| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 文献综述 | 第10-26页 |
| 1.1 药用植物的分子鉴定 | 第10-13页 |
| 1.2 遗传多样性 | 第13-19页 |
| 1.2.1 遗传多样性的概念 | 第14-15页 |
| 1.2.2 影响遗传多样性的因素 | 第15-18页 |
| 1.2.3 遗传多样性的研究方法 | 第18-19页 |
| 1.3 叶绿体基因组的研究进展 | 第19页 |
| 1.4 石斛属的遗传学研究进展 | 第19-23页 |
| 1.4.1 石斛属的概况 | 第19-20页 |
| 1.4.2 石斛属种质保护的遗传学研究 | 第20-21页 |
| 1.4.3 石斛属植物种质保护面临的挑战 | 第21-23页 |
| 1.5 金钗石斛的研究现状 | 第23-24页 |
| 1.6 研究的目的与意义 | 第24-26页 |
| 第2章 金钗石斛的种质保存 | 第26-36页 |
| 2.1 材料和方法 | 第26-30页 |
| 2.1.1 材料 | 第26页 |
| 2.1.2 方法 | 第26-30页 |
| 2.2 结果和分析 | 第30-33页 |
| 2.2.1 单因素实验结果统计 | 第30-31页 |
| 2.2.2 交实验结果统计 | 第31-33页 |
| 2.2.3 组织培养 | 第33页 |
| 2.3 讨论 | 第33-36页 |
| 2.3.1 各因素水平对金钗石斛结实率的影响 | 第34页 |
| 2.3.2 正交实验设计在金钗石斛结实率提高中的应用 | 第34-35页 |
| 2.3.3 种质保存的意义 | 第35-36页 |
| 第3章 金钗石斛野生居群的遗传多样性及遗传结构分析 | 第36-54页 |
| 3.1 引言 | 第36-37页 |
| 3.2 材料与方法 | 第37-41页 |
| 3.2.1 实验材料与保存 | 第37-38页 |
| 3.2.2 微卫星数据的获取及质量控制 | 第38-39页 |
| 3.2.3 遗传多样性分析 | 第39页 |
| 3.2.4 居群遗传结构分析 | 第39-40页 |
| 3.2.5 离隔离格局检验 | 第40页 |
| 3.2.6 瓶颈效应及遗传障碍检测 | 第40-41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-48页 |
| 3.3.1 居群遗传多样性 | 第41-42页 |
| 3.3.2 居群的遗传结构 | 第42-45页 |
| 3.3.3 基因流 | 第45-46页 |
| 3.3.4 瓶颈效应和奠基者效应 | 第46-48页 |
| 3.4 讨论 | 第48-54页 |
| 3.4.1 遗传多样性以及居群结构 | 第48-50页 |
| 3.4.2 最近的统计事件 | 第50-51页 |
| 3.4.3 金钗石斛保护和管理策略 | 第51-54页 |
| 第4章 金钗石斛叶绿体比较基因组学研究 | 第54-66页 |
| 4.1 引言 | 第54页 |
| 4.2 材料与方法 | 第54-57页 |
| 4.2.1 材料 | 第54页 |
| 4.2.2 DNA的提取和纯化 | 第54-55页 |
| 4.2.3 测序文库的构建、序列的组装 | 第55-56页 |
| 4.2.4 基因标注 | 第56页 |
| 4.2.5 金钗石斛叶绿体基因组提交至DDBJ | 第56页 |
| 4.2.6 金钗石斛叶绿体基因组的比较 | 第56页 |
| 4.2.7 金钗石斛cpSSR的开发 | 第56-57页 |
| 4.3 结果与分析 | 第57-63页 |
| 4.3.1 金钗石斛的测序结果 | 第57页 |
| 4.3.2 金钗石斛的叶绿体基因组结构分析 | 第57-58页 |
| 4.3.3 金钗石斛叶绿体基因组的比较分析 | 第58-62页 |
| 4.3.4 金钗石斛的cpSSR | 第62-63页 |
| 4.4 讨论 | 第63-66页 |
| 4.4.1 叶绿体比较基因组学在兰科植物中的应用 | 第63-64页 |
| 4.4.2 石斛属比较基因组的应用前景 | 第64-66页 |
| 第5章 基于叶绿体基因组片段和real-time PCR技术鉴别金钗石斛药材 | 第66-79页 |
| 5.1 引言 | 第66-67页 |
| 5.2 材料与方法 | 第67-72页 |
| 5.2.1 样本的采集与保存 | 第67-68页 |
| 5.2.2 方法 | 第68-72页 |
| 5.2.2.1 DNA提取 | 第68-69页 |
| 5.2.2.2 ycf1和trnL-trnF序列的获得 | 第69-70页 |
| 5.2.2.3 系统发生分析与特异性位点的获得 | 第70-71页 |
| 5.2.2.4 叶绿体片段预扩增体系及反应条件 | 第71页 |
| 5.2.2.5 基于SYBR Green Ⅰ的real-time PCR扩增体系及反应条件 | 第71-72页 |
| 5.3 结果和分析 | 第72-76页 |
| 5.3.1 ycf1和trnL-trnF序列 | 第72-74页 |
| 5.3.2 鉴定金钗石斛的特异性位点 | 第74-76页 |
| 5.4 讨论 | 第76-79页 |
| 5.4.1 real-time PCR技术与种质鉴别 | 第76-77页 |
| 5.4.2 叶绿体基因组片段在real-time PCR技术中的应用 | 第77-79页 |
| 第6章 结论与展望 | 第79-82页 |
| 6.1 结论 | 第79-81页 |
| 6.2 展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-106页 |
| 附录 | 第106-108页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109页 |
