| 中文摘要 | 第8-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 1 前言 | 第15-35页 |
| 1.1 大豆疫霉病害及控制 | 第15-16页 |
| 1.2 勃利霉素的研究进展 | 第16-19页 |
| 1.2.1 勃利霉素的简介 | 第16-17页 |
| 1.2.2 勃利霉素的生物活性 | 第17-19页 |
| 1.3 苏氨酰tRNA合成酶的研究进展 | 第19-24页 |
| 1.3.1 苏氨酰tRNA合成酶的生物化学鉴定 | 第19-20页 |
| 1.3.2 ThrRS的结构 | 第20-24页 |
| 1.4 分子对接的研究进展 | 第24-29页 |
| 1.4.1 对接理论 | 第25-28页 |
| 1.4.2 对接方法学 | 第28-29页 |
| 1.5 蛋白三维结构预测的研究进展 | 第29-33页 |
| 1.5.1 同源或比较建模 | 第30-31页 |
| 1.5.2 同源建模的使用以鉴别蛋白结构性质,功能和机制 | 第31-32页 |
| 1.5.3 同源建模：先导化合物鉴定中的方法和应用 | 第32-33页 |
| 1.6 研究内容及课题来源 | 第33-35页 |
| 1.6.1 研究目的意义及研究内容 | 第33-34页 |
| 1.6.2 课题来源 | 第34-35页 |
| 2 材料与方法 | 第35-48页 |
| 2.1 试剂与仪器 | 第35-42页 |
| 2.1.1 培养基和各种试剂的配制 | 第35-39页 |
| 2.1.2 菌株和质粒 | 第39-41页 |
| 2.1.3 引物 | 第41页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第41-42页 |
| 2.2 实验方法 | 第42-48页 |
| 2.2.1 EThrRS的异源表达与纯化 | 第42-43页 |
| 2.2.2 EThrRS突变体的异源表达与纯化 | 第43页 |
| 2.2.3 野生型EThrRS与突变体二级结构的比较 | 第43页 |
| 2.2.4 勃利霉素对EThrRS和突变体酶活的体外抑制测定 | 第43-44页 |
| 2.2.5 勃利霉素分别对野生型EThrRS与突变体预稳态动力学的分析 | 第44页 |
| 2.2.6 勃利霉素或ATP与EThrRS的分子对接 | 第44页 |
| 2.2.7 PsThrRS三维结构的同源建模 | 第44-45页 |
| 2.2.8 勃利霉素与PsThrRS结合位点的研究 | 第45-46页 |
| 2.2.9 基于分子对接的PsThrRS抑制剂的虚拟筛选 | 第46页 |
| 2.2.10 PsThrRS抑制剂的药效团的分析 | 第46页 |
| 2.2.11 基于药效团模型的PsThrRS抑制剂的虚拟筛选 | 第46页 |
| 2.2.12 EThrRS与其它物种的ThrRS的多序列比对 | 第46页 |
| 2.2.13 分子动力学模拟 | 第46-48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-79页 |
| 3.1 勃利霉素与EThrRS结合位点的研究 | 第48-65页 |
| 3.1.1 勃利霉素及ATP与EThrRS的分子对接 | 第48-50页 |
| 3.1.2 EThrRS与不同物种ThrRS的多序列比对 | 第50-51页 |
| 3.1.3 EThrRS的克隆与表达 | 第51-57页 |
| 3.1.4 EThrRS与突变体酶动力学参数的比较 | 第57-65页 |
| 3.2 勃利霉素与PsThrRS结合位点的研究 | 第65-70页 |
| 3.2.1 PsThrRS的同源模建 | 第65-68页 |
| 3.2.2 勃利霉素与PsThrRS结合位点的确定 | 第68-70页 |
| 3.3 PsThrRS抑制剂的虚拟筛选 | 第70-79页 |
| 3.3.1 勃利霉素结构类似物的搜索 | 第70页 |
| 3.3.2 PsThrRS筛选位置的确定 | 第70-71页 |
| 3.3.3 勃利霉素结构类似物与PsThrRS的虚拟筛选 | 第71-75页 |
| 3.3.4 PsThrRS抑制剂的药效团模型的建立 | 第75-77页 |
| 3.3.5 利用药效团模型Hypo 1对DrugBank全数据库的快速虚拟筛选 | 第77-79页 |
| 4 讨论 | 第79-85页 |
| 4.1 勃利霉素与EThrRS结合位点的研究 | 第79-80页 |
| 4.2 勃利霉素与PsThrRS结合位点的研究 | 第80-82页 |
| 4.3 PsThrRS抑制剂的虚拟筛选 | 第82-85页 |
| 5 结论 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-100页 |
| 附录：缩略词简表 | 第100-101页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第101页 |
