| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-17页 |
| 1.1.1 BRCA1/2简介 | 第12-13页 |
| 1.1.2 BRCA1/2突变研究现状 | 第13页 |
| 1.1.3 其它与遗传性乳腺癌相关的易感基因简介 | 第13页 |
| 1.1.4 BRCA1/2突变检测方法 | 第13-14页 |
| 1.1.5 目标富集方法 | 第14-16页 |
| 1.1.6 DNA文库构建 | 第16-17页 |
| 1.1.7 BRCA1/2相关乳腺癌的治疗 | 第17页 |
| 1.2 研究内容 | 第17-18页 |
| 1.3 研究目的及意义 | 第18-20页 |
| 第二章 BRCA1/2全外显子多重PCR靶向富集引物设计及反应条件优化 | 第20-32页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.2.1 主要实验仪器与设备 | 第20页 |
| 2.2.2 主要实验试剂 | 第20页 |
| 2.2.3 实验样本 | 第20-21页 |
| 2.3 基因组DNA提取及纯度鉴定 | 第21-22页 |
| 2.3.1 全血液基因组DNA提取 | 第21页 |
| 2.3.2 DNA纯度鉴定 | 第21-22页 |
| 2.4 BRCA1全外显子富集 | 第22-26页 |
| 2.4.1 BRCA1特异性引物设计与合成 | 第22-24页 |
| 2.4.2 BRCA1全外显子多重PCR扩增 | 第24页 |
| 2.4.3 磁珠纯化 | 第24-25页 |
| 2.4.4 Qubit定量 | 第25页 |
| 2.4.5 琼脂糖凝胶电泳 | 第25页 |
| 2.4.6 结果与讨论 | 第25-26页 |
| 2.5 BRCA2全外显子富集 | 第26-30页 |
| 2.5.1 BRCA2特异性引物设计与合成 | 第26-27页 |
| 2.5.2 BRCA2全外显子多重PCR扩增 | 第27-28页 |
| 2.5.3 结果与讨论 | 第28-30页 |
| 2.6 本章小结 | 第30-32页 |
| 第三章 BRCA1/2全外显子多重PCR靶向测序及其在正常人群中的测试应用 | 第32-50页 |
| 3.1 引言 | 第32页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第32-37页 |
| 3.2.1 实验样本 | 第32页 |
| 3.2.2 主要实验仪器与设备 | 第32-33页 |
| 3.2.3 主要实验试剂与分析软件 | 第33页 |
| 3.2.4 基因组DNA提取及纯度鉴定 | 第33-34页 |
| 3.2.5 BRCA1/2全外显子富集 | 第34-37页 |
| 3.3 数据分析 | 第37页 |
| 3.4 Sanger测序 | 第37-38页 |
| 3.5 结果与讨论 | 第38-47页 |
| 3.5.1 文库产出 | 第38-39页 |
| 3.5.2 文库长度分布 | 第39页 |
| 3.5.3 覆盖度、测序深度及捕获效率分析 | 第39-45页 |
| 3.5.4 BRCA1/2全外显子位点变异识别 | 第45-47页 |
| 3.6 本章小结 | 第47-50页 |
| 第四章 BRCA1/2全外显子多重PCR靶向测序技术在乳腺癌患者血液基因组DNA的变异检测中应用 | 第50-64页 |
| 4.1 引言 | 第50页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第50-53页 |
| 4.2.1 样本类型及要求 | 第50页 |
| 4.2.2 主要实验仪器与设备 | 第50-51页 |
| 4.2.3 主要实验试剂与分析软件 | 第51页 |
| 4.2.4 基因组DNA提取及纯度鉴定 | 第51页 |
| 4.2.5 BRCA1/2全外显子富集 | 第51-53页 |
| 4.2.6 数据分析 | 第53页 |
| 4.2.7 Sanger测序 | 第53页 |
| 4.2.8 SNPs致病性分析及预测 | 第53页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第53-62页 |
| 4.3.1 研究对象基本资料 | 第53-54页 |
| 4.3.2 文库产出 | 第54-55页 |
| 4.3.3 文库长度分布 | 第55页 |
| 4.3.4 覆盖度及测序深度分析 | 第55-57页 |
| 4.3.5 BRCA1/2全外显子位点变异识别 | 第57-59页 |
| 4.3.6 健康样本和乳腺癌样本检出SNPs比较 | 第59-61页 |
| 4.3.7 SNPs致病性分析及预测 | 第61-62页 |
| 4.4 成本效益 | 第62页 |
| 4.5 本章小结 | 第62-64页 |
| 第五章 总结与展望 | 第64-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 作者简介 | 第72页 |
