| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 符号说明 | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-33页 |
| 1.1 涝害的严重性 | 第16页 |
| 1.2 淹涝的危害 | 第16-21页 |
| 1.2.1 淹涝对根系活力的影响 | 第17页 |
| 1.2.2 淹涝胁迫对作物细胞膜的影响 | 第17页 |
| 1.2.3 淹涝胁迫对光合作用的影响 | 第17-18页 |
| 1.2.4 淹涝胁迫对呼吸作用的影响 | 第18页 |
| 1.2.5 淹涝胁迫对植物激素的影响 | 第18-21页 |
| 1.2.5.1 乙烯 | 第19-20页 |
| 1.2.5.2 脱落酸 | 第20页 |
| 1.2.5.3 生长素 | 第20页 |
| 1.2.5.4 赤霉素 | 第20-21页 |
| 1.2.5.5 水杨酸与茉莉酸 | 第21页 |
| 1.3 作物的耐涝机制 | 第21-26页 |
| 1.3.1 形态解剖适应性 | 第22-24页 |
| 1.3.1.1 不定根 | 第22-23页 |
| 1.3.1.2 通气组织 | 第23页 |
| 1.3.1.3 径向氧损失屏障 | 第23页 |
| 1.3.1.4 顶端组织伸长 | 第23-24页 |
| 1.3.2 生理生化适应性 | 第24-26页 |
| 1.3.2.1 淹涝诱导硝酸盐呼吸代谢 | 第24页 |
| 1.3.2.2 淹涝诱导非共生性血红蛋白的形成 | 第24-25页 |
| 1.3.2.3 淹涝诱导脯氨酸积累 | 第25页 |
| 1.3.2.4 淹涝诱导多胺积累 | 第25-26页 |
| 1.4 作物的耐涝性的遗传及改良 | 第26-30页 |
| 1.4.1 耐涝性遗传 | 第26-27页 |
| 1.4.2 耐涝QTL定位 | 第27-28页 |
| 1.4.3 耐涝QTL图位克隆及功能解析 | 第28-29页 |
| 1.4.4 利用基因工程的遗传改良 | 第29-30页 |
| 1.5 黄瓜耐涝研究现状 | 第30-32页 |
| 1.5.1 黄瓜受涝症状 | 第30页 |
| 1.5.2 黄瓜种质耐涝性鉴定 | 第30-31页 |
| 1.5.3 黄瓜耐涝生理、生化研究 | 第31页 |
| 1.5.4 黄瓜耐涝QTL定位 | 第31-32页 |
| 1.6 研究目的意义 | 第32-33页 |
| 第二章 涝胁迫条件下不定根形成的转录组分析 | 第33-50页 |
| 2.1 材料与方法 | 第33-38页 |
| 2.1.1 植物材料及处理 | 第33页 |
| 2.1.2 总RNA提取 | 第33-34页 |
| 2.1.3 RNA样品检测、文库构建及质控 | 第34-35页 |
| 2.1.4 测序 | 第35页 |
| 2.1.5 生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 2.1.6 qRT-PCR | 第36-37页 |
| 2.1.7 基因表达差异的分析方法 | 第37页 |
| 2.1.8 乙烯释放量测定 | 第37-38页 |
| 2.1.9 内源ABA含量测定 | 第38页 |
| 2.2 结果分析 | 第38-43页 |
| 2.2.1 不定根原基形成观察 | 第38-39页 |
| 2.2.2 RNA-seq数据分析 | 第39-41页 |
| 2.2.3 差异基因功能分类 | 第41-42页 |
| 2.2.4 转录因子相关基因 | 第42-43页 |
| 2.3 讨论 | 第43-50页 |
| 第三章 涝胁迫条件下不定根形成的蛋白组分析 | 第50-64页 |
| 3.1 材料与方法 | 第50-54页 |
| 3.1.1 植物材料及处理 | 第50-51页 |
| 3.1.2 总蛋白提取 | 第51页 |
| 3.1.3 蛋白质Bradford定量 | 第51页 |
| 3.1.4 SDS电泳 | 第51-52页 |
| 3.1.5 蛋白质酶解与iTRAQ标记 | 第52页 |
| 3.1.6 SCX柱分离 | 第52页 |
| 3.1.7 LC-ESI-MSMS分析 | 第52-53页 |
| 3.1.8 肽段、蛋白质鉴定及分析 | 第53页 |
| 3.1.9 qRT-PCR | 第53页 |
| 3.1.10 生理指标测定 | 第53页 |
| 3.1.11 内源茉莉酸含量测定 | 第53-54页 |
| 3.2 结果分析 | 第54-61页 |
| 3.2.1 淹涝胁迫差异表达蛋白筛选 | 第54-55页 |
| 3.2.2 差异蛋白功能分类 | 第55-58页 |
| 3.2.3 蛋白互作分析 | 第58-59页 |
| 3.2.4 淹涝导致相关生理指标的变化 | 第59-60页 |
| 3.2.5 iTRAQ与RNA-seq相关性分析 | 第60-61页 |
| 3.3 讨论 | 第61-64页 |
| 第四章 涝胁迫条件下不定根数的遗传及QTL定位 | 第64-78页 |
| 4.1 材料与方法 | 第64-68页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第64页 |
| 4.1.2 淹涝处理及不定根统计 | 第64-65页 |
| 4.1.3 遗传效应分析 | 第65页 |
| 4.1.4 遗传图谱构建 | 第65-68页 |
| 4.1.4.1 DNA提取 | 第65-66页 |
| 4.1.4.2 SSR分子标记 | 第66页 |
| 4.1.4.3 PCR扩增 | 第66-67页 |
| 4.1.4.4 聚丙烯酰胺凝胶检测 | 第67页 |
| 4.1.4.5 银染 | 第67页 |
| 4.1.4.6 带型统计 | 第67-68页 |
| 4.1.4.7 遗传图谱构建 | 第68页 |
| 4.1.4.8 QTL定位 | 第68页 |
| 4.2 结果分析 | 第68-75页 |
| 4.2.1 淹涝后各世代下胚轴不定根数的次数分布 | 第68-70页 |
| 4.2.2 候选模型选择与适合性检验 | 第70-72页 |
| 4.2.3 最适模型下的遗传参数估计 | 第72-73页 |
| 4.2.4 SSR遗传图谱构建及QTL检测 | 第73-75页 |
| 4.3 讨论 | 第75-78页 |
| 第五章 涝胁迫条件下不定根数主效QTLARN6.1的精细定位及候选基因功能解析 | 第78-100页 |
| 5.1 材料与方法 | 第78-85页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第78-79页 |
| 5.1.2 淹涝处理及不定根统计 | 第79页 |
| 5.1.3 混合群体分离分析法(BSA)简化基因组测序 | 第79页 |
| 5.1.4 SNP index关联分析 | 第79-80页 |
| 5.1.5 ED关联分析 | 第80页 |
| 5.1.6 双亲重测序 | 第80页 |
| 5.1.7 dCAPs标记开发及多态性鉴定 | 第80-81页 |
| 5.1.8 候选基因功能注释 | 第81页 |
| 5.1.9 候选基因的亚细胞定位 | 第81-82页 |
| 5.1.10 候选基因的原核表达及ATPase酶活力测定 | 第82-83页 |
| 5.1.11 候选基因的表达载体构建及拟南芥转化 | 第83-85页 |
| 5.1.12 转基因植株表型观察 | 第85页 |
| 5.2 结果分析 | 第85-97页 |
| 5.2.1 基于SLAF-seq的涝胁迫下不定根主效QTL鉴定 | 第85-87页 |
| 5.2.2 重组株鉴定及精细定位 | 第87-89页 |
| 5.2.3 候选基因确定 | 第89-92页 |
| 5.2.4 Csa6G504460分子生物学特征鉴定 | 第92-94页 |
| 5.2.5 ATPase与不定根形成之间的关系 | 第94-96页 |
| 5.2.6 Csa6G504460的转基因功能验证 | 第96-97页 |
| 5.3 讨论 | 第97-100页 |
| 全文结论 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第118-120页 |
