摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
Abbreviations | 第11-14页 |
CHAPTER I INTRODUCTION | 第14-39页 |
1.1 FLOWERING | 第14-16页 |
1.2 TRANSITION TO FLOWERING | 第16-23页 |
1.2.1 The role of mi RNA156 (mi R156) in transition to flowering | 第19-21页 |
1.2.2 The role of mi RNA172 (mi R172) in transition to flowering | 第21-23页 |
1.3 THE MICRORNAS (MIRNAS) IN FLOWERING TIME | 第23-25页 |
1.3.1 The mi RNA159 (mi R159) family | 第24页 |
1.3.2 The mi RNA319 (mi R319) family | 第24-25页 |
1.3.3 The mi RNA390 (mi R390) family | 第25页 |
1.3.4 The mi RNA399 (mi R399) family | 第25页 |
1.4 PROTEASOMES RELATED FLOWERING TIME | 第25-28页 |
1.4.1 The 26s proteasome | 第26-27页 |
1.4.2 Proteasomal regulation of plant growth | 第27-28页 |
1.5 CHLOROPLAST YCF2 RELATED IN FLOWERING TIME | 第28-30页 |
1.6 THE EARLINESS TRAIT IN BREEDING | 第30-31页 |
1.7 QUANTITATIVE TRAIT LOCUS (QTL) | 第31-32页 |
1.8 CANDIDATE GENES | 第32-33页 |
1.9 QTL GENE CONFIRMATION | 第33页 |
1.10 MOLECULAR MARKER | 第33页 |
1.11 THE NATURE OF QTL VARIATION | 第33-34页 |
1.12 QTL MAPPING | 第34-38页 |
1.12.1 Mut Map method | 第34-35页 |
1.12.2 QTL-seq method | 第35-36页 |
1.12.3 Mut Map+ method | 第36-38页 |
1.13 OBJECTIVES | 第38-39页 |
CHAPTER II QTL-SEQ ANALYSIS OF EARLY FLOWERING IN TOMATO | 第39-63页 |
2.1 MATERIALS AND METHODS | 第39-42页 |
2.1.1 Plant materials and phenotypic evaluation | 第39-40页 |
2.1.2 Genomic DNA extraction | 第40页 |
2.1.3 QTL-seq analysis | 第40-42页 |
2.2 RESULTS | 第42-63页 |
2.2.1 Distribution of early flowering time in F2 population | 第42页 |
2.2.2 Sequencing data evaluation | 第42-46页 |
2.2.3 Sequencing data evaluation of early flowering trait | 第46-47页 |
2.2.4 Alignment analysis of sequencing data | 第47-49页 |
2.2.5 SNP detection and annotation | 第49-51页 |
2.2.6 Region location of the SNPs annotation | 第51-52页 |
2.2.7 Genomic region responsible for the early flowering phenotype | 第52-63页 |
CHAPTER III TRADITIONAL QTL ANALYSIS FOR QTL-SEQ CONFIRMATION | 第63-71页 |
3.1 MATERIALS AND METHODS | 第63-68页 |
3.1.1 Plant materials | 第63页 |
3.1.2 DNA extraction | 第63页 |
3.1.3 Insert or deletion (In Del) markers performance | 第63-68页 |
3.1.4 Quantitative trait loci (QTL) analysis | 第68页 |
3.2 RESULTS | 第68-71页 |
CHAPTER IV GENE EXPRESSION ANALYSIS OF CANDIDATE GENES | 第71-75页 |
4.1 MATERIALS AND METHODS | 第71-73页 |
4.1.1 Plant material | 第71页 |
4.1.2 Total RNA extraction | 第71页 |
4.1.3 Checking the quality of total RNA on agarose gel | 第71页 |
4.1.4 Single-strand c DNA synthesis | 第71-72页 |
4.1.5 RT-q PCR performance | 第72-73页 |
4.2 RESULTS | 第73-75页 |
CHAPTER V THE EXPRESSION OF MIR156 AND MIR172 EARLY AND LATETOMATOES AND F1 PROGENY | 第75-80页 |
5.1 MATERIALS AND METHODS | 第75-78页 |
5.1.1 Plant materials | 第75-76页 |
5.1.2 Total RNA extraction | 第76页 |
5.1.3 Checking the quality of total RNA on agarose gel | 第76页 |
5.1.4 Single-strand c DNA synthesis | 第76页 |
5.1.5 RT-q PCR performance | 第76-78页 |
5.2 RESULTS | 第78-80页 |
5.2.1 General physiology of earliness, lateness and F1 progeny | 第78-79页 |
5.2.2 Measuring of mi R156 and mi R172 expression of P1, P2 and F1 | 第79-80页 |
CHAPTER VI CONCLUSIONS AND DISCUSSION | 第80-87页 |
REFERENCES | 第87-96页 |
ACKNOWLEDGEMENTS | 第96-97页 |
CURRICULUM VITAE | 第97-98页 |