-72页 |
| 3.4.5 毛细管实验 | 第72-73页 |
| 3.5 模拟部分 | 第73-77页 |
| 3.5.1 粗粒化建模解释更快的适应和恢复 | 第73-75页 |
| 3.5.2 模拟证明更快适应的好处 | 第75-76页 |
| 3.5.3 提高跟随时空变化环境的能力 | 第76-77页 |
| 3.5.4 提高定位到引诱剂浓度峰值的能力 | 第77页 |
| 3.6 工作小结 | 第77-78页 |
| 第四章 受体协同作用对大肠杆菌趋化的影响 | 第78-100页 |
| 4.1 实验背景与意义 | 第78页 |
| 4.2 实验过程和数据采集 | 第78-85页 |
| 4.2.1 细菌的培养与处理 | 第79-80页 |
| 4.2.2 实验观察样品的制备 | 第80页 |
| 4.2.3 实验装置与原理介绍 | 第80-84页 |
| 4.2.4 实验数据采集 | 第84-85页 |
| 4.3 实验数据处理 | 第85-86页 |
| 4.4 实验数据分析与说明 | 第86-95页 |
| 4.4.1 不同种类受体相互作用对大肠杆菌适应行为的影响 | 第86-87页 |
| 4.4.2 单种受体菌种的部分适应行为 | 第87-91页 |
| 4.4.3 剂量响应曲线的比较 | 第91-92页 |
| 4.4.4 不同受体比例下的过冲现象研究 | 第92页 |
| 4.4.5 过冲现象的发生条件探究 | 第92-93页 |
| 4.4.6 单种受体台阶刺激响应的过冲行为 | 第93-94页 |
| 4.4.7 受体差异对细菌趋化能力的影响 | 第94-95页 |
| 4.5 模拟单种受体细菌的部分适应行为 | 第95-97页 |
| 4.6 工作小结 | 第97-100页 |
| 第五章 马达的适应对大肠杆菌趋化的影响 | 第100-108页 |
| 5.1 背景与意义 | 第100页 |
| 5.2 模型的建立 | 第100-104页 |
| 5.2.1 马达适应性重组的模型构建 | 第100-102页 |
| 5.2.2 模型的检验与预测 | 第102-104页 |
| 5.3 模型的应用 | 第104-107页 |
| 5.3.1 受体与马达的适应对趋化系统适应的贡献 | 第104-105页 |
| 5.3.2 对微量刺激台阶响应的随机模拟 | 第105-106页 |
| 5.3.3 稳态下转向自发振荡的随机模拟 | 第106-107页 |
| 5.4 工作小结 | 第107-108页 |
| 第六章 总结与展望 | 第108-110页 |
| 6.1 工作总结 | 第108-109页 |
| 6.2 工作展望 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-120页 |
| 致谢 | 第120-122页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第122页 |