| 摘要 | 第10-13页 |
| 英文摘要 | 第13-16页 |
| 1 前言 | 第17-29页 |
| 1.1 禽流感病毒（Avian influenza virus，AIV）概述 | 第17-20页 |
| 1.1.1 AIV生物学特性 | 第17-18页 |
| 1.1.2 AIV致病的分子基础 | 第18-20页 |
| 1.2 蛋白质组学概述 | 第20-25页 |
| 1.2.1 蛋白质组学起源与发展 | 第20-21页 |
| 1.2.2 蛋白质组学主要技术 | 第21-24页 |
| 1.2.3 蛋白质组学在流感病毒研究中的应用 | 第24-25页 |
| 1.3 基因组芯片技术 | 第25-28页 |
| 1.3.1 基因组芯片简介 | 第25-26页 |
| 1.3.2 芯片数据分析与注释 | 第26-27页 |
| 1.3.3 基因组芯片技术在流感病毒研究中的应用 | 第27-28页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第28-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-31页 |
| 2.1.1 实验动物与毒株 | 第29页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第29页 |
| 2.1.3 主要溶液配制 | 第29-30页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第30-31页 |
| 2.2 实验方法 | 第31-44页 |
| 2.2.1 动物实验 | 第31-32页 |
| 2.2.2 组织病毒含量检测 | 第32页 |
| 2.2.3 病理学分析 | 第32-33页 |
| 2.2.4 H5N1亚型AIV感染鸡脾脏差异蛋白质组学分析 | 第33-37页 |
| 2.2.5 H5N1亚型AIV感染鸡脾脏转录组分析 | 第37-41页 |
| 2.2.6 实时荧光定量PCR（RT-q PCR）验证 | 第41-42页 |
| 2.2.7 Western blot验证 | 第42-44页 |
| 3 结果 | 第44-76页 |
| 3.1 SPF鸡感染实验 | 第44-50页 |
| 3.1.1 组织病毒含量检测 | 第44-45页 |
| 3.1.2 病理变化分析 | 第45页 |
| 3.1.3 组织免疫学分析 | 第45-50页 |
| 3.2 AIV感染鸡脾脏差异蛋白质组学分析 | 第50-56页 |
| 3.2.1 样品制备 | 第50-51页 |
| 3.2.2 IPG胶条选择 | 第51页 |
| 3.2.3 AIV感染鸡脾脏蛋白差异表达分析 | 第51-52页 |
| 3.2.4 质谱鉴定 | 第52-54页 |
| 3.2.5 差异蛋白GO分析 | 第54-56页 |
| 3.3 AIV感染鸡脾脏转录组分析 | 第56-72页 |
| 3.3.1 RNA样品质控信息 | 第56-57页 |
| 3.3.2 基因组芯片检测 | 第57页 |
| 3.3.3 芯片数据分析 | 第57-58页 |
| 3.3.4 差异基因GO聚类分析 | 第58-64页 |
| 3.3.5 差异基因信号通路分析 | 第64-70页 |
| 3.3.6 2-DE与基因芯片比较分析 | 第70-72页 |
| 3.4 差异基因与蛋白验证 | 第72-76页 |
| 3.4.1 RT-q PCR验证 | 第72-75页 |
| 3.4.2 Western blot验证 | 第75-76页 |
| 4 讨论 | 第76-83页 |
| 4.1 H5N1亚型AIV感染鸡脾脏差异蛋白分析 | 第76-79页 |
| 4.1.1 2-DE条件选择 | 第76页 |
| 4.1.2 脾脏差异蛋白分离与鉴定 | 第76页 |
| 4.1.3 流感病毒抗原的 2-DE检测 | 第76-77页 |
| 4.1.4 其它蛋白的 2-DE检测 | 第77页 |
| 4.1.5 H5N1亚型AIV感染鸡脾脏差异蛋白功能分析 | 第77-79页 |
| 4.2 H5N1亚型AIV感染鸡脾脏差异基因筛选 | 第79-81页 |
| 4.2.1 芯片对流感病毒基因的检测分析 | 第80页 |
| 4.2.2 H5N1亚型AIV感染鸡脾脏差异蛋白功能分析 | 第80页 |
| 4.2.3 2-DE与芯片比较分析 | 第80-81页 |
| 4.3 差异蛋白与基因表达水平验证 | 第81-82页 |
| 4.3.1 RT-q PCR验证 | 第81-82页 |
| 4.3.2 Western blot验证 | 第82页 |
| 4.4 本研究的创新与不足 | 第82-83页 |
| 4.4.1 本研究的创新之处 | 第82页 |
| 4.4.2 本研究的不足之处 | 第82-83页 |
| 5 结论 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-98页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第98页 |
