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拟南芥NRG2与NLP7调控NRT1.1的分子机理研究

符号说明第5-11页
中文摘要第11-14页
Abstract第14-16页
1 前言第17-37页
    1.1 氮素研究的意义第17-19页
        1.1.1 氮素对植物生长发育的影响第17-18页
        1.1.2 氮肥施用现状及造成的环境危害第18-19页
    1.2 植物对氮素吸收利用的分子机理第19-26页
        1.2.1 NRT1转运蛋白家族第20-22页
        1.2.2 NRT2转运蛋白家族第22-23页
        1.2.3 CLC转运蛋白家族第23页
        1.2.4 SLAC/SLAH转运蛋白家族第23-24页
        1.2.5 植物对NH_4~+的吸收第24-25页
        1.2.6 植物体内NO_3~-的同化第25-26页
    1.3 NO_3~-调控基因的研究第26-35页
        1.3.1 调控NO_3~-短期效应的基因第27-32页
            1.3.1.1 NO_3~-感应子第27页
            1.3.1.2 蛋白激酶第27-29页
            1.3.1.3 转录因子第29-31页
            1.3.1.4 NRG2在NO_3~-信号途径中的作用第31-32页
        1.3.2 调控NO_3~-长期效应的基因第32-35页
    1.4 本研究的目的及意义第35-37页
2 材料与方法第37-59页
    2.1 实验材料第37-43页
        2.1.1 植物材料第37页
        2.1.2 菌株与质粒第37页
        2.1.3 酶与试剂第37-41页
            2.1.3.1 酶第37页
            2.1.3.2 试剂第37-38页
            2.1.3.3 试剂盒第38页
            2.1.3.4 溶液、缓冲液及培养基配方第38-41页
        2.1.4 仪器与设备第41页
        2.1.5 引物第41-43页
    2.2 实验方法第43-59页
        2.2.1 植物材料培养及拟南芥的生长第43-45页
            2.2.1.1 培养基配制第43页
            2.2.1.2 种子消毒处理第43-44页
            2.2.1.3 拟南芥的竖直培养第44页
            2.2.1.4 拟南芥的六孔板培养第44页
            2.2.1.5 拟南芥的Magenta Box培养第44-45页
            2.2.1.6 拟南芥的正常生长第45页
        2.2.2 双突变体的构建第45-46页
            2.2.2.1 拟南芥的杂交第45页
            2.2.2.2 拟南芥基因组提取第45-46页
            2.2.2.3 PCR扩增第46页
        2.2.3 构建转基因株系表达载体第46-50页
            2.2.3.1 植物总RNA的提取第46-47页
            2.2.3.2 反转录第47页
            2.2.3.3 Phusion PCR扩增第47-48页
            2.2.3.4 PCR产物回收(试剂盒法)第48页
            2.2.3.5 TOPO连接反应第48页
            2.2.3.6 大肠杆菌感受态的制备第48-49页
            2.2.3.7 大肠杆菌感受态细胞的转化第49页
            2.2.3.8 质粒提取第49-50页
            2.2.3.9 DNA序列的测定第50页
            2.2.3.10 LR反应第50页
            2.2.3.11 质粒DNA的酶切鉴定第50页
        2.2.4 农杆菌介导的拟南芥的遗传转化第50-52页
            2.2.4.1 根癌农杆菌GV3101感受态细胞的制备第50-51页
            2.2.4.2 表达载体转化农杆菌第51页
            2.2.4.3 拟南芥的转化第51-52页
        2.2.5 qPCR实验技术第52页
        2.2.6 硝态氮含量测定第52-54页
        2.2.7 NR活性的测定第54-55页
            2.2.7.1 标准曲线的制作第54-55页
            2.2.7.2 样品中NR活性的测定第55页
        2.2.8 染色体免疫共沉淀技术(ChIP)第55-57页
            2.2.8.1 染色体与蛋白交联(室温)第56页
            2.2.8.2 染色体准备(4℃)第56页
            2.2.8.3 免疫共沉淀第56页
            2.2.8.4 Elution和解交联(4℃和室温)第56-57页
            2.2.8.5 清洗DNA(室温)第57页
        2.2.9 电泳迁移率变动分析(EMSA)第57-59页
3 结果与分析第59-90页
    3.1 拟南芥NRG2基因的表达与定位第59-61页
        3.1.1 NRG2基因在不同氮素处理下的表达分析第59-60页
        3.1.2 NO_3~-对NRG2蛋白定位的影响第60-61页
    3.2 NRG2对NO_3~-积累及同化的调控第61-64页
        3.2.1 NRG2对NO_3~-积累的影响第61-63页
        3.2.2 NRG2对NO_3~-同化的影响第63-64页
    3.3 NRG2基因调控NRT1.1的遗传学分析第64-68页
        3.3.1 利用双突变体chl1-13 nrg2-2研究NRG2对NRT1.1的调控第64-66页
            3.3.1.1 双突变体chl1-13 nrg2-2中NO_3~-含量测定第64-65页
            3.3.1.2 双突变体chl1-13 nrg2-2中NO_3~-诱导基因的表达第65-66页
        3.3.2 利用转基因株系NRT1.1/nrg2-2研究NRG2对NRT1.1的调控第66-68页
            3.3.2.1 转基因株系NRT1.1/nrg2-2中NRT1.1的表达分析第66-67页
            3.3.2.2 转基因株系NRT1.1/nrg2-2中的NO_3~-含量测定第67-68页
            3.3.2.3 转基因株系NRT1.1/nrg2-2中的NO_3~-诱导基因表达第68页
    3.4 nrg2-2和chl1-13突变体的转录组分析第68-71页
        3.4.1 测序数据质量评估第68-69页
        3.4.2 差异表达基因统计及GO分析第69-71页
    3.5 NRG2结合NRT1.1启动子的分析第71-74页
        3.5.1 NRG2家族的蛋白结构分析第71-73页
        3.5.2 NRG2与NRT1.1启动子结合的分析第73-74页
    3.6 NLP7基因调控NRT1.1的遗传学分析第74-83页
        3.6.1 NLP7基因调控NRT1.1基因表达检测第74-76页
        3.6.2 对双突变体chl1-13 nlp7-4的鉴定分析第76-80页
            3.6.2.1 双突变体chl1-13 nlp7-4的荧光表型检测第76-77页
            3.6.2.2 双突变体chl1-13 nlp7-4的NO_3~-含量检测第77-78页
            3.6.2.3 NLP7对NO_3~-积累及同化的调控第78-80页
            3.6.2.4 双突变体chl1-13 nlp7-4中NR活性的检测第80页
        3.6.3 对转基因株系NRT1.1/nlp7-4的鉴定分析第80-83页
            3.6.3.1 转基因株系NRT1.1/nlp7-4中NRT1.1的表达分析第80-81页
            3.6.3.2 转基因株系NRT1.1/nlp7-4的荧光表型检测第81-82页
            3.6.3.3 转基因株系NRT1.1/nlp7-4的NO_3~-含量及NR活性检测第82-83页
            3.6.3.4 NRT1.1/nlp7-4互补株系中NO_3~-诱导基因的表达第83页
    3.7 chl1-13和nlp7-4突变体的转录组分析第83-87页
        3.7.1 测序数据质量评估第84页
        3.7.2 差异表达基因统计及GO分析第84-87页
    3.8 NLP7结合NRT1.1的启动子的分析第87-90页
        3.8.1 ChIP实验证明NLP7与NRT1.1启动子的结合第87-88页
        3.8.2 EMSA实验证明NLP7与NRT1.1启动子的结合第88-90页
4 讨论第90-94页
    4.1 NRG2不受氮素的调控第90页
    4.2 NRG2与NRT1.1的调控关系第90-91页
    4.3 NLP7与NRT1.1的调控关系第91-94页
5 结论第94-95页
参考文献第95-106页
致谢第106-107页
攻读学位期间发表的论文及成果第107页

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